Protein–RNA interactions for Protein: Q60765

Atf3, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-3, mousemouse

Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atf3Q60765 Rnf180-201ENSMUST00000069686 1728 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Atf3Q60765 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Atf3Q60765 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Atf3Q60765 AC126549.2-201ENSMUST00000223997 1976 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Atf3Q60765 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Atf3Q60765 Trp73-201ENSMUST00000097762 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Atf3Q60765 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Atf3Q60765 Tspan32-206ENSMUST00000105925 1376 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Atf3Q60765 Lrp1-202ENSMUST00000118455 2097 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Atf3Q60765 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Atf3Q60765 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Atf3Q60765 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Atf3Q60765 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Atf3Q60765 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Atf3Q60765 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Atf3Q60765 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Atf3Q60765 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Atf3Q60765 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Atf3Q60765 Ociad1-201ENSMUST00000031038 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Atf3Q60765 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Atf3Q60765 Cox4i2-201ENSMUST00000010020 727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Atf3Q60765 Gm8805-201ENSMUST00000117848 313 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Atf3Q60765 Tmem267-202ENSMUST00000176171 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Atf3Q60765 Rsph1-201ENSMUST00000024832 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Atf3Q60765 Fam173b-201ENSMUST00000042702 1164 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Atf3Q60765 Olfr223-201ENSMUST00000061293 1111 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Atf3Q60765 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Atf3Q60765 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Atf3Q60765 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Atf3Q60765 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Atf3Q60765 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Atf3Q60765 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Atf3Q60765 Gm18630-201ENSMUST00000222109 1397 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Atf3Q60765 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Atf3Q60765 Neil1-203ENSMUST00000190245 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Atf3Q60765 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Atf3Q60765 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Atf3Q60765 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Atf3Q60765 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Atf3Q60765 Abhd6-203ENSMUST00000225234 1958 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Atf3Q60765 Neu2-203ENSMUST00000164128 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Atf3Q60765 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Atf3Q60765 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Atf3Q60765 Prmt2-201ENSMUST00000020452 2016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Atf3Q60765 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Atf3Q60765 4931406C07Rik-208ENSMUST00000216955 1750 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Atf3Q60765 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Atf3Q60765 Gm22334-201ENSMUST00000158070 133 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Atf3Q60765 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Atf3Q60765 Anapc16-205ENSMUST00000182912 566 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Atf3Q60765 Calca-204ENSMUST00000205714 416 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Atf3Q60765 Gm45022-201ENSMUST00000208332 545 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Atf3Q60765 Gm18212-201ENSMUST00000211678 889 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Atf3Q60765 Cdc34-208ENSMUST00000219791 799 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Atf3Q60765 Gm29787-201ENSMUST00000222129 849 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Atf3Q60765 Fgl1-201ENSMUST00000034003 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Atf3Q60765 Coq7-202ENSMUST00000098090 1215 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Atf3Q60765 Zfp932-201ENSMUST00000099484 451 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Atf3Q60765 Pde4d-203ENSMUST00000117420 1955 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Atf3Q60765 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Atf3Q60765 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Atf3Q60765 Wfdc1-201ENSMUST00000024107 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Atf3Q60765 Dda1-206ENSMUST00000138892 1738 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Atf3Q60765 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Atf3Q60765 Hipk4-202ENSMUST00000108353 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Atf3Q60765 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Atf3Q60765 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Atf3Q60765 Gm32591-204ENSMUST00000208679 1806 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
Atf3Q60765 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Atf3Q60765 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Atf3Q60765 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Atf3Q60765 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Atf3Q60765 Sntb1-201ENSMUST00000039769 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Atf3Q60765 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Atf3Q60765 Hck-204ENSMUST00000191431 1575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Atf3Q60765 Cln3-203ENSMUST00000098036 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Atf3Q60765 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Atf3Q60765 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Atf3Q60765 Endou-201ENSMUST00000023105 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Atf3Q60765 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Atf3Q60765 Aqp6-201ENSMUST00000023754 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Atf3Q60765 A430005L14Rik-202ENSMUST00000105645 977 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Atf3Q60765 Myl4-202ENSMUST00000106956 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Atf3Q60765 Gstt1-202ENSMUST00000120177 1105 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Atf3Q60765 Timm10b-208ENSMUST00000151193 1083 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Atf3Q60765 Myl4-201ENSMUST00000018800 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Atf3Q60765 Gm43947-201ENSMUST00000203019 959 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Atf3Q60765 Gm19208-201ENSMUST00000213861 912 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Atf3Q60765 Fscn2-201ENSMUST00000026445 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Atf3Q60765 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Atf3Q60765 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Atf3Q60765 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Atf3Q60765 Akt1-205ENSMUST00000128300 1342 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Atf3Q60765 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Atf3Q60765 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Atf3Q60765 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Atf3Q60765 Bad-201ENSMUST00000025910 1451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Atf3Q60765 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Atf3Q60765 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Atf3Q60765 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.4 ms