Protein–RNA interactions for Protein: Q60764

Mkrn3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase makorin-3, mousemouse

Predictions only

Length 544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mkrn3Q60764 Vmn1r8-201ENSMUST00000078186 1213 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Mkrn3Q60764 Esyt1-201ENSMUST00000026427 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Mkrn3Q60764 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Mkrn3Q60764 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Mkrn3Q60764 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Mkrn3Q60764 Gm43796-201ENSMUST00000202853 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Mkrn3Q60764 Gm45740-201ENSMUST00000212103 2003 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Mkrn3Q60764 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Mkrn3Q60764 Sirt2-201ENSMUST00000072965 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Mkrn3Q60764 Cacng3-201ENSMUST00000084615 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Mkrn3Q60764 Rxrg-202ENSMUST00000111380 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Mkrn3Q60764 Gm5763-201ENSMUST00000155951 1530 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Mkrn3Q60764 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Mkrn3Q60764 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Mkrn3Q60764 Eml3-201ENSMUST00000096241 3322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Mkrn3Q60764 Clstn2-202ENSMUST00000162295 4174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Mkrn3Q60764 Folr1-204ENSMUST00000106985 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Mkrn3Q60764 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Mkrn3Q60764 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Mkrn3Q60764 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Mkrn3Q60764 Tssk4-202ENSMUST00000164809 1686 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Mkrn3Q60764 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Mkrn3Q60764 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Mkrn3Q60764 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Mkrn3Q60764 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Mkrn3Q60764 Zfp747-201ENSMUST00000067425 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Mkrn3Q60764 Chp2-201ENSMUST00000033152 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Mkrn3Q60764 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Mkrn3Q60764 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Mkrn3Q60764 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Mkrn3Q60764 Gm4081-201ENSMUST00000195287 1838 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Mkrn3Q60764 Gm4204-201ENSMUST00000110798 1231 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Mkrn3Q60764 Gm14659-201ENSMUST00000117667 843 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Mkrn3Q60764 Snhg17-201ENSMUST00000133449 933 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Mkrn3Q60764 Xrcc2-204ENSMUST00000134972 464 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Mkrn3Q60764 Ube2i-208ENSMUST00000173084 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Mkrn3Q60764 Six3os1-205ENSMUST00000175913 791 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Mkrn3Q60764 Kansl3-206ENSMUST00000187628 336 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Mkrn3Q60764 Ccl2-201ENSMUST00000000193 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Mkrn3Q60764 Tomm20l-201ENSMUST00000021482 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Mkrn3Q60764 CT025535.1-201ENSMUST00000227172 491 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Mkrn3Q60764 AC156016.3-201ENSMUST00000228623 344 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Mkrn3Q60764 Myoz3-201ENSMUST00000056533 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Mkrn3Q60764 Rec114-201ENSMUST00000098674 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Mkrn3Q60764 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Mkrn3Q60764 Grik2-210ENSMUST00000220263 2085 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Mkrn3Q60764 L1td1-204ENSMUST00000173659 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Mkrn3Q60764 Gm14451-201ENSMUST00000121581 1542 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Mkrn3Q60764 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Mkrn3Q60764 Ralgds-202ENSMUST00000100241 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Mkrn3Q60764 Marveld2-203ENSMUST00000168772 1888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Mkrn3Q60764 Ccdc32-201ENSMUST00000036470 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Mkrn3Q60764 Mest-202ENSMUST00000124665 2665 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Mkrn3Q60764 Tlr9-201ENSMUST00000062241 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Mkrn3Q60764 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Mkrn3Q60764 Prok2-202ENSMUST00000032152 1423 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Mkrn3Q60764 Fam155a-201ENSMUST00000110969 3388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Mkrn3Q60764 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Mkrn3Q60764 Adk-201ENSMUST00000045376 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Mkrn3Q60764 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Mkrn3Q60764 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Mkrn3Q60764 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Mkrn3Q60764 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Mkrn3Q60764 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Mkrn3Q60764 Cts3-202ENSMUST00000223815 1367 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Mkrn3Q60764 Krcc1-201ENSMUST00000080949 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Mkrn3Q60764 4731419I09Rik-201ENSMUST00000180791 2820 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Mkrn3Q60764 Gm4875-201ENSMUST00000118257 786 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Mkrn3Q60764 Dancr-202ENSMUST00000120364 575 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Mkrn3Q60764 Gm11724-201ENSMUST00000125577 472 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Mkrn3Q60764 Gm15747-202ENSMUST00000151096 524 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Mkrn3Q60764 Gm15875-201ENSMUST00000152264 273 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Mkrn3Q60764 Gm27838-201ENSMUST00000184829 128 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Mkrn3Q60764 Ilkap-208ENSMUST00000187306 377 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Mkrn3Q60764 Gm39375-201ENSMUST00000217068 1039 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Mkrn3Q60764 Cnpy2-201ENSMUST00000026446 763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Mkrn3Q60764 Mesp1-201ENSMUST00000032760 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Mkrn3Q60764 Olfr684-201ENSMUST00000060893 939 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Mkrn3Q60764 Gm2423-201ENSMUST00000074863 733 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Mkrn3Q60764 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Mkrn3Q60764 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Mkrn3Q60764 Klhl8-203ENSMUST00000112815 2898 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Mkrn3Q60764 Cnih4-203ENSMUST00000111059 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Mkrn3Q60764 Rubcn-204ENSMUST00000119810 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Mkrn3Q60764 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Mkrn3Q60764 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Mkrn3Q60764 Serpinh1-205ENSMUST00000208119 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Mkrn3Q60764 Slc19a2-201ENSMUST00000044021 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Mkrn3Q60764 Pgr-201ENSMUST00000070463 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Mkrn3Q60764 Pgr-202ENSMUST00000098986 3068 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Mkrn3Q60764 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Mkrn3Q60764 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Mkrn3Q60764 Bap1-201ENSMUST00000022458 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Mkrn3Q60764 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Mkrn3Q60764 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Mkrn3Q60764 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Mkrn3Q60764 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Mkrn3Q60764 Wdr5-201ENSMUST00000113952 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Mkrn3Q60764 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Mkrn3Q60764 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.9 ms