Protein–RNA interactions for Protein: Q60520

Sin3a, Paired amphipathic helix protein Sin3a, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,274 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sin3aQ60520 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Sin3aQ60520 Srrm1-202ENSMUST00000084846 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Sin3aQ60520 Ptbp2-201ENSMUST00000029780 3364 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Sin3aQ60520 Tcf3-205ENSMUST00000105341 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Sin3aQ60520 Gan-201ENSMUST00000064488 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Sin3aQ60520 Ero1lb-202ENSMUST00000220811 3341 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Sin3aQ60520 Trnt1-204ENSMUST00000113249 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Sin3aQ60520 Blzf1-202ENSMUST00000086032 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Sin3aQ60520 Pde4a-203ENSMUST00000115458 2962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Sin3aQ60520 Mrgprh-201ENSMUST00000075296 1809 ntAPPRIS P1 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Sin3aQ60520 Pigg-202ENSMUST00000118910 3030 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Sin3aQ60520 Lcn5-202ENSMUST00000100312 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Sin3aQ60520 Ppp1r14d-202ENSMUST00000110820 790 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Sin3aQ60520 Gm6912-201ENSMUST00000117218 544 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Sin3aQ60520 Gm14057-201ENSMUST00000120631 482 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Sin3aQ60520 E130201H02Rik-201ENSMUST00000123576 851 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Sin3aQ60520 Prr29-203ENSMUST00000185986 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Sin3aQ60520 Gm45195-201ENSMUST00000205597 1008 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Sin3aQ60520 Gm9797-201ENSMUST00000052902 613 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Sin3aQ60520 Arrdc5-201ENSMUST00000097303 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Sin3aQ60520 Ccdc58-201ENSMUST00000099937 747 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Sin3aQ60520 Shc4-203ENSMUST00000110480 3671 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Sin3aQ60520 Ripk4-201ENSMUST00000019386 3541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Sin3aQ60520 Hsph1-205ENSMUST00000201452 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Sin3aQ60520 Lrrc56-202ENSMUST00000070458 2502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Sin3aQ60520 Slc6a19os-201ENSMUST00000022049 1532 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Sin3aQ60520 Arhgef1-202ENSMUST00000098683 3375 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Sin3aQ60520 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Sin3aQ60520 Tcirg1-201ENSMUST00000001801 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Sin3aQ60520 Adra1b-201ENSMUST00000067258 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Sin3aQ60520 Fam217a-204ENSMUST00000225242 1811 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Sin3aQ60520 Trim32-202ENSMUST00000107366 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Sin3aQ60520 Mrap2-202ENSMUST00000113149 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Sin3aQ60520 Klhdc3-201ENSMUST00000071841 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Sin3aQ60520 Usp16-202ENSMUST00000119504 2562 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Sin3aQ60520 Cfap157-201ENSMUST00000102813 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Sin3aQ60520 Vamp2-202ENSMUST00000117780 1113 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Sin3aQ60520 Gm40193-201ENSMUST00000209971 237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Sin3aQ60520 Prrg2-207ENSMUST00000210500 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Sin3aQ60520 Gm7730-201ENSMUST00000212486 454 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
Sin3aQ60520 Smc6-208ENSMUST00000218866 3373 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Sin3aQ60520 Zfp664-201ENSMUST00000111417 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Sin3aQ60520 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Sin3aQ60520 Art3-208ENSMUST00000121096 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Sin3aQ60520 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Sin3aQ60520 Dnm1-201ENSMUST00000078352 3246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Sin3aQ60520 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Sin3aQ60520 Myo19-202ENSMUST00000093969 4091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Sin3aQ60520 Nos1ap-202ENSMUST00000160456 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Sin3aQ60520 Dok7-203ENSMUST00000114270 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Sin3aQ60520 Slc25a22-202ENSMUST00000106006 2277 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Sin3aQ60520 Pcgf2-201ENSMUST00000018681 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Sin3aQ60520 Lrfn2-201ENSMUST00000046254 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Sin3aQ60520 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Sin3aQ60520 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Sin3aQ60520 Ercc1-203ENSMUST00000160369 1175 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Sin3aQ60520 B230217C12Rik-204ENSMUST00000170806 1118 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Sin3aQ60520 Ccdc24-209ENSMUST00000171052 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Sin3aQ60520 Ube2i-205ENSMUST00000172587 508 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Sin3aQ60520 AI467606-202ENSMUST00000206102 832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Sin3aQ60520 AC153937.4-201ENSMUST00000218479 661 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Sin3aQ60520 Epo-201ENSMUST00000031723 715 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Sin3aQ60520 Olfr1412-201ENSMUST00000062964 966 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Sin3aQ60520 Mrps21-202ENSMUST00000072587 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Sin3aQ60520 Sipa1-202ENSMUST00000080824 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Sin3aQ60520 Hoxd3-202ENSMUST00000111982 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Sin3aQ60520 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Sin3aQ60520 Gm38037-201ENSMUST00000192600 1624 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Sin3aQ60520 Gtf2a1l-201ENSMUST00000024970 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Sin3aQ60520 Zfp568-203ENSMUST00000148442 4005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Sin3aQ60520 Srrm1-203ENSMUST00000105861 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Sin3aQ60520 9130011E15Rik-201ENSMUST00000045396 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Sin3aQ60520 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Sin3aQ60520 Ablim1-209ENSMUST00000111546 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Sin3aQ60520 Herpud1-205ENSMUST00000161576 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Sin3aQ60520 Sgce-203ENSMUST00000101677 1656 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Sin3aQ60520 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Sin3aQ60520 Cabp7-201ENSMUST00000009219 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Sin3aQ60520 Prkcq-201ENSMUST00000028118 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Sin3aQ60520 Grk6-205ENSMUST00000224653 2976 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Sin3aQ60520 Gale-202ENSMUST00000102541 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Sin3aQ60520 Caprin2-202ENSMUST00000111569 3697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Sin3aQ60520 Specc1-209ENSMUST00000201671 2523 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Sin3aQ60520 AC168058.1-201ENSMUST00000219521 2282 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Sin3aQ60520 Lpcat1-201ENSMUST00000022099 3675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Sin3aQ60520 Cpeb4-201ENSMUST00000020543 2312 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Sin3aQ60520 Stau2-215ENSMUST00000162435 2735 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Sin3aQ60520 Hcrt-202ENSMUST00000107360 509 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Sin3aQ60520 Nudt1-203ENSMUST00000110825 599 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Sin3aQ60520 Rhox2d-201ENSMUST00000115179 685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Sin3aQ60520 Eef1akmt4-201ENSMUST00000115522 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Sin3aQ60520 Ube2j2-206ENSMUST00000118192 922 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Sin3aQ60520 Mrps17-202ENSMUST00000118420 843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Sin3aQ60520 Hoxd8-203ENSMUST00000151380 557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Sin3aQ60520 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Sin3aQ60520 Efcab10-201ENSMUST00000020878 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Sin3aQ60520 Gm17795-201ENSMUST00000214505 757 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Sin3aQ60520 AC099934.3-201ENSMUST00000223192 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Sin3aQ60520 Prss41-201ENSMUST00000024926 1128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Sin3aQ60520 Hist1h2al-201ENSMUST00000091708 339 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.3 ms