Protein–RNA interactions for Protein: Q5XF89

Atp13a3, Probable cation-transporting ATPase 13A3, mousemouse

Predictions only

Length 1,219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp13a3Q5XF89 Hmbs-202ENSMUST00000097558 1534 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Atp13a3Q5XF89 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Atp13a3Q5XF89 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Atp13a3Q5XF89 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Atp13a3Q5XF89 Selenoh-202ENSMUST00000102647 654 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Atp13a3Q5XF89 Lims1-203ENSMUST00000105468 1205 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Atp13a3Q5XF89 Wisp1-202ENSMUST00000118823 708 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Atp13a3Q5XF89 Abhd14a-202ENSMUST00000171678 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Atp13a3Q5XF89 Vhl-ps1-201ENSMUST00000174813 597 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Atp13a3Q5XF89 Gm27847-201ENSMUST00000183711 107 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Atp13a3Q5XF89 Gm27375-201ENSMUST00000183799 107 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Atp13a3Q5XF89 2610306M01Rik-201ENSMUST00000185414 1042 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Atp13a3Q5XF89 Il31-203ENSMUST00000198901 984 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Atp13a3Q5XF89 Gm5149-201ENSMUST00000199768 620 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Atp13a3Q5XF89 Gm42303-201ENSMUST00000209960 1170 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Atp13a3Q5XF89 Nme2-201ENSMUST00000021217 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Atp13a3Q5XF89 Ppil3-201ENSMUST00000081677 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Atp13a3Q5XF89 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Atp13a3Q5XF89 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Atp13a3Q5XF89 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Atp13a3Q5XF89 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Atp13a3Q5XF89 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Atp13a3Q5XF89 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Atp13a3Q5XF89 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Atp13a3Q5XF89 Plxdc1-203ENSMUST00000107565 2439 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Atp13a3Q5XF89 Abcg8-202ENSMUST00000170725 2415 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Atp13a3Q5XF89 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Atp13a3Q5XF89 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Atp13a3Q5XF89 Gm17029-202ENSMUST00000146124 2899 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Atp13a3Q5XF89 E230013L22Rik-201ENSMUST00000180408 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Atp13a3Q5XF89 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Atp13a3Q5XF89 F830212C03Rik-201ENSMUST00000191701 2285 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Atp13a3Q5XF89 0610006L08Rik-201ENSMUST00000205326 1589 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Atp13a3Q5XF89 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Atp13a3Q5XF89 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Atp13a3Q5XF89 Pnpo-202ENSMUST00000107629 681 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Atp13a3Q5XF89 Rpl17-ps5-201ENSMUST00000121001 555 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Atp13a3Q5XF89 Ube4bos1-202ENSMUST00000151896 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Atp13a3Q5XF89 Gm15853-201ENSMUST00000160268 556 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Atp13a3Q5XF89 Synj2bp-205ENSMUST00000169158 691 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Atp13a3Q5XF89 Gm24196-201ENSMUST00000179161 110 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Atp13a3Q5XF89 C430014B12Rik-201ENSMUST00000181720 1001 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Atp13a3Q5XF89 Gm44170-201ENSMUST00000203181 549 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Atp13a3Q5XF89 Gm45505-201ENSMUST00000210252 948 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Atp13a3Q5XF89 Gm867-202ENSMUST00000219979 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Atp13a3Q5XF89 Gm18473-201ENSMUST00000220543 868 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Atp13a3Q5XF89 Gm17330-201ENSMUST00000221047 165 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Atp13a3Q5XF89 Cfc1-201ENSMUST00000027298 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Atp13a3Q5XF89 Fau-201ENSMUST00000043074 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Atp13a3Q5XF89 Atpif1-201ENSMUST00000067496 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Atp13a3Q5XF89 Tmem107-201ENSMUST00000075980 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Atp13a3Q5XF89 Gm10570-201ENSMUST00000097865 513 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Atp13a3Q5XF89 Ifi47-204ENSMUST00000213728 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Atp13a3Q5XF89 Creld2-201ENSMUST00000024042 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Atp13a3Q5XF89 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Atp13a3Q5XF89 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Atp13a3Q5XF89 AC131068.2-201ENSMUST00000226175 1453 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Atp13a3Q5XF89 Oprm1-214ENSMUST00000105605 1503 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Atp13a3Q5XF89 Acy1-201ENSMUST00000024031 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Atp13a3Q5XF89 Oprm1-201ENSMUST00000000783 1500 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Atp13a3Q5XF89 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Atp13a3Q5XF89 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Atp13a3Q5XF89 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Atp13a3Q5XF89 Zfp354c-201ENSMUST00000000632 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Atp13a3Q5XF89 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Atp13a3Q5XF89 Gm26747-201ENSMUST00000180597 1716 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Atp13a3Q5XF89 Syvn1-201ENSMUST00000025723 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Atp13a3Q5XF89 Fam53b-205ENSMUST00000106166 1270 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Atp13a3Q5XF89 Gm15770-201ENSMUST00000117498 584 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Atp13a3Q5XF89 Gm13834-201ENSMUST00000123757 137 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Atp13a3Q5XF89 1700092C10Rik-201ENSMUST00000172547 585 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Atp13a3Q5XF89 Gm20652-201ENSMUST00000177314 383 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Atp13a3Q5XF89 Gm29608-201ENSMUST00000190444 463 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Atp13a3Q5XF89 Gm37753-201ENSMUST00000192178 439 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Atp13a3Q5XF89 Psmc3ip-201ENSMUST00000019447 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Atp13a3Q5XF89 Gm17870-201ENSMUST00000219489 1174 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Atp13a3Q5XF89 AC166349.1-201ENSMUST00000220866 695 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Atp13a3Q5XF89 Gm8598-201ENSMUST00000221184 836 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Atp13a3Q5XF89 Rps21-201ENSMUST00000059080 394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Atp13a3Q5XF89 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Atp13a3Q5XF89 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Atp13a3Q5XF89 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Atp13a3Q5XF89 Nap1l1-203ENSMUST00000217908 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Atp13a3Q5XF89 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Atp13a3Q5XF89 Haus7-201ENSMUST00000033737 1380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Atp13a3Q5XF89 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Atp13a3Q5XF89 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Atp13a3Q5XF89 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Atp13a3Q5XF89 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Atp13a3Q5XF89 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Atp13a3Q5XF89 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Atp13a3Q5XF89 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Atp13a3Q5XF89 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Atp13a3Q5XF89 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Atp13a3Q5XF89 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Atp13a3Q5XF89 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Atp13a3Q5XF89 Trpc7-206ENSMUST00000173513 2241 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Atp13a3Q5XF89 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Atp13a3Q5XF89 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Atp13a3Q5XF89 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 78.5 ms