Protein–RNA interactions for Protein: Q5SV85

Synrg, Synergin gamma, mousemouse

Predictions only

Length 1,306 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SynrgQ5SV85 E2f3-203ENSMUST00000221536 4597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SynrgQ5SV85 E2f3-204ENSMUST00000222730 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SynrgQ5SV85 Hipk4-202ENSMUST00000108353 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SynrgQ5SV85 Gm12020-201ENSMUST00000119030 2042 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
SynrgQ5SV85 Ywhag-205ENSMUST00000198270 1610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SynrgQ5SV85 Camk2b-203ENSMUST00000066431 1603 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SynrgQ5SV85 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SynrgQ5SV85 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SynrgQ5SV85 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SynrgQ5SV85 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SynrgQ5SV85 Casp7-201ENSMUST00000026062 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SynrgQ5SV85 Arl5c-202ENSMUST00000107563 823 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SynrgQ5SV85 Arpc3-203ENSMUST00000111713 708 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SynrgQ5SV85 Gm6152-201ENSMUST00000151704 340 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
SynrgQ5SV85 Abhd14a-202ENSMUST00000171678 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SynrgQ5SV85 Gm29608-201ENSMUST00000190444 463 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
SynrgQ5SV85 Dera-204ENSMUST00000203216 688 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SynrgQ5SV85 Reep1-202ENSMUST00000212631 953 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SynrgQ5SV85 AC131777.1-201ENSMUST00000214749 387 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SynrgQ5SV85 Gm18934-201ENSMUST00000216671 1044 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
SynrgQ5SV85 1700127F24Rik-201ENSMUST00000221685 604 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
SynrgQ5SV85 Taldo1-201ENSMUST00000026576 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SynrgQ5SV85 Rpl10l-201ENSMUST00000081908 1023 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SynrgQ5SV85 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SynrgQ5SV85 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SynrgQ5SV85 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SynrgQ5SV85 4931428F04Rik-203ENSMUST00000212219 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SynrgQ5SV85 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SynrgQ5SV85 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SynrgQ5SV85 Pnkd-201ENSMUST00000027370 2937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SynrgQ5SV85 Ablim2-203ENSMUST00000114203 1333 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SynrgQ5SV85 Gm26878-201ENSMUST00000181778 1644 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SynrgQ5SV85 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SynrgQ5SV85 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SynrgQ5SV85 Gnao1-203ENSMUST00000125716 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SynrgQ5SV85 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
SynrgQ5SV85 Oprm1-214ENSMUST00000105605 1503 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SynrgQ5SV85 C130050O18Rik-201ENSMUST00000052176 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SynrgQ5SV85 Uqcrq-201ENSMUST00000061326 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SynrgQ5SV85 Oprm1-201ENSMUST00000000783 1500 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SynrgQ5SV85 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SynrgQ5SV85 Efemp1-201ENSMUST00000020759 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SynrgQ5SV85 Gm26747-201ENSMUST00000180597 1716 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SynrgQ5SV85 Ociad2-205ENSMUST00000201908 2378 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SynrgQ5SV85 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SynrgQ5SV85 Fzr1-202ENSMUST00000118812 1215 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SynrgQ5SV85 Rpl17-ps5-201ENSMUST00000121001 555 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
SynrgQ5SV85 1600014C10Rik-203ENSMUST00000177983 403 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SynrgQ5SV85 Proscos-202ENSMUST00000178990 666 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
SynrgQ5SV85 C330013E15Rik-201ENSMUST00000181034 878 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SynrgQ5SV85 Psmc3ip-201ENSMUST00000019447 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SynrgQ5SV85 AC073947.2-201ENSMUST00000215888 1130 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
SynrgQ5SV85 CU024892.2-201ENSMUST00000224608 832 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
SynrgQ5SV85 AC154276.1-201ENSMUST00000228874 1299 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
SynrgQ5SV85 Mrps22-201ENSMUST00000035034 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SynrgQ5SV85 Olfr54-201ENSMUST00000072152 942 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SynrgQ5SV85 Olfr1375-201ENSMUST00000073543 942 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SynrgQ5SV85 Hnrnpa1-201ENSMUST00000036004 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SynrgQ5SV85 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SynrgQ5SV85 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SynrgQ5SV85 Oprm1-202ENSMUST00000052751 1334 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SynrgQ5SV85 Oprm1-207ENSMUST00000092731 1332 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SynrgQ5SV85 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SynrgQ5SV85 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SynrgQ5SV85 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SynrgQ5SV85 2900005J15Rik-202ENSMUST00000171190 2025 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
SynrgQ5SV85 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SynrgQ5SV85 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SynrgQ5SV85 Enpp1-203ENSMUST00000135846 2721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SynrgQ5SV85 Aldh3b1-201ENSMUST00000051803 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SynrgQ5SV85 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SynrgQ5SV85 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SynrgQ5SV85 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SynrgQ5SV85 Pltp-203ENSMUST00000109317 1575 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SynrgQ5SV85 Kcnj9-202ENSMUST00000194204 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SynrgQ5SV85 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SynrgQ5SV85 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SynrgQ5SV85 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SynrgQ5SV85 P4hb-201ENSMUST00000026122 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SynrgQ5SV85 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SynrgQ5SV85 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SynrgQ5SV85 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SynrgQ5SV85 Gm15869-201ENSMUST00000126427 734 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SynrgQ5SV85 Sbk3-201ENSMUST00000133272 1086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SynrgQ5SV85 4930407G08Rik-201ENSMUST00000145831 698 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SynrgQ5SV85 Gm2639-201ENSMUST00000156881 1297 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
SynrgQ5SV85 AC131997.1-201ENSMUST00000228611 1229 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
SynrgQ5SV85 Exosc7-201ENSMUST00000026891 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SynrgQ5SV85 Tomm7-201ENSMUST00000030851 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SynrgQ5SV85 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SynrgQ5SV85 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SynrgQ5SV85 Osbpl9-202ENSMUST00000084366 3134 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SynrgQ5SV85 Gm5779-202ENSMUST00000219564 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SynrgQ5SV85 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SynrgQ5SV85 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SynrgQ5SV85 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SynrgQ5SV85 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SynrgQ5SV85 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SynrgQ5SV85 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SynrgQ5SV85 Pcgf2-201ENSMUST00000018681 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.2 ms