Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSN7

Sft2d1, Vesicle transport protein SFT2A, mousemouse

Predictions only

Length 159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sft2d1Q5SSN7 Bpi-203ENSMUST00000109500 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Sft2d1Q5SSN7 Itga2b-201ENSMUST00000103086 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Sft2d1Q5SSN7 Evc2-201ENSMUST00000056365 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Sft2d1Q5SSN7 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Sft2d1Q5SSN7 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Sft2d1Q5SSN7 Pcdhac1-201ENSMUST00000007584 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Sft2d1Q5SSN7 Draxin-201ENSMUST00000030862 5200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Sft2d1Q5SSN7 Chst15-201ENSMUST00000077472 5041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Sft2d1Q5SSN7 4931409K22Rik-201ENSMUST00000088302 2613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Sft2d1Q5SSN7 AC126549.2-201ENSMUST00000223997 1976 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Sft2d1Q5SSN7 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Sft2d1Q5SSN7 Tmc6-201ENSMUST00000026659 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Sft2d1Q5SSN7 Sltm-206ENSMUST00000216816 3755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Sft2d1Q5SSN7 Sbsn-201ENSMUST00000080518 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Sft2d1Q5SSN7 Ugt1a5-201ENSMUST00000097659 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Sft2d1Q5SSN7 Ssh1-202ENSMUST00000112298 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Sft2d1Q5SSN7 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Sft2d1Q5SSN7 Tln1-201ENSMUST00000030187 8393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Sft2d1Q5SSN7 Fancc-202ENSMUST00000099444 2288 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Sft2d1Q5SSN7 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Sft2d1Q5SSN7 Calu-206ENSMUST00000172974 3063 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.6
Sft2d1Q5SSN7 Nob1-201ENSMUST00000003946 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Sft2d1Q5SSN7 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Sft2d1Q5SSN7 Gm29052-201ENSMUST00000187700 1451 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.6
Sft2d1Q5SSN7 Dda1-206ENSMUST00000138892 1738 ntTSL 3 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Sft2d1Q5SSN7 Trp73-201ENSMUST00000097762 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Sft2d1Q5SSN7 Pde8b-207ENSMUST00000162153 2474 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Sft2d1Q5SSN7 Alx1-201ENSMUST00000040859 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Sft2d1Q5SSN7 Kifc1-201ENSMUST00000114361 2260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Sft2d1Q5SSN7 Slitrk5-201ENSMUST00000042767 4831 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Sft2d1Q5SSN7 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Sft2d1Q5SSN7 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Sft2d1Q5SSN7 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Sft2d1Q5SSN7 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Sft2d1Q5SSN7 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Sft2d1Q5SSN7 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Sft2d1Q5SSN7 Pbx2-205ENSMUST00000183827 1186 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Sft2d1Q5SSN7 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Sft2d1Q5SSN7 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Sft2d1Q5SSN7 Lyzl6-201ENSMUST00000021328 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Sft2d1Q5SSN7 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Sft2d1Q5SSN7 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Sft2d1Q5SSN7 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Sft2d1Q5SSN7 Obp2a-201ENSMUST00000077667 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Sft2d1Q5SSN7 Trim68-205ENSMUST00000210855 2301 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Sft2d1Q5SSN7 Pex5-205ENSMUST00000112532 3148 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Sft2d1Q5SSN7 Fbln1-201ENSMUST00000057410 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Sft2d1Q5SSN7 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Sft2d1Q5SSN7 Tnip1-204ENSMUST00000108885 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Sft2d1Q5SSN7 Rufy2-203ENSMUST00000122231 2664 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Sft2d1Q5SSN7 Psen1-201ENSMUST00000041806 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Sft2d1Q5SSN7 Aldh3b1-201ENSMUST00000051803 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Sft2d1Q5SSN7 Tfe3-203ENSMUST00000101695 2989 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Sft2d1Q5SSN7 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Sft2d1Q5SSN7 Ttc25-202ENSMUST00000092684 2240 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Sft2d1Q5SSN7 Tssk4-202ENSMUST00000164809 1686 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Sft2d1Q5SSN7 Scube1-203ENSMUST00000076060 3913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Sft2d1Q5SSN7 Ctsa-203ENSMUST00000103093 2534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Sft2d1Q5SSN7 E2f3-201ENSMUST00000102948 5097 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Sft2d1Q5SSN7 Dgcr14-201ENSMUST00000003621 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Sft2d1Q5SSN7 Rsbn1l-202ENSMUST00000196780 7651 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Sft2d1Q5SSN7 Rtn4-203ENSMUST00000102841 4060 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Sft2d1Q5SSN7 Pou4f2-201ENSMUST00000034115 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Sft2d1Q5SSN7 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Sft2d1Q5SSN7 Calcr-203ENSMUST00000168592 2064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Sft2d1Q5SSN7 Foxb1-201ENSMUST00000071281 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Sft2d1Q5SSN7 Gne-209ENSMUST00000173234 2149 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Sft2d1Q5SSN7 Fbxo48-201ENSMUST00000061327 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Sft2d1Q5SSN7 Gm28386-201ENSMUST00000189147 1849 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Sft2d1Q5SSN7 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Sft2d1Q5SSN7 Rgs6-222ENSMUST00000202210 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Sft2d1Q5SSN7 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Sft2d1Q5SSN7 Pus7-201ENSMUST00000119946 3407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Sft2d1Q5SSN7 Rps6ka4-202ENSMUST00000170516 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Sft2d1Q5SSN7 Rps6ka4-201ENSMUST00000025903 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Sft2d1Q5SSN7 Parp2-201ENSMUST00000036126 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Sft2d1Q5SSN7 Myo1d-202ENSMUST00000070997 3106 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Sft2d1Q5SSN7 Srsf5-205ENSMUST00000110356 1568 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Sft2d1Q5SSN7 Ptpn9-201ENSMUST00000034832 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Sft2d1Q5SSN7 Tmem132e-202ENSMUST00000092852 4105 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Sft2d1Q5SSN7 Sipa1l2-204ENSMUST00000212987 6690 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Sft2d1Q5SSN7 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Sft2d1Q5SSN7 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Sft2d1Q5SSN7 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Sft2d1Q5SSN7 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Sft2d1Q5SSN7 Mir124-2hg-206ENSMUST00000189754 525 ntTSL 3 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Sft2d1Q5SSN7 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Sft2d1Q5SSN7 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Sft2d1Q5SSN7 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Sft2d1Q5SSN7 Nectin4-202ENSMUST00000094325 3245 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Sft2d1Q5SSN7 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Sft2d1Q5SSN7 Vipr1-201ENSMUST00000035115 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Sft2d1Q5SSN7 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Sft2d1Q5SSN7 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Sft2d1Q5SSN7 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Sft2d1Q5SSN7 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Sft2d1Q5SSN7 Tle6-201ENSMUST00000072020 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Sft2d1Q5SSN7 Gstcd-202ENSMUST00000080583 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Sft2d1Q5SSN7 Spin1-201ENSMUST00000095797 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Sft2d1Q5SSN7 Irf1-203ENSMUST00000108922 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 131.2 ms