Protein–RNA interactions for Protein: Q5NCC3

Trim41, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM41, mousemouse

Predictions only

Length 630 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim41Q5NCC3 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Trim41Q5NCC3 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Trim41Q5NCC3 Gnas-210ENSMUST00000109095 2059 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Trim41Q5NCC3 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Trim41Q5NCC3 Rasl12-202ENSMUST00000165682 1903 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Trim41Q5NCC3 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Trim41Q5NCC3 Zmynd15-202ENSMUST00000092958 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Trim41Q5NCC3 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Trim41Q5NCC3 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Trim41Q5NCC3 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Trim41Q5NCC3 Zfp157-203ENSMUST00000110912 886 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Trim41Q5NCC3 Gng12-205ENSMUST00000114226 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Trim41Q5NCC3 6330418K02Rik-201ENSMUST00000124298 743 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Trim41Q5NCC3 Gm12347-201ENSMUST00000127883 470 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Trim41Q5NCC3 Sox2ot-207ENSMUST00000196987 727 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Trim41Q5NCC3 Gm6334-201ENSMUST00000207083 228 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
Trim41Q5NCC3 Gm9445-201ENSMUST00000207454 1285 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
Trim41Q5NCC3 Olfr222-201ENSMUST00000071943 1115 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Trim41Q5NCC3 Tldc2-201ENSMUST00000099140 608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Trim41Q5NCC3 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Trim41Q5NCC3 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Trim41Q5NCC3 Haus8-202ENSMUST00000110071 1452 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Trim41Q5NCC3 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Trim41Q5NCC3 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Trim41Q5NCC3 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Trim41Q5NCC3 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Trim41Q5NCC3 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Trim41Q5NCC3 Gm26576-201ENSMUST00000181018 1977 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Trim41Q5NCC3 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Trim41Q5NCC3 Etfdh-201ENSMUST00000029386 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Trim41Q5NCC3 Mff-201ENSMUST00000073025 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Trim41Q5NCC3 Ptges3l-203ENSMUST00000107252 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Trim41Q5NCC3 Gm12201-201ENSMUST00000120657 1234 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
Trim41Q5NCC3 St6galnac6-209ENSMUST00000131229 1013 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Trim41Q5NCC3 Ptgr2-205ENSMUST00000135001 1286 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Trim41Q5NCC3 Pbx2-205ENSMUST00000183827 1186 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Trim41Q5NCC3 Tcf4-258ENSMUST00000202937 2103 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Trim41Q5NCC3 Ndufb4-201ENSMUST00000023514 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Trim41Q5NCC3 Gm16534-201ENSMUST00000149300 1492 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Trim41Q5NCC3 Bad-201ENSMUST00000025910 1451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Trim41Q5NCC3 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Trim41Q5NCC3 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Trim41Q5NCC3 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Trim41Q5NCC3 Pias3-203ENSMUST00000107077 2695 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Trim41Q5NCC3 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Trim41Q5NCC3 Gm12280-201ENSMUST00000155836 1624 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Trim41Q5NCC3 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Trim41Q5NCC3 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Trim41Q5NCC3 Tagap1-201ENSMUST00000063683 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Trim41Q5NCC3 F10-204ENSMUST00000128418 1395 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Trim41Q5NCC3 Gm16168-201ENSMUST00000161091 1359 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Trim41Q5NCC3 Fermt2-201ENSMUST00000045905 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Trim41Q5NCC3 Gpc5-201ENSMUST00000022707 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Trim41Q5NCC3 Rbmx2-201ENSMUST00000033433 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Trim41Q5NCC3 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Trim41Q5NCC3 Syngr2-201ENSMUST00000026649 1520 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Trim41Q5NCC3 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Trim41Q5NCC3 Tmem219-202ENSMUST00000119781 1118 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Trim41Q5NCC3 Gm43818-201ENSMUST00000200605 466 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
Trim41Q5NCC3 9230020A06Rik-204ENSMUST00000215201 1116 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Trim41Q5NCC3 Rpl10l-201ENSMUST00000081908 1023 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Trim41Q5NCC3 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Trim41Q5NCC3 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Trim41Q5NCC3 Tmem38b-201ENSMUST00000030127 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Trim41Q5NCC3 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Trim41Q5NCC3 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Trim41Q5NCC3 Gm44207-201ENSMUST00000204568 1424 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
Trim41Q5NCC3 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Trim41Q5NCC3 Gm14455-201ENSMUST00000138288 2146 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Trim41Q5NCC3 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Trim41Q5NCC3 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Trim41Q5NCC3 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Trim41Q5NCC3 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Trim41Q5NCC3 Nop58-201ENSMUST00000027174 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Trim41Q5NCC3 Klk6-203ENSMUST00000107968 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Trim41Q5NCC3 Creld2-201ENSMUST00000024042 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Trim41Q5NCC3 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Trim41Q5NCC3 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Trim41Q5NCC3 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Trim41Q5NCC3 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.42
Trim41Q5NCC3 Gm38102-201ENSMUST00000192791 1935 ntBASIC23.89■■□□□ 1.42
Trim41Q5NCC3 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Trim41Q5NCC3 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Trim41Q5NCC3 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Trim41Q5NCC3 Lims1-203ENSMUST00000105468 1205 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Trim41Q5NCC3 Serf1-203ENSMUST00000132053 516 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Trim41Q5NCC3 Gm12349-201ENSMUST00000153030 657 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Trim41Q5NCC3 Gm2639-201ENSMUST00000156881 1297 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
Trim41Q5NCC3 Gm8584-201ENSMUST00000171982 758 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
Trim41Q5NCC3 Erg28-201ENSMUST00000021676 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Trim41Q5NCC3 Lrmda-201ENSMUST00000075639 908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Trim41Q5NCC3 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Trim41Q5NCC3 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Trim41Q5NCC3 Aip-202ENSMUST00000117831 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Trim41Q5NCC3 Morn1-201ENSMUST00000030915 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Trim41Q5NCC3 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Trim41Q5NCC3 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Trim41Q5NCC3 Gpr12-203ENSMUST00000197431 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Trim41Q5NCC3 Tmem86b-202ENSMUST00000205360 1344 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Trim41Q5NCC3 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 97.7 ms