Protein–RNA interactions for Protein: Q58FA4

E2f8, Transcription factor E2F8, mousemouse

Predictions only

Length 860 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2f8Q58FA4 N4bp3-201ENSMUST00000001080 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
E2f8Q58FA4 Wisp3-201ENSMUST00000076713 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
E2f8Q58FA4 Zic4-209ENSMUST00000173933 1764 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
E2f8Q58FA4 Slc9a3-201ENSMUST00000036208 2490 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
E2f8Q58FA4 E230013L22Rik-201ENSMUST00000180408 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
E2f8Q58FA4 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
E2f8Q58FA4 Rufy3-203ENSMUST00000196894 3703 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
E2f8Q58FA4 Gm15948-201ENSMUST00000150616 403 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
E2f8Q58FA4 1600025M17Rik-202ENSMUST00000151426 547 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
E2f8Q58FA4 Arf5-202ENSMUST00000169841 768 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
E2f8Q58FA4 Gm26830-201ENSMUST00000180389 993 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
E2f8Q58FA4 Selenoh-205ENSMUST00000189636 499 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
E2f8Q58FA4 Gm19220-201ENSMUST00000222682 803 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
E2f8Q58FA4 Taf11-201ENSMUST00000025057 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
E2f8Q58FA4 Uqcr10-201ENSMUST00000058407 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
E2f8Q58FA4 Fthl17c-201ENSMUST00000075792 850 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
E2f8Q58FA4 Wdr83-201ENSMUST00000093357 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
E2f8Q58FA4 Tlk2-209ENSMUST00000145048 2776 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
E2f8Q58FA4 Skida1-202ENSMUST00000091420 4376 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
E2f8Q58FA4 Tspan12-202ENSMUST00000120965 2157 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
E2f8Q58FA4 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
E2f8Q58FA4 Arid3a-202ENSMUST00000105376 4892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
E2f8Q58FA4 Gm8337-201ENSMUST00000187358 1938 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
E2f8Q58FA4 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
E2f8Q58FA4 Tm9sf1-201ENSMUST00000002391 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
E2f8Q58FA4 Nsd3-211ENSMUST00000155861 2834 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
E2f8Q58FA4 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
E2f8Q58FA4 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
E2f8Q58FA4 Ankrd6-204ENSMUST00000084750 4444 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
E2f8Q58FA4 Tdrd6-203ENSMUST00000168073 7062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
E2f8Q58FA4 Grm5-204ENSMUST00000155358 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
E2f8Q58FA4 Gm13859-201ENSMUST00000119936 1423 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
E2f8Q58FA4 Cnmd-201ENSMUST00000022603 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
E2f8Q58FA4 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
E2f8Q58FA4 Alkbh3os1-201ENSMUST00000028621 1549 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
E2f8Q58FA4 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
E2f8Q58FA4 Nop9-201ENSMUST00000019441 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
E2f8Q58FA4 Tle3-201ENSMUST00000034820 4646 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
E2f8Q58FA4 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
E2f8Q58FA4 Slc5a6-202ENSMUST00000114668 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
E2f8Q58FA4 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
E2f8Q58FA4 Tmem128-202ENSMUST00000119047 726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
E2f8Q58FA4 Gm15222-201ENSMUST00000127359 344 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
E2f8Q58FA4 Mecp2-204ENSMUST00000140399 1168 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
E2f8Q58FA4 Gnb2-209ENSMUST00000143495 1285 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
E2f8Q58FA4 Gm27772-201ENSMUST00000184900 187 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
E2f8Q58FA4 Gm37917-201ENSMUST00000194711 392 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
E2f8Q58FA4 AC099934.3-201ENSMUST00000223192 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
E2f8Q58FA4 Ccdc58-201ENSMUST00000099937 747 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
E2f8Q58FA4 Mindy3-201ENSMUST00000028105 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
E2f8Q58FA4 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
E2f8Q58FA4 Bpifa6-201ENSMUST00000109753 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
E2f8Q58FA4 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
E2f8Q58FA4 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
E2f8Q58FA4 Gm43056-201ENSMUST00000197865 2791 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
E2f8Q58FA4 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
E2f8Q58FA4 Ski-202ENSMUST00000084103 5309 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
E2f8Q58FA4 Gm37015-201ENSMUST00000192763 1521 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
E2f8Q58FA4 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
E2f8Q58FA4 Tesmin-202ENSMUST00000127142 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
E2f8Q58FA4 Hadhb-201ENSMUST00000026841 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
E2f8Q58FA4 Tmem19-203ENSMUST00000217884 2799 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
E2f8Q58FA4 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
E2f8Q58FA4 Dmkn-205ENSMUST00000165887 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
E2f8Q58FA4 Higd1a-205ENSMUST00000215007 1980 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
E2f8Q58FA4 Cyp2ab1-205ENSMUST00000182741 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
E2f8Q58FA4 Tmem176b-201ENSMUST00000101429 1238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
E2f8Q58FA4 1700121C08Rik-201ENSMUST00000137546 677 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
E2f8Q58FA4 Lamtor3-201ENSMUST00000168345 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
E2f8Q58FA4 H2-Pa-201ENSMUST00000182803 626 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
E2f8Q58FA4 2410004P03Rik-203ENSMUST00000190691 953 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
E2f8Q58FA4 Ip6k2-210ENSMUST00000194875 748 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
E2f8Q58FA4 Gm15411-202ENSMUST00000201913 668 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
E2f8Q58FA4 Lcmt1-204ENSMUST00000206574 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
E2f8Q58FA4 Olfr1214-201ENSMUST00000099804 936 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
E2f8Q58FA4 Ric8b-202ENSMUST00000095385 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
E2f8Q58FA4 Scg2-201ENSMUST00000049972 2515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
E2f8Q58FA4 Kctd14-206ENSMUST00000206658 2339 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
E2f8Q58FA4 Ecm1-202ENSMUST00000117507 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
E2f8Q58FA4 Gm29358-201ENSMUST00000186510 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
E2f8Q58FA4 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
E2f8Q58FA4 Lsm14b-202ENSMUST00000058764 2566 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
E2f8Q58FA4 4930473A02Rik-202ENSMUST00000136793 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
E2f8Q58FA4 Kyat1-205ENSMUST00000113662 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
E2f8Q58FA4 AI480526-202ENSMUST00000159637 1697 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
E2f8Q58FA4 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
E2f8Q58FA4 Racgap1-201ENSMUST00000023756 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
E2f8Q58FA4 Pax5-213ENSMUST00000173821 996 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
E2f8Q58FA4 Gm26600-201ENSMUST00000181637 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
E2f8Q58FA4 4930592C13Rik-201ENSMUST00000196791 661 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
E2f8Q58FA4 Gm35549-203ENSMUST00000204619 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
E2f8Q58FA4 Gm18624-201ENSMUST00000220966 658 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
E2f8Q58FA4 Clps-201ENSMUST00000025062 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
E2f8Q58FA4 Lrrc10-201ENSMUST00000073834 1428 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
E2f8Q58FA4 Ociad2-201ENSMUST00000087195 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
E2f8Q58FA4 Pcgf2-201ENSMUST00000018681 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
E2f8Q58FA4 4933430H06Rik-201ENSMUST00000200924 1343 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
E2f8Q58FA4 Stk16-201ENSMUST00000027401 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
E2f8Q58FA4 Degs2-202ENSMUST00000167978 1729 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
E2f8Q58FA4 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.2 ms