Protein–RNA interactions for Protein: Q4VBF2

R3hdm4, R3H domain-containing protein 4, mousemouse

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Length 262 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
R3hdm4Q4VBF2 Slc26a4-201ENSMUST00000001253 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
R3hdm4Q4VBF2 Cep126-201ENSMUST00000037397 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
R3hdm4Q4VBF2 Orai2-201ENSMUST00000041048 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
R3hdm4Q4VBF2 Prkacb-202ENSMUST00000102515 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
R3hdm4Q4VBF2 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
R3hdm4Q4VBF2 Plekhb1-201ENSMUST00000079176 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
R3hdm4Q4VBF2 Ap2m1-201ENSMUST00000007216 2937 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
R3hdm4Q4VBF2 Hp1bp3-204ENSMUST00000105826 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
R3hdm4Q4VBF2 Abr-205ENSMUST00000108408 3534 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
R3hdm4Q4VBF2 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
R3hdm4Q4VBF2 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
R3hdm4Q4VBF2 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
R3hdm4Q4VBF2 Rtn3-203ENSMUST00000088169 1709 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
R3hdm4Q4VBF2 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
R3hdm4Q4VBF2 Mpp4-210ENSMUST00000191200 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
R3hdm4Q4VBF2 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
R3hdm4Q4VBF2 4732463B04Rik-201ENSMUST00000180751 2932 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
R3hdm4Q4VBF2 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
R3hdm4Q4VBF2 Tmem176b-201ENSMUST00000101429 1238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
R3hdm4Q4VBF2 Cd99l2-204ENSMUST00000114587 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
R3hdm4Q4VBF2 Gm26830-201ENSMUST00000180389 993 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
R3hdm4Q4VBF2 Gm5279-201ENSMUST00000199575 745 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
R3hdm4Q4VBF2 Gm29682-201ENSMUST00000210896 1251 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
R3hdm4Q4VBF2 Cldn13-201ENSMUST00000008987 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
R3hdm4Q4VBF2 Rwdd2a-201ENSMUST00000034988 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
R3hdm4Q4VBF2 Msantd3-201ENSMUST00000061135 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
R3hdm4Q4VBF2 Wrap53-201ENSMUST00000048139 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
R3hdm4Q4VBF2 Nxpe5-202ENSMUST00000159798 2568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
R3hdm4Q4VBF2 Tmc8-201ENSMUST00000050874 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
R3hdm4Q4VBF2 Btrc-201ENSMUST00000065601 2978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
R3hdm4Q4VBF2 Diaph1-202ENSMUST00000080033 4378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
R3hdm4Q4VBF2 Mcoln2-201ENSMUST00000011152 2520 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
R3hdm4Q4VBF2 Lysmd3-201ENSMUST00000049055 2338 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
R3hdm4Q4VBF2 Trpc7-206ENSMUST00000173513 2241 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
R3hdm4Q4VBF2 Spns1-201ENSMUST00000032994 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
R3hdm4Q4VBF2 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
R3hdm4Q4VBF2 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
R3hdm4Q4VBF2 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
R3hdm4Q4VBF2 Adgrb2-206ENSMUST00000106018 4470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
R3hdm4Q4VBF2 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
R3hdm4Q4VBF2 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
R3hdm4Q4VBF2 Slc6a4-202ENSMUST00000108402 2796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
R3hdm4Q4VBF2 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
R3hdm4Q4VBF2 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
R3hdm4Q4VBF2 Decr2-201ENSMUST00000040907 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
R3hdm4Q4VBF2 Rnpepl1-201ENSMUST00000027487 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
R3hdm4Q4VBF2 Dnajb12-205ENSMUST00000147914 3041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
R3hdm4Q4VBF2 Zic4-209ENSMUST00000173933 1764 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
R3hdm4Q4VBF2 Zbtb45-202ENSMUST00000172240 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
R3hdm4Q4VBF2 Grk4-201ENSMUST00000001112 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
R3hdm4Q4VBF2 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
R3hdm4Q4VBF2 Olfr533-203ENSMUST00000215308 2345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
R3hdm4Q4VBF2 Pmvk-202ENSMUST00000107410 652 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
R3hdm4Q4VBF2 Gm12859-201ENSMUST00000117834 427 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
R3hdm4Q4VBF2 Pigyl-201ENSMUST00000123680 695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
R3hdm4Q4VBF2 Cyba-201ENSMUST00000017604 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
R3hdm4Q4VBF2 AL593843.1-201ENSMUST00000195891 145 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
R3hdm4Q4VBF2 4930432H08Rik-201ENSMUST00000198220 1284 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
R3hdm4Q4VBF2 Prss41-201ENSMUST00000024926 1128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
R3hdm4Q4VBF2 Taf11-201ENSMUST00000025057 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
R3hdm4Q4VBF2 Uqcr10-201ENSMUST00000058407 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
R3hdm4Q4VBF2 Odf3l2-201ENSMUST00000095464 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
R3hdm4Q4VBF2 Emd-203ENSMUST00000096424 896 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
R3hdm4Q4VBF2 Duxf3-202ENSMUST00000176875 2025 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
R3hdm4Q4VBF2 Cluh-202ENSMUST00000117818 4284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
R3hdm4Q4VBF2 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
R3hdm4Q4VBF2 Rreb1-202ENSMUST00000110237 4617 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
R3hdm4Q4VBF2 Flt3-201ENSMUST00000049324 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
R3hdm4Q4VBF2 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
R3hdm4Q4VBF2 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
R3hdm4Q4VBF2 H2-Q6-202ENSMUST00000174699 2085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
R3hdm4Q4VBF2 Kctd20-203ENSMUST00000118762 3839 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
R3hdm4Q4VBF2 Tmem218-201ENSMUST00000034632 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
R3hdm4Q4VBF2 Gng4-201ENSMUST00000021734 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
R3hdm4Q4VBF2 4930473A02Rik-202ENSMUST00000136793 1409 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
R3hdm4Q4VBF2 2600006K01Rik-201ENSMUST00000047607 1406 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
R3hdm4Q4VBF2 Lrrc10-201ENSMUST00000073834 1428 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
R3hdm4Q4VBF2 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
R3hdm4Q4VBF2 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
R3hdm4Q4VBF2 Vwc2-202ENSMUST00000109681 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
R3hdm4Q4VBF2 Zfp683-201ENSMUST00000105884 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
R3hdm4Q4VBF2 Itfg2-206ENSMUST00000203374 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
R3hdm4Q4VBF2 Mfap4-202ENSMUST00000064783 1722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
R3hdm4Q4VBF2 Lysmd3-202ENSMUST00000224300 4250 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
R3hdm4Q4VBF2 Pdpn-202ENSMUST00000119654 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
R3hdm4Q4VBF2 Pttg1ip-205ENSMUST00000162429 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
R3hdm4Q4VBF2 Gm36979-201ENSMUST00000193616 539 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
R3hdm4Q4VBF2 Lcmt1-204ENSMUST00000206574 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
R3hdm4Q4VBF2 Tbc1d17-209ENSMUST00000207293 692 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
R3hdm4Q4VBF2 Erp29-201ENSMUST00000052590 1123 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
R3hdm4Q4VBF2 Gtf2a1l-201ENSMUST00000024970 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
R3hdm4Q4VBF2 I730028E13Rik-201ENSMUST00000216012 1959 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
R3hdm4Q4VBF2 Cd3eap-201ENSMUST00000047036 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
R3hdm4Q4VBF2 Ccdc160-201ENSMUST00000101588 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
R3hdm4Q4VBF2 Gm37015-201ENSMUST00000192763 1521 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
R3hdm4Q4VBF2 Slc6a19os-201ENSMUST00000022049 1532 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
R3hdm4Q4VBF2 AC161252.3-201ENSMUST00000225465 1549 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
R3hdm4Q4VBF2 Gif-201ENSMUST00000025585 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
R3hdm4Q4VBF2 Uqcrq-201ENSMUST00000061326 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
R3hdm4Q4VBF2 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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