Protein–RNA interactions for Protein: Q3V3V9

Carmil2, Capping protein, Arp2/3 and myosin-I linker protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,296 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Carmil2Q3V3V9 Jakmip1-201ENSMUST00000043794 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Carmil2Q3V3V9 Brpf1-210ENSMUST00000204626 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Carmil2Q3V3V9 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Carmil2Q3V3V9 Esyt1-201ENSMUST00000026427 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Carmil2Q3V3V9 Catip-201ENSMUST00000097697 2101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Carmil2Q3V3V9 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Carmil2Q3V3V9 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Carmil2Q3V3V9 Cep126-201ENSMUST00000037397 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Carmil2Q3V3V9 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Carmil2Q3V3V9 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Carmil2Q3V3V9 Med4-201ENSMUST00000022705 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Carmil2Q3V3V9 Rbak-201ENSMUST00000049861 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Carmil2Q3V3V9 Sumo2-204ENSMUST00000118155 884 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Carmil2Q3V3V9 Gm12329-201ENSMUST00000120829 1007 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Carmil2Q3V3V9 Ankzf1-201ENSMUST00000127625 1167 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Carmil2Q3V3V9 Snhg9-201ENSMUST00000161706 183 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Carmil2Q3V3V9 Gm17232-201ENSMUST00000164515 453 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Carmil2Q3V3V9 Syce3-202ENSMUST00000167959 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Carmil2Q3V3V9 Gm10275-202ENSMUST00000168697 495 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Carmil2Q3V3V9 Gm16476-201ENSMUST00000221544 139 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Carmil2Q3V3V9 AC123645.1-201ENSMUST00000228469 605 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Carmil2Q3V3V9 Ndufa8-201ENSMUST00000070112 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Carmil2Q3V3V9 Gm10275-201ENSMUST00000092620 635 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Carmil2Q3V3V9 P2rx3-202ENSMUST00000111613 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Carmil2Q3V3V9 Gm14812-201ENSMUST00000156494 1794 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Carmil2Q3V3V9 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Carmil2Q3V3V9 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Carmil2Q3V3V9 2810006K23Rik-202ENSMUST00000111477 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Carmil2Q3V3V9 Ywhag-205ENSMUST00000198270 1610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Carmil2Q3V3V9 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Carmil2Q3V3V9 Ciart-202ENSMUST00000159739 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Carmil2Q3V3V9 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Carmil2Q3V3V9 Nt5c3b-205ENSMUST00000107399 1427 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Carmil2Q3V3V9 Tpm1-202ENSMUST00000034928 1824 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Carmil2Q3V3V9 Tpgs2-201ENSMUST00000115817 4159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Carmil2Q3V3V9 Cd72-202ENSMUST00000098104 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Carmil2Q3V3V9 Gm29154-231ENSMUST00000215120 1367 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Carmil2Q3V3V9 Kif7-204ENSMUST00000184137 4093 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Carmil2Q3V3V9 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Carmil2Q3V3V9 Zkscan7-202ENSMUST00000215872 4035 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Carmil2Q3V3V9 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Carmil2Q3V3V9 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Carmil2Q3V3V9 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Carmil2Q3V3V9 Lysmd3-202ENSMUST00000224300 4250 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Carmil2Q3V3V9 Nphs2-201ENSMUST00000027896 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Carmil2Q3V3V9 Cdkn2aip-201ENSMUST00000038738 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Carmil2Q3V3V9 Mir1897-201ENSMUST00000122581 272 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Carmil2Q3V3V9 Gnb2-209ENSMUST00000143495 1285 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Carmil2Q3V3V9 Ip6k2-210ENSMUST00000194875 748 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Carmil2Q3V3V9 Tcta-203ENSMUST00000195615 597 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Carmil2Q3V3V9 Gm7619-201ENSMUST00000210649 1282 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Carmil2Q3V3V9 Ssr1-204ENSMUST00000225319 1610 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Carmil2Q3V3V9 R3hcc1-202ENSMUST00000121142 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Carmil2Q3V3V9 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Carmil2Q3V3V9 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Carmil2Q3V3V9 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Carmil2Q3V3V9 Spns1-201ENSMUST00000032994 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Carmil2Q3V3V9 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Carmil2Q3V3V9 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Carmil2Q3V3V9 Myo19-202ENSMUST00000093969 4091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Carmil2Q3V3V9 9330182L06Rik-201ENSMUST00000069538 4688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Carmil2Q3V3V9 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Carmil2Q3V3V9 Neu2-203ENSMUST00000164128 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Carmil2Q3V3V9 Tfap2a-201ENSMUST00000021787 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Carmil2Q3V3V9 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Carmil2Q3V3V9 Hsph1-205ENSMUST00000201452 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Carmil2Q3V3V9 Serpinh1-201ENSMUST00000094154 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Carmil2Q3V3V9 Unc119b-201ENSMUST00000060798 3659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Carmil2Q3V3V9 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Carmil2Q3V3V9 4632404H12Rik-201ENSMUST00000038450 2791 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Carmil2Q3V3V9 Gm42471-201ENSMUST00000201457 1865 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Carmil2Q3V3V9 Edil3-203ENSMUST00000118731 2721 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Carmil2Q3V3V9 Gng7-205ENSMUST00000118465 875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Carmil2Q3V3V9 Pax5-206ENSMUST00000134968 969 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Carmil2Q3V3V9 Gm15294-202ENSMUST00000182079 366 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Carmil2Q3V3V9 1700029B24Rik-201ENSMUST00000194040 497 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Carmil2Q3V3V9 AC154687.2-201ENSMUST00000223853 640 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Carmil2Q3V3V9 Ndufc2-201ENSMUST00000032882 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Carmil2Q3V3V9 Rps21-201ENSMUST00000059080 394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Carmil2Q3V3V9 Adk-207ENSMUST00000224069 1818 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Carmil2Q3V3V9 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Carmil2Q3V3V9 Cnot7-201ENSMUST00000034012 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Carmil2Q3V3V9 Trim68-205ENSMUST00000210855 2301 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Carmil2Q3V3V9 AC166491.1-201ENSMUST00000227053 2308 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Carmil2Q3V3V9 Pip5k1c-210ENSMUST00000163075 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Carmil2Q3V3V9 Rnf168-201ENSMUST00000014218 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Carmil2Q3V3V9 Zfp574-202ENSMUST00000179556 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Carmil2Q3V3V9 Snx22-201ENSMUST00000044711 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Carmil2Q3V3V9 Cep131-201ENSMUST00000106227 3578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Carmil2Q3V3V9 Cep131-202ENSMUST00000106229 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Carmil2Q3V3V9 Cep131-207ENSMUST00000180242 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Carmil2Q3V3V9 Pfkfb3-205ENSMUST00000114845 1971 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Carmil2Q3V3V9 Sytl1-201ENSMUST00000030674 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Carmil2Q3V3V9 Pgm5-201ENSMUST00000047666 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Carmil2Q3V3V9 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Carmil2Q3V3V9 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Carmil2Q3V3V9 Tacc3-201ENSMUST00000074849 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Carmil2Q3V3V9 Camk2b-208ENSMUST00000109812 1875 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Carmil2Q3V3V9 Dcp1b-202ENSMUST00000112777 3313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Carmil2Q3V3V9 Socs3-201ENSMUST00000054002 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.3 ms