Protein–RNA interactions for Protein: Q3V129

Ulk4, Serine/threonine-protein kinase ULK4, mousemouse

Predictions only

Length 1,303 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ulk4Q3V129 Ptprn2-201ENSMUST00000070733 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ulk4Q3V129 Arhgef25-202ENSMUST00000167353 2189 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ulk4Q3V129 Tspan32-205ENSMUST00000105924 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ulk4Q3V129 R3hcc1-206ENSMUST00000216152 1467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ulk4Q3V129 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ulk4Q3V129 Erc1-207ENSMUST00000183911 3865 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ulk4Q3V129 Sec11a-203ENSMUST00000119980 903 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ulk4Q3V129 Chchd7-207ENSMUST00000121210 548 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ulk4Q3V129 Gm6460-202ENSMUST00000163787 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ulk4Q3V129 Gm8879-201ENSMUST00000170260 1125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ulk4Q3V129 4933402N22Rik-202ENSMUST00000170301 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ulk4Q3V129 Kcnk9-201ENSMUST00000044624 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ulk4Q3V129 Swi5-201ENSMUST00000050410 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ulk4Q3V129 Gm8973-201ENSMUST00000079818 315 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ulk4Q3V129 Ap2s1-201ENSMUST00000086112 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ulk4Q3V129 Catip-201ENSMUST00000097697 2101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ulk4Q3V129 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ulk4Q3V129 Mpl-201ENSMUST00000006556 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ulk4Q3V129 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ulk4Q3V129 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ulk4Q3V129 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ulk4Q3V129 Angptl7-201ENSMUST00000030840 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ulk4Q3V129 Sphk2-201ENSMUST00000072836 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ulk4Q3V129 Fbxo34-203ENSMUST00000163324 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ulk4Q3V129 2010300F17Rik-202ENSMUST00000181758 2493 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ulk4Q3V129 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ulk4Q3V129 Trim15-203ENSMUST00000174195 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ulk4Q3V129 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ulk4Q3V129 Capns2-201ENSMUST00000104947 1005 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ulk4Q3V129 Gm12485-201ENSMUST00000119641 291 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Ulk4Q3V129 Tmem219-202ENSMUST00000119781 1118 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ulk4Q3V129 Gm12416-201ENSMUST00000120911 1008 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Ulk4Q3V129 Haglr-202ENSMUST00000152462 443 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ulk4Q3V129 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ulk4Q3V129 Gm21887-201ENSMUST00000178789 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ulk4Q3V129 Gm2445-201ENSMUST00000182798 989 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Ulk4Q3V129 Gm2495-201ENSMUST00000191160 466 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Ulk4Q3V129 Mfsd3-201ENSMUST00000019224 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ulk4Q3V129 Gm5035-201ENSMUST00000215581 927 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Ulk4Q3V129 Dpm3-201ENSMUST00000040824 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ulk4Q3V129 2600006K01Rik-201ENSMUST00000047607 1406 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ulk4Q3V129 Abhd14b-201ENSMUST00000048527 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ulk4Q3V129 Nanos3-201ENSMUST00000070102 730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ulk4Q3V129 Sgce-205ENSMUST00000115579 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ulk4Q3V129 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ulk4Q3V129 Dmkn-205ENSMUST00000165887 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ulk4Q3V129 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ulk4Q3V129 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ulk4Q3V129 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ulk4Q3V129 Mettl11b-201ENSMUST00000159679 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ulk4Q3V129 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ulk4Q3V129 Abl2-201ENSMUST00000027888 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ulk4Q3V129 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ulk4Q3V129 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ulk4Q3V129 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ulk4Q3V129 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ulk4Q3V129 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ulk4Q3V129 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ulk4Q3V129 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ulk4Q3V129 4933427I22Rik-201ENSMUST00000138672 393 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ulk4Q3V129 Carmn-202ENSMUST00000182244 988 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ulk4Q3V129 Gm8463-201ENSMUST00000208573 613 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Ulk4Q3V129 Gm17794-201ENSMUST00000220252 955 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Ulk4Q3V129 Tnfrsf19-205ENSMUST00000225730 744 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ulk4Q3V129 Clps-201ENSMUST00000025062 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ulk4Q3V129 Car5a-201ENSMUST00000057653 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ulk4Q3V129 Pdzd11-202ENSMUST00000059099 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ulk4Q3V129 Gm5356-201ENSMUST00000093326 615 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Ulk4Q3V129 Slc7a7-202ENSMUST00000195970 2057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ulk4Q3V129 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ulk4Q3V129 Gm38102-201ENSMUST00000192791 1935 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Ulk4Q3V129 Catsper4-204ENSMUST00000169381 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ulk4Q3V129 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ulk4Q3V129 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ulk4Q3V129 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ulk4Q3V129 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ulk4Q3V129 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ulk4Q3V129 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ulk4Q3V129 Gm2895-201ENSMUST00000171591 3194 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ulk4Q3V129 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ulk4Q3V129 Etfdh-201ENSMUST00000029386 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ulk4Q3V129 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ulk4Q3V129 Igsf8-204ENSMUST00000139528 2866 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ulk4Q3V129 Rbmx2-201ENSMUST00000033433 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ulk4Q3V129 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ulk4Q3V129 Gm26565-201ENSMUST00000181642 1968 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ulk4Q3V129 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ulk4Q3V129 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ulk4Q3V129 Lrrc10-201ENSMUST00000073834 1428 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ulk4Q3V129 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ulk4Q3V129 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ulk4Q3V129 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ulk4Q3V129 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ulk4Q3V129 AC161252.3-201ENSMUST00000225465 1549 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Ulk4Q3V129 Tmem53-202ENSMUST00000106433 913 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ulk4Q3V129 Defb30-203ENSMUST00000111208 503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ulk4Q3V129 Defb30-204ENSMUST00000111209 721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ulk4Q3V129 Rpl39-201ENSMUST00000115231 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ulk4Q3V129 Mir1894-201ENSMUST00000122802 81 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Ulk4Q3V129 Elane-201ENSMUST00000046091 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.8 ms