Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0J4

Ankrd53, Ankyrin repeat domain-containing protein 53, mousemouse

Predictions only

Length 497 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ankrd53Q3V0J4 Gm45799-201ENSMUST00000106785 367 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ankrd53Q3V0J4 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ankrd53Q3V0J4 2700012I20Rik-201ENSMUST00000180525 684 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ankrd53Q3V0J4 Rbbp5-206ENSMUST00000190825 2456 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ankrd53Q3V0J4 Fmc1-201ENSMUST00000019833 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ankrd53Q3V0J4 Slc4a1ap-213ENSMUST00000202950 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ankrd53Q3V0J4 Gm4756-204ENSMUST00000209038 990 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ankrd53Q3V0J4 Gm30934-201ENSMUST00000215803 815 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ankrd53Q3V0J4 Syt7-205ENSMUST00000224135 1557 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Ankrd53Q3V0J4 Mpc1-201ENSMUST00000046754 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ankrd53Q3V0J4 Gm11149-201ENSMUST00000068730 1250 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ankrd53Q3V0J4 Gm2895-201ENSMUST00000171591 3194 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ankrd53Q3V0J4 Six3os1-211ENSMUST00000176958 2889 ntTSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ankrd53Q3V0J4 Ctps-201ENSMUST00000030381 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ankrd53Q3V0J4 Cd3eap-201ENSMUST00000047036 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ankrd53Q3V0J4 Pcdha11-201ENSMUST00000115658 5359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ankrd53Q3V0J4 Etnk2-201ENSMUST00000129213 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ankrd53Q3V0J4 Osbpl8-202ENSMUST00000105275 7204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ankrd53Q3V0J4 Tmem19-203ENSMUST00000217884 2799 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ankrd53Q3V0J4 Nphp4-202ENSMUST00000081393 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ankrd53Q3V0J4 Ccdc157-201ENSMUST00000093381 5015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ankrd53Q3V0J4 Gm26513-201ENSMUST00000181802 2489 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Ankrd53Q3V0J4 Slc8b1-203ENSMUST00000111889 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ankrd53Q3V0J4 Col18a1-201ENSMUST00000072755 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ankrd53Q3V0J4 Kcng1-201ENSMUST00000099069 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ankrd53Q3V0J4 Mfsd1-201ENSMUST00000029344 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ankrd53Q3V0J4 Cpne6-202ENSMUST00000163767 2004 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ankrd53Q3V0J4 Gbgt1-203ENSMUST00000163121 1335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ankrd53Q3V0J4 Gm45667-201ENSMUST00000210380 1316 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Ankrd53Q3V0J4 D130052B06Rik-201ENSMUST00000101371 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ankrd53Q3V0J4 Egln3-201ENSMUST00000039516 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ankrd53Q3V0J4 Rxra-203ENSMUST00000113934 1989 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ankrd53Q3V0J4 R3hcc1-202ENSMUST00000121142 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ankrd53Q3V0J4 Camta1-211ENSMUST00000169423 5208 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ankrd53Q3V0J4 Larp4b-202ENSMUST00000188211 5610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ankrd53Q3V0J4 Pramel1-201ENSMUST00000037419 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ankrd53Q3V0J4 Sipa1-204ENSMUST00000169854 3583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ankrd53Q3V0J4 Hcrt-202ENSMUST00000107360 509 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ankrd53Q3V0J4 Pigyl-201ENSMUST00000123680 695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ankrd53Q3V0J4 Gm17409-201ENSMUST00000167423 962 ntAPPRIS P1 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ankrd53Q3V0J4 Pfdn6-204ENSMUST00000174048 560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ankrd53Q3V0J4 Naxd-205ENSMUST00000178721 1108 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ankrd53Q3V0J4 2410004P03Rik-203ENSMUST00000190691 953 ntTSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ankrd53Q3V0J4 Gm45195-201ENSMUST00000205597 1008 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Ankrd53Q3V0J4 Saa2-203ENSMUST00000210769 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ankrd53Q3V0J4 AC165157.4-201ENSMUST00000220587 139 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Ankrd53Q3V0J4 1700020A23Rik-201ENSMUST00000028898 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ankrd53Q3V0J4 Selenow-201ENSMUST00000044355 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ankrd53Q3V0J4 Mrps21-202ENSMUST00000072587 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ankrd53Q3V0J4 Saa2-201ENSMUST00000075982 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ankrd53Q3V0J4 Tmem38b-201ENSMUST00000030127 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ankrd53Q3V0J4 Slc38a1-201ENSMUST00000088452 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ankrd53Q3V0J4 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ankrd53Q3V0J4 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ankrd53Q3V0J4 Retreg1-202ENSMUST00000110438 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ankrd53Q3V0J4 Ptprr-204ENSMUST00000128399 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ankrd53Q3V0J4 Szrd1-203ENSMUST00000102487 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ankrd53Q3V0J4 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ankrd53Q3V0J4 Gm13127-201ENSMUST00000118978 1389 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Ankrd53Q3V0J4 Trnt1-204ENSMUST00000113249 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ankrd53Q3V0J4 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ankrd53Q3V0J4 Zfp683-201ENSMUST00000105884 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ankrd53Q3V0J4 Rbm4-206ENSMUST00000180248 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ankrd53Q3V0J4 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ankrd53Q3V0J4 Gtf2h4-207ENSMUST00000160734 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ankrd53Q3V0J4 Rusc1-201ENSMUST00000052539 3316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ankrd53Q3V0J4 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ankrd53Q3V0J4 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ankrd53Q3V0J4 4632428C04Rik-201ENSMUST00000181485 2430 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ankrd53Q3V0J4 Cep295nl-201ENSMUST00000103024 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ankrd53Q3V0J4 Smo-201ENSMUST00000001812 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ankrd53Q3V0J4 Gins3-201ENSMUST00000034094 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ankrd53Q3V0J4 Ap4e1-203ENSMUST00000110394 2271 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ankrd53Q3V0J4 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ankrd53Q3V0J4 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ankrd53Q3V0J4 Pex2-202ENSMUST00000071280 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ankrd53Q3V0J4 B230359F08Rik-201ENSMUST00000103671 426 ntAPPRIS P1 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ankrd53Q3V0J4 Vamp2-202ENSMUST00000117780 1113 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ankrd53Q3V0J4 3110053B16Rik-204ENSMUST00000145605 575 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Ankrd53Q3V0J4 Gm13568-201ENSMUST00000156099 446 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ankrd53Q3V0J4 Ighv5-13-201ENSMUST00000193550 290 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Ankrd53Q3V0J4 9430085M18Rik-201ENSMUST00000198824 1178 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ankrd53Q3V0J4 Tmem129-204ENSMUST00000200849 657 ntTSL 3 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ankrd53Q3V0J4 Gm44855-201ENSMUST00000205725 362 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Ankrd53Q3V0J4 AC135669.1-201ENSMUST00000213585 412 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Ankrd53Q3V0J4 Gm19220-201ENSMUST00000222682 803 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Ankrd53Q3V0J4 Ufsp1-201ENSMUST00000052825 1037 ntAPPRIS P1 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ankrd53Q3V0J4 Myoz3-201ENSMUST00000056533 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ankrd53Q3V0J4 Cldn13-201ENSMUST00000008987 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ankrd53Q3V0J4 Fbrs-202ENSMUST00000205432 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ankrd53Q3V0J4 Pfkfb3-205ENSMUST00000114845 1971 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ankrd53Q3V0J4 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ankrd53Q3V0J4 Trnt1-203ENSMUST00000113248 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ankrd53Q3V0J4 Tm7sf2-203ENSMUST00000159084 1351 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ankrd53Q3V0J4 Dnajb5-204ENSMUST00000107973 2300 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ankrd53Q3V0J4 Gm37105-201ENSMUST00000192251 2085 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Ankrd53Q3V0J4 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ankrd53Q3V0J4 Cenpl-203ENSMUST00000111620 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
Ankrd53Q3V0J4 Hsf4-206ENSMUST00000173859 1576 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
Ankrd53Q3V0J4 Ddb2-201ENSMUST00000028696 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.7 ms