Protein–RNA interactions for Protein: Q3UZ39

Lrrfip1, Leucine-rich repeat flightless-interacting protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 729 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrfip1Q3UZ39 Gm4756-204ENSMUST00000209038 990 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lrrfip1Q3UZ39 Traf2-201ENSMUST00000028311 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lrrfip1Q3UZ39 Zkscan7-202ENSMUST00000215872 4035 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lrrfip1Q3UZ39 S100b-201ENSMUST00000036387 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lrrfip1Q3UZ39 Bptf-202ENSMUST00000106762 11847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lrrfip1Q3UZ39 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lrrfip1Q3UZ39 Gpr153-202ENSMUST00000105650 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lrrfip1Q3UZ39 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lrrfip1Q3UZ39 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lrrfip1Q3UZ39 Gm9347-201ENSMUST00000211473 1607 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Lrrfip1Q3UZ39 Notch1-201ENSMUST00000028288 9488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lrrfip1Q3UZ39 Ubiad1-201ENSMUST00000051633 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lrrfip1Q3UZ39 Mcur1-201ENSMUST00000021800 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lrrfip1Q3UZ39 Os9-201ENSMUST00000080975 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lrrfip1Q3UZ39 Vamp2-201ENSMUST00000021273 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lrrfip1Q3UZ39 Slc39a8-202ENSMUST00000081978 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lrrfip1Q3UZ39 4930423C22Rik-201ENSMUST00000193863 1311 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Lrrfip1Q3UZ39 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lrrfip1Q3UZ39 Ckmt1-202ENSMUST00000078222 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lrrfip1Q3UZ39 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lrrfip1Q3UZ39 Trf-201ENSMUST00000035158 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lrrfip1Q3UZ39 Fam219aos-201ENSMUST00000151164 708 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lrrfip1Q3UZ39 Gm6283-201ENSMUST00000182369 1000 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Lrrfip1Q3UZ39 2900022M07Rik-201ENSMUST00000193912 1017 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Lrrfip1Q3UZ39 Aqp10-ps-201ENSMUST00000199555 611 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Lrrfip1Q3UZ39 Ociad1-210ENSMUST00000202250 800 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lrrfip1Q3UZ39 Cited1-201ENSMUST00000050551 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lrrfip1Q3UZ39 Gm33195-201ENSMUST00000220827 2337 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lrrfip1Q3UZ39 Lrp10-201ENSMUST00000022782 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lrrfip1Q3UZ39 Klhl12-203ENSMUST00000116528 3277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lrrfip1Q3UZ39 Ncdn-202ENSMUST00000106116 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lrrfip1Q3UZ39 Ralgapb-203ENSMUST00000109486 8383 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lrrfip1Q3UZ39 Nrd1-202ENSMUST00000102736 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lrrfip1Q3UZ39 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Lrrfip1Q3UZ39 Cd300lf-203ENSMUST00000106562 1762 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lrrfip1Q3UZ39 Gtf2h4-207ENSMUST00000160734 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lrrfip1Q3UZ39 Kif5c-201ENSMUST00000028102 6856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lrrfip1Q3UZ39 Hp1bp3-202ENSMUST00000097836 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lrrfip1Q3UZ39 Kcng1-202ENSMUST00000109191 4089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lrrfip1Q3UZ39 A3galt2-202ENSMUST00000106077 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lrrfip1Q3UZ39 Fermt2-201ENSMUST00000045905 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lrrfip1Q3UZ39 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lrrfip1Q3UZ39 Hnf1b-203ENSMUST00000108114 2659 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lrrfip1Q3UZ39 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lrrfip1Q3UZ39 Mmp14-206ENSMUST00000225641 3238 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Lrrfip1Q3UZ39 Ate1-201ENSMUST00000033139 4735 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lrrfip1Q3UZ39 1500015A07Rik-201ENSMUST00000184181 1865 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Lrrfip1Q3UZ39 Cnot7-201ENSMUST00000034012 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lrrfip1Q3UZ39 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lrrfip1Q3UZ39 Trim10-201ENSMUST00000060524 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lrrfip1Q3UZ39 Cnih4-203ENSMUST00000111059 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lrrfip1Q3UZ39 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lrrfip1Q3UZ39 Pla2g2e-203ENSMUST00000105804 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lrrfip1Q3UZ39 Ppp1r14d-202ENSMUST00000110820 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lrrfip1Q3UZ39 Gm11214-201ENSMUST00000184252 552 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lrrfip1Q3UZ39 Pla2g2e-201ENSMUST00000030531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lrrfip1Q3UZ39 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lrrfip1Q3UZ39 Gale-202ENSMUST00000102541 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lrrfip1Q3UZ39 Clcnkb-202ENSMUST00000105788 2490 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lrrfip1Q3UZ39 Gtf2e2-201ENSMUST00000167264 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lrrfip1Q3UZ39 Syt7-205ENSMUST00000224135 1557 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Lrrfip1Q3UZ39 Eloa-201ENSMUST00000030427 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lrrfip1Q3UZ39 Hsph1-211ENSMUST00000202361 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lrrfip1Q3UZ39 Crem-201ENSMUST00000025069 2931 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lrrfip1Q3UZ39 Gm29154-231ENSMUST00000215120 1367 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lrrfip1Q3UZ39 N4bp3-201ENSMUST00000001080 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lrrfip1Q3UZ39 Mllt10-203ENSMUST00000114671 5063 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lrrfip1Q3UZ39 Chit1-201ENSMUST00000086475 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lrrfip1Q3UZ39 Ablim1-209ENSMUST00000111546 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lrrfip1Q3UZ39 Car10-203ENSMUST00000107858 2742 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lrrfip1Q3UZ39 Mafg-203ENSMUST00000106181 840 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lrrfip1Q3UZ39 Cenpa-206ENSMUST00000149759 346 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lrrfip1Q3UZ39 Olfr1412-201ENSMUST00000062964 966 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lrrfip1Q3UZ39 Prtn3-201ENSMUST00000006679 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lrrfip1Q3UZ39 Esyt1-201ENSMUST00000026427 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lrrfip1Q3UZ39 Tmub2-205ENSMUST00000156326 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lrrfip1Q3UZ39 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lrrfip1Q3UZ39 Tmem101-201ENSMUST00000021296 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lrrfip1Q3UZ39 Phka1-206ENSMUST00000122022 6115 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lrrfip1Q3UZ39 Phka1-202ENSMUST00000052012 6115 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lrrfip1Q3UZ39 Psap-202ENSMUST00000105465 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lrrfip1Q3UZ39 Chst4-202ENSMUST00000211894 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lrrfip1Q3UZ39 Rbbp7-201ENSMUST00000033720 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lrrfip1Q3UZ39 Zc3h13-201ENSMUST00000022577 6151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lrrfip1Q3UZ39 Cyp1b1-201ENSMUST00000024894 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lrrfip1Q3UZ39 Ubtf-209ENSMUST00000173870 2936 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lrrfip1Q3UZ39 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lrrfip1Q3UZ39 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lrrfip1Q3UZ39 Kdm2b-204ENSMUST00000118027 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lrrfip1Q3UZ39 Arhgef25-202ENSMUST00000167353 2189 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lrrfip1Q3UZ39 Haus5-201ENSMUST00000019697 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lrrfip1Q3UZ39 Zfp784-201ENSMUST00000062428 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lrrfip1Q3UZ39 AC114543.1-201ENSMUST00000226451 1558 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Lrrfip1Q3UZ39 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lrrfip1Q3UZ39 Ccl25-205ENSMUST00000127460 867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lrrfip1Q3UZ39 H60b-202ENSMUST00000131558 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lrrfip1Q3UZ39 Mecp2-204ENSMUST00000140399 1168 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lrrfip1Q3UZ39 Gldnos-201ENSMUST00000149237 841 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lrrfip1Q3UZ39 Pfdn5-205ENSMUST00000166658 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lrrfip1Q3UZ39 Gm10766-202ENSMUST00000194123 606 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.4 ms