Protein–RNA interactions for Protein: Q3UX49

C87499, Expressed sequence C87499, mousemouse

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C87499Q3UX49 Pdzd11-202ENSMUST00000059099 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
C87499Q3UX49 Kxd1-201ENSMUST00000093456 1216 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
C87499Q3UX49 Ftl1-201ENSMUST00000094434 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
C87499Q3UX49 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
C87499Q3UX49 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
C87499Q3UX49 Slc25a54-201ENSMUST00000029478 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
C87499Q3UX49 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
C87499Q3UX49 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
C87499Q3UX49 AC159196.2-201ENSMUST00000224082 1622 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
C87499Q3UX49 Slc7a7-202ENSMUST00000195970 2057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
C87499Q3UX49 Zfp574-202ENSMUST00000179556 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
C87499Q3UX49 Pdpn-201ENSMUST00000030317 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
C87499Q3UX49 Rbm46-201ENSMUST00000048647 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
C87499Q3UX49 Prkacb-202ENSMUST00000102515 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
C87499Q3UX49 Steap2-201ENSMUST00000015797 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
C87499Q3UX49 Zfp566-201ENSMUST00000088785 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
C87499Q3UX49 Pebp1-202ENSMUST00000111973 779 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
C87499Q3UX49 Gm15460-201ENSMUST00000118147 391 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
C87499Q3UX49 Alms1-ps2-201ENSMUST00000160606 1170 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
C87499Q3UX49 Cyba-201ENSMUST00000017604 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
C87499Q3UX49 Gm5108-201ENSMUST00000177891 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
C87499Q3UX49 Ndufv3-205ENSMUST00000191598 642 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
C87499Q3UX49 Gm9794-201ENSMUST00000202370 423 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
C87499Q3UX49 Cd302-201ENSMUST00000028356 1257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
C87499Q3UX49 Ufsp1-201ENSMUST00000052825 1037 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
C87499Q3UX49 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
C87499Q3UX49 Amdhd2-201ENSMUST00000040735 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
C87499Q3UX49 Poli-205ENSMUST00000161542 2736 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
C87499Q3UX49 Kcnj3-203ENSMUST00000112633 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
C87499Q3UX49 Slc26a4-201ENSMUST00000001253 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
C87499Q3UX49 Adamts8-201ENSMUST00000068135 3631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
C87499Q3UX49 Kctd20-203ENSMUST00000118762 3839 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
C87499Q3UX49 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
C87499Q3UX49 Pard3-222ENSMUST00000162536 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
C87499Q3UX49 Rbm47-206ENSMUST00000200775 3180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
C87499Q3UX49 Oasl1-202ENSMUST00000112143 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
C87499Q3UX49 Cyp21a2-ps-201ENSMUST00000172970 1383 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
C87499Q3UX49 Slc6a7-201ENSMUST00000025520 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
C87499Q3UX49 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
C87499Q3UX49 Tfe3-201ENSMUST00000077680 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
C87499Q3UX49 Pax6-201ENSMUST00000090391 2869 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
C87499Q3UX49 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
C87499Q3UX49 Syt7-204ENSMUST00000223586 1344 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
C87499Q3UX49 Alg10b-201ENSMUST00000100309 3727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
C87499Q3UX49 Ccdc134-201ENSMUST00000089174 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
C87499Q3UX49 Gm19461-205ENSMUST00000191207 2566 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
C87499Q3UX49 Cog7-201ENSMUST00000057576 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
C87499Q3UX49 Pla2g2e-202ENSMUST00000105803 381 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
C87499Q3UX49 Rgs19-203ENSMUST00000108771 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
C87499Q3UX49 Rgs19-205ENSMUST00000108776 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
C87499Q3UX49 Apoo-203ENSMUST00000113897 1218 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
C87499Q3UX49 Gm4875-201ENSMUST00000118257 786 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
C87499Q3UX49 4930478K11Rik-201ENSMUST00000181875 715 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
C87499Q3UX49 AC124732.1-201ENSMUST00000221551 910 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
C87499Q3UX49 Pemt-201ENSMUST00000000310 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
C87499Q3UX49 Rps15-201ENSMUST00000062674 572 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
C87499Q3UX49 Csk-209ENSMUST00000217314 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
C87499Q3UX49 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
C87499Q3UX49 Caprin2-202ENSMUST00000111569 3697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
C87499Q3UX49 Hsf4-206ENSMUST00000173859 1576 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
C87499Q3UX49 Ubqln2-201ENSMUST00000060714 3344 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
C87499Q3UX49 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
C87499Q3UX49 Art3-205ENSMUST00000120193 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
C87499Q3UX49 Canx-205ENSMUST00000179865 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
C87499Q3UX49 Plcd1-203ENSMUST00000214470 2706 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
C87499Q3UX49 Ccdc160-201ENSMUST00000101588 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
C87499Q3UX49 Gale-201ENSMUST00000102540 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
C87499Q3UX49 Efemp1-201ENSMUST00000020759 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
C87499Q3UX49 Ate1-201ENSMUST00000033139 4735 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
C87499Q3UX49 Cep85-201ENSMUST00000040271 3893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
C87499Q3UX49 Gm12404-201ENSMUST00000122839 1661 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
C87499Q3UX49 Taf1a-201ENSMUST00000097043 1472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
C87499Q3UX49 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
C87499Q3UX49 Camk2b-203ENSMUST00000066431 1603 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
C87499Q3UX49 Grk4-201ENSMUST00000001112 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
C87499Q3UX49 1700037C18Rik-202ENSMUST00000115859 2592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
C87499Q3UX49 Atat1-201ENSMUST00000056034 1930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
C87499Q3UX49 Tub-202ENSMUST00000119474 2097 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
C87499Q3UX49 Gm7820-201ENSMUST00000121012 1052 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
C87499Q3UX49 Gm16122-201ENSMUST00000142625 1158 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
C87499Q3UX49 Unkl-205ENSMUST00000161679 1053 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
C87499Q3UX49 Gm5819-201ENSMUST00000171469 465 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
C87499Q3UX49 Cpsf4l-205ENSMUST00000173655 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
C87499Q3UX49 Gm17344-202ENSMUST00000173980 621 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
C87499Q3UX49 1700055C04Rik-201ENSMUST00000176450 355 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
C87499Q3UX49 Gm18187-201ENSMUST00000196476 984 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
C87499Q3UX49 Cited1-201ENSMUST00000050551 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
C87499Q3UX49 Mir497b-201ENSMUST00000093601 125 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
C87499Q3UX49 Zfp977-201ENSMUST00000173283 1425 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
C87499Q3UX49 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
C87499Q3UX49 Ldha-202ENSMUST00000048209 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
C87499Q3UX49 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
C87499Q3UX49 Maged2-203ENSMUST00000112699 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
C87499Q3UX49 Osbpl10-204ENSMUST00000182384 2158 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
C87499Q3UX49 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
C87499Q3UX49 Tdg-208ENSMUST00000151390 3502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
C87499Q3UX49 Camkk2-201ENSMUST00000111668 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
C87499Q3UX49 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
C87499Q3UX49 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
C87499Q3UX49 Gstcd-202ENSMUST00000080583 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.3 ms