Protein–RNA interactions for Protein: Q3UW77

Gm12888, MCG59630, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm12888Q3UW77 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm12888Q3UW77 Mapk4-201ENSMUST00000091851 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm12888Q3UW77 Shisa9-201ENSMUST00000023138 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm12888Q3UW77 Mrvi1-201ENSMUST00000005751 6198 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm12888Q3UW77 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm12888Q3UW77 Adam19-201ENSMUST00000011400 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm12888Q3UW77 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC10.29□□□□□ -0.76
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Gm12888Q3UW77 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm12888Q3UW77 Ralgps2-214ENSMUST00000191605 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm12888Q3UW77 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm12888Q3UW77 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm12888Q3UW77 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
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Gm12888Q3UW77 Gm34376-201ENSMUST00000218529 2107 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm12888Q3UW77 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm12888Q3UW77 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm12888Q3UW77 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm12888Q3UW77 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm12888Q3UW77 Mamdc4-202ENSMUST00000114223 3998 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm12888Q3UW77 Ddx31-201ENSMUST00000113853 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm12888Q3UW77 Hoxd3-202ENSMUST00000111982 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm12888Q3UW77 Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 2739 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm12888Q3UW77 Gm13848-201ENSMUST00000130777 2047 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm12888Q3UW77 5830418P13Rik-201ENSMUST00000143564 2178 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
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Gm12888Q3UW77 Nkain3-201ENSMUST00000102998 3098 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm12888Q3UW77 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm12888Q3UW77 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm12888Q3UW77 Glmn-202ENSMUST00000082121 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm12888Q3UW77 Brd3-202ENSMUST00000077737 5272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm12888Q3UW77 Scube1-203ENSMUST00000076060 3913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm12888Q3UW77 Gm37644-201ENSMUST00000192190 2270 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm12888Q3UW77 Gm26576-201ENSMUST00000181018 1977 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
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Gm12888Q3UW77 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
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Gm12888Q3UW77 Ehd1-201ENSMUST00000025684 3353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm12888Q3UW77 Col14a1-202ENSMUST00000110217 6457 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm12888Q3UW77 Nek1-209ENSMUST00000211672 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm12888Q3UW77 Eef1d-204ENSMUST00000089681 2152 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm12888Q3UW77 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm12888Q3UW77 Hacd2-201ENSMUST00000061156 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
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Gm12888Q3UW77 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
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Gm12888Q3UW77 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
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Gm12888Q3UW77 Pias3-202ENSMUST00000107076 2858 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm12888Q3UW77 AC115735.4-201ENSMUST00000227460 1944 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm12888Q3UW77 Taf1c-201ENSMUST00000093099 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm12888Q3UW77 Stat3-203ENSMUST00000127638 4516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
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Gm12888Q3UW77 Zfp536-201ENSMUST00000056338 4621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Gm12888Q3UW77 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Gm12888Q3UW77 Arhgef40-202ENSMUST00000100639 4843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Gm12888Q3UW77 AC154747.3-201ENSMUST00000224471 3470 ntBASIC10.27□□□□□ -0.76
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Gm12888Q3UW77 Spata21-201ENSMUST00000051907 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm12888Q3UW77 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm12888Q3UW77 Sirt3-210ENSMUST00000211179 1606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm12888Q3UW77 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm12888Q3UW77 Fgfr3-209ENSMUST00000164207 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm12888Q3UW77 Dpysl4-202ENSMUST00000121184 2727 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm12888Q3UW77 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm12888Q3UW77 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm12888Q3UW77 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm12888Q3UW77 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm12888Q3UW77 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm12888Q3UW77 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm12888Q3UW77 Gm20036-201ENSMUST00000177547 844 ntTSL 3 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm12888Q3UW77 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm12888Q3UW77 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm12888Q3UW77 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm12888Q3UW77 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm12888Q3UW77 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm12888Q3UW77 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.4 ms