Protein–RNA interactions for Protein: Q3UPE3

Rmi2, RecQ-mediated genome instability protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 149 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rmi2Q3UPE3 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Rmi2Q3UPE3 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC9.53□□□□□ -0.88
Rmi2Q3UPE3 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Rmi2Q3UPE3 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Rmi2Q3UPE3 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC9.53□□□□□ -0.88
Rmi2Q3UPE3 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Rmi2Q3UPE3 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Rmi2Q3UPE3 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC9.53□□□□□ -0.88
Rmi2Q3UPE3 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Rmi2Q3UPE3 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC9.53□□□□□ -0.88
Rmi2Q3UPE3 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC9.53□□□□□ -0.88
Rmi2Q3UPE3 F420014N23Rik-201ENSMUST00000181578 2396 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Rmi2Q3UPE3 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
Rmi2Q3UPE3 Gm5422-202ENSMUST00000216161 2928 ntTSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
Rmi2Q3UPE3 Serpinb2-201ENSMUST00000009356 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Rmi2Q3UPE3 Map1lc3b-201ENSMUST00000034270 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Rmi2Q3UPE3 Arid3b-209ENSMUST00000171444 4171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
Rmi2Q3UPE3 Gm16090-201ENSMUST00000130296 1704 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Rmi2Q3UPE3 Mfap4-202ENSMUST00000064783 1722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Rmi2Q3UPE3 Ubap2l-202ENSMUST00000064639 4073 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Rmi2Q3UPE3 Mpp3-202ENSMUST00000100400 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Rmi2Q3UPE3 Mrvi1-201ENSMUST00000005751 6198 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Rmi2Q3UPE3 Frzb-201ENSMUST00000028389 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Rmi2Q3UPE3 Phrf1-201ENSMUST00000106027 5248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
Rmi2Q3UPE3 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
Rmi2Q3UPE3 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Rmi2Q3UPE3 Acadsb-201ENSMUST00000015829 6081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Rmi2Q3UPE3 Arhgef40-202ENSMUST00000100639 4843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Rmi2Q3UPE3 Tmem39a-201ENSMUST00000002924 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Rmi2Q3UPE3 Hcrtr1-203ENSMUST00000120154 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Rmi2Q3UPE3 9130008F23Rik-201ENSMUST00000068258 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Rmi2Q3UPE3 Prpf8-201ENSMUST00000018449 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Rmi2Q3UPE3 Gdap1l1-202ENSMUST00000109420 2475 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Rmi2Q3UPE3 Ttbk1-203ENSMUST00000225808 8926 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.52□□□□□ -0.88
Rmi2Q3UPE3 Ppfia4-205ENSMUST00000189361 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.88
Rmi2Q3UPE3 Stat3-203ENSMUST00000127638 4516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.88
Rmi2Q3UPE3 Ddx46-202ENSMUST00000172272 5676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.88
Rmi2Q3UPE3 Ddx46-201ENSMUST00000099479 5664 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.88
Rmi2Q3UPE3 Pcbp3-203ENSMUST00000105411 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.88
Rmi2Q3UPE3 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.88
Rmi2Q3UPE3 Gm20633-201ENSMUST00000176742 2831 ntBASIC9.52□□□□□ -0.88
Rmi2Q3UPE3 Slx4-201ENSMUST00000040790 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.88
Rmi2Q3UPE3 A830018L16Rik-202ENSMUST00000135014 6451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Rmi2Q3UPE3 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Rmi2Q3UPE3 Ifi47-201ENSMUST00000046704 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Rmi2Q3UPE3 Pbxip1-201ENSMUST00000038942 4479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Rmi2Q3UPE3 Ctdspl2-201ENSMUST00000036647 5053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Rmi2Q3UPE3 Gm27196-201ENSMUST00000184787 2582 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
Rmi2Q3UPE3 Nlrp6-204ENSMUST00000184560 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Rmi2Q3UPE3 Fgd3-203ENSMUST00000110087 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Rmi2Q3UPE3 Slc39a9-208ENSMUST00000219706 5427 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Rmi2Q3UPE3 Cul9-204ENSMUST00000182485 7848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Rmi2Q3UPE3 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Rmi2Q3UPE3 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Rmi2Q3UPE3 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Rmi2Q3UPE3 Phf21a-206ENSMUST00000111292 2461 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Rmi2Q3UPE3 Laptm5-207ENSMUST00000151698 2600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Rmi2Q3UPE3 Pla2g4c-204ENSMUST00000167232 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Rmi2Q3UPE3 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Rmi2Q3UPE3 Gm7899-201ENSMUST00000192935 1897 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
Rmi2Q3UPE3 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Rmi2Q3UPE3 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Rmi2Q3UPE3 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Rmi2Q3UPE3 Brinp1-201ENSMUST00000030036 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Rmi2Q3UPE3 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Rmi2Q3UPE3 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Rmi2Q3UPE3 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Rmi2Q3UPE3 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Rmi2Q3UPE3 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Rmi2Q3UPE3 Rp2-202ENSMUST00000115387 4498 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Rmi2Q3UPE3 Fam214b-202ENSMUST00000107956 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Rmi2Q3UPE3 Pde1c-209ENSMUST00000203372 3147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Rmi2Q3UPE3 AC115735.4-201ENSMUST00000227460 1944 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
Rmi2Q3UPE3 Glmn-202ENSMUST00000082121 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Rmi2Q3UPE3 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Rmi2Q3UPE3 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Rmi2Q3UPE3 Lims1-202ENSMUST00000020078 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Rmi2Q3UPE3 Zfp385c-201ENSMUST00000103119 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Rmi2Q3UPE3 Tmem211-201ENSMUST00000086615 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Rmi2Q3UPE3 Lmln-201ENSMUST00000023497 6147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Rmi2Q3UPE3 Cacna1c-201ENSMUST00000075591 7584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Rmi2Q3UPE3 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Rmi2Q3UPE3 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Rmi2Q3UPE3 Secisbp2-201ENSMUST00000040117 3328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Rmi2Q3UPE3 Ptgr2-208ENSMUST00000147363 1869 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Rmi2Q3UPE3 Nrd1-201ENSMUST00000065977 4311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Rmi2Q3UPE3 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Rmi2Q3UPE3 Trp73-201ENSMUST00000097762 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Rmi2Q3UPE3 Tmem186-201ENSMUST00000052505 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Rmi2Q3UPE3 Gm1113-201ENSMUST00000183573 2434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Rmi2Q3UPE3 Shroom1-201ENSMUST00000018531 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Rmi2Q3UPE3 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Rmi2Q3UPE3 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
Rmi2Q3UPE3 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Rmi2Q3UPE3 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Rmi2Q3UPE3 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Rmi2Q3UPE3 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Rmi2Q3UPE3 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Rmi2Q3UPE3 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Rmi2Q3UPE3 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.2 ms