Protein–RNA interactions for Protein: Q3UND0

Skap2, Src kinase-associated phosphoprotein 2, mousemouse

Predictions only

Length 358 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Skap2Q3UND0 Slc39a8-201ENSMUST00000029810 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Skap2Q3UND0 Mgat3-201ENSMUST00000044970 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Skap2Q3UND0 Nid2-201ENSMUST00000022340 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Skap2Q3UND0 Aldh3b1-201ENSMUST00000051803 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Skap2Q3UND0 Ccdc116-203ENSMUST00000115711 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Skap2Q3UND0 Phldb1-201ENSMUST00000034611 5461 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Skap2Q3UND0 Gm14091-201ENSMUST00000133534 874 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Skap2Q3UND0 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Skap2Q3UND0 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Skap2Q3UND0 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Skap2Q3UND0 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Skap2Q3UND0 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Skap2Q3UND0 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Skap2Q3UND0 Pdgfra-205ENSMUST00000201711 4088 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Skap2Q3UND0 Fzd1-201ENSMUST00000054294 4197 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Skap2Q3UND0 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Skap2Q3UND0 Hp1bp3-201ENSMUST00000030541 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Skap2Q3UND0 Timp4-201ENSMUST00000032462 5496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Skap2Q3UND0 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Skap2Q3UND0 Phactr3-202ENSMUST00000103066 2680 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Skap2Q3UND0 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Skap2Q3UND0 Mfap4-202ENSMUST00000064783 1722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Skap2Q3UND0 Stim1-201ENSMUST00000033289 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Skap2Q3UND0 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Skap2Q3UND0 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Skap2Q3UND0 Zbtb20-201ENSMUST00000079441 3086 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Skap2Q3UND0 Top1mt-201ENSMUST00000000958 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Skap2Q3UND0 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Skap2Q3UND0 Fgfr1-201ENSMUST00000084027 5025 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Skap2Q3UND0 Iffo2-201ENSMUST00000040023 5227 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Skap2Q3UND0 Gm1113-201ENSMUST00000183573 2434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Skap2Q3UND0 5031415H12Rik-201ENSMUST00000181546 2481 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Skap2Q3UND0 Dlgap3-203ENSMUST00000106094 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Skap2Q3UND0 Stk25-201ENSMUST00000027498 4249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Skap2Q3UND0 Timp3-201ENSMUST00000020234 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Skap2Q3UND0 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Skap2Q3UND0 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Skap2Q3UND0 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Skap2Q3UND0 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Skap2Q3UND0 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Skap2Q3UND0 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Skap2Q3UND0 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Skap2Q3UND0 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Skap2Q3UND0 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Skap2Q3UND0 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Skap2Q3UND0 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Skap2Q3UND0 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Skap2Q3UND0 Mrpl3-201ENSMUST00000035177 3972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Skap2Q3UND0 Camk2d-202ENSMUST00000066466 4075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Skap2Q3UND0 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Skap2Q3UND0 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Skap2Q3UND0 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Skap2Q3UND0 Sp2-201ENSMUST00000062652 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Skap2Q3UND0 Gm45638-201ENSMUST00000211507 2878 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Skap2Q3UND0 Plxna1-202ENSMUST00000163139 9034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Skap2Q3UND0 6030458C11Rik-202ENSMUST00000227299 3206 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Skap2Q3UND0 Secisbp2-201ENSMUST00000040117 3328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Skap2Q3UND0 Pcyox1-201ENSMUST00000032065 4295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Skap2Q3UND0 Edrf1-202ENSMUST00000128901 4380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Skap2Q3UND0 Cpeb3-210ENSMUST00000136286 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Skap2Q3UND0 Ccdc8-201ENSMUST00000094805 4809 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Skap2Q3UND0 Klc2-202ENSMUST00000113727 2874 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Skap2Q3UND0 Minos1-203ENSMUST00000143971 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Skap2Q3UND0 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Skap2Q3UND0 Jazf1-201ENSMUST00000074541 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Skap2Q3UND0 Crat-202ENSMUST00000102854 2160 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Skap2Q3UND0 Mrgprf-201ENSMUST00000033386 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Skap2Q3UND0 Magi1-206ENSMUST00000203688 4969 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Skap2Q3UND0 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Skap2Q3UND0 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Skap2Q3UND0 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Skap2Q3UND0 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Skap2Q3UND0 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Skap2Q3UND0 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Skap2Q3UND0 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Skap2Q3UND0 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Skap2Q3UND0 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Skap2Q3UND0 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Skap2Q3UND0 Gatad2a-206ENSMUST00000212478 3622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Skap2Q3UND0 Pqlc2-202ENSMUST00000105801 2756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Skap2Q3UND0 Scin-202ENSMUST00000078481 2654 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Skap2Q3UND0 Siglecf-203ENSMUST00000122423 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Skap2Q3UND0 Twistnb-201ENSMUST00000020877 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Skap2Q3UND0 Pex12-207ENSMUST00000176518 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Skap2Q3UND0 Rgs6-208ENSMUST00000186458 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Skap2Q3UND0 Tjap1-203ENSMUST00000180283 2368 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Skap2Q3UND0 Ptp4a3-202ENSMUST00000163582 3808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Skap2Q3UND0 Gm15477-201ENSMUST00000140578 2130 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Skap2Q3UND0 Hif1a-201ENSMUST00000021530 4724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Skap2Q3UND0 Gm28386-201ENSMUST00000189147 1849 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
Skap2Q3UND0 Zbtb4-202ENSMUST00000108639 7811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Skap2Q3UND0 Kcnt1-204ENSMUST00000114176 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Skap2Q3UND0 Lrrc8e-201ENSMUST00000053035 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Skap2Q3UND0 Pcdh10-201ENSMUST00000166126 7081 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Skap2Q3UND0 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Skap2Q3UND0 Gm5763-201ENSMUST00000155951 1530 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
Skap2Q3UND0 Asb10-201ENSMUST00000048302 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Skap2Q3UND0 Ccser2-202ENSMUST00000090024 7509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Skap2Q3UND0 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Skap2Q3UND0 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51 ms