Protein–RNA interactions for Protein: Q3UNB8

Tmem253, Transmembrane protein 253, mousemouse

Predictions only

Length 204 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem253Q3UNB8 Asxl1-201ENSMUST00000109790 6968 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Tmem253Q3UNB8 Cnih4-204ENSMUST00000134115 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Tmem253Q3UNB8 Pde12-201ENSMUST00000052932 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Tmem253Q3UNB8 Ncald-211ENSMUST00000168992 3538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Tmem253Q3UNB8 Frmpd4-204ENSMUST00000112149 8456 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Tmem253Q3UNB8 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Tmem253Q3UNB8 Il18r1-203ENSMUST00000167723 1919 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Tmem253Q3UNB8 Pfkfb3-212ENSMUST00000170196 2163 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Tmem253Q3UNB8 Prdm5-202ENSMUST00000031976 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Tmem253Q3UNB8 Myc-205ENSMUST00000161976 2338 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Tmem253Q3UNB8 Myc-201ENSMUST00000022971 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Tmem253Q3UNB8 Ccdc121-201ENSMUST00000058825 1819 ntAPPRIS P1 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Tmem253Q3UNB8 Dido1-207ENSMUST00000130986 4898 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Tmem253Q3UNB8 Zfp618-203ENSMUST00000107415 8826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Tmem253Q3UNB8 Rgs9bp-201ENSMUST00000069912 6590 ntAPPRIS P1 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Tmem253Q3UNB8 Mcm9-206ENSMUST00000220007 3513 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Tmem253Q3UNB8 Kansl2-ps-201ENSMUST00000181818 1461 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Tmem253Q3UNB8 Ppara-202ENSMUST00000109422 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Tmem253Q3UNB8 Prr33-201ENSMUST00000054910 2251 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Tmem253Q3UNB8 Exoc6b-203ENSMUST00000160197 5439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Tmem253Q3UNB8 Armcx1-205ENSMUST00000113199 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Tmem253Q3UNB8 Tmem201-202ENSMUST00000103208 3620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Tmem253Q3UNB8 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Tmem253Q3UNB8 Ildr1-202ENSMUST00000089618 2850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Tmem253Q3UNB8 Tcf3-205ENSMUST00000105341 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Tmem253Q3UNB8 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Tmem253Q3UNB8 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Tmem253Q3UNB8 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Tmem253Q3UNB8 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Tmem253Q3UNB8 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Tmem253Q3UNB8 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Tmem253Q3UNB8 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Tmem253Q3UNB8 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Tmem253Q3UNB8 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Tmem253Q3UNB8 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Tmem253Q3UNB8 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Tmem253Q3UNB8 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Tmem253Q3UNB8 Samd4b-204ENSMUST00000208199 4391 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Tmem253Q3UNB8 Atp6v1h-204ENSMUST00000192698 1811 ntTSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Tmem253Q3UNB8 Tmem9-201ENSMUST00000063719 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Tmem253Q3UNB8 2410002F23Rik-206ENSMUST00000107950 3336 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Tmem253Q3UNB8 Secisbp2-201ENSMUST00000040117 3328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Tmem253Q3UNB8 Lrrc8e-201ENSMUST00000053035 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Tmem253Q3UNB8 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Tmem253Q3UNB8 Trappc12-201ENSMUST00000020954 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Tmem253Q3UNB8 Ikzf4-201ENSMUST00000133342 5150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Tmem253Q3UNB8 Fam160a2-204ENSMUST00000122327 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Tmem253Q3UNB8 Ap5z1-202ENSMUST00000196055 2965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Tmem253Q3UNB8 Pi4kb-201ENSMUST00000072287 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Tmem253Q3UNB8 Ptgr2-208ENSMUST00000147363 1869 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Tmem253Q3UNB8 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Tmem253Q3UNB8 Arhgef17-201ENSMUST00000107032 10190 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Tmem253Q3UNB8 Pja1-203ENSMUST00000113792 3038 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Tmem253Q3UNB8 Fmn2-201ENSMUST00000030039 6442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Tmem253Q3UNB8 2900026A02Rik-201ENSMUST00000050125 5876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Tmem253Q3UNB8 Ciz1-202ENSMUST00000113331 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.39
Tmem253Q3UNB8 Gm5422-202ENSMUST00000216161 2928 ntTSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.39
Tmem253Q3UNB8 Strip1-201ENSMUST00000064759 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.39
Tmem253Q3UNB8 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Tmem253Q3UNB8 Foxb1-201ENSMUST00000071281 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Tmem253Q3UNB8 Tmem51os1-203ENSMUST00000150202 1667 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Tmem253Q3UNB8 Cpne1-201ENSMUST00000079312 1683 ntTSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Tmem253Q3UNB8 Cuedc2-201ENSMUST00000051234 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Tmem253Q3UNB8 Mbp-207ENSMUST00000114674 2108 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Tmem253Q3UNB8 Abcd1-201ENSMUST00000002084 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Tmem253Q3UNB8 Il4ra-201ENSMUST00000033004 5256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Tmem253Q3UNB8 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Tmem253Q3UNB8 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Tmem253Q3UNB8 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Tmem253Q3UNB8 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Tmem253Q3UNB8 Ank3-223ENSMUST00000182557 1569 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Tmem253Q3UNB8 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
Tmem253Q3UNB8 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Tmem253Q3UNB8 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Tmem253Q3UNB8 Espn-213ENSMUST00000105659 3595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Tmem253Q3UNB8 Olfr667-202ENSMUST00000217177 2695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Tmem253Q3UNB8 Tpk1-201ENSMUST00000067888 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Tmem253Q3UNB8 Mcoln2-201ENSMUST00000011152 2520 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Tmem253Q3UNB8 Dmac2-202ENSMUST00000085953 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Tmem253Q3UNB8 Gucy1a2-201ENSMUST00000115733 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Tmem253Q3UNB8 Pigq-201ENSMUST00000026823 3173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Tmem253Q3UNB8 Pgghg-204ENSMUST00000164580 3001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Tmem253Q3UNB8 Gm44414-201ENSMUST00000203660 2109 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
Tmem253Q3UNB8 AW822073-202ENSMUST00000204003 1959 ntAPPRIS P1 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Tmem253Q3UNB8 Psrc1-202ENSMUST00000102629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Tmem253Q3UNB8 Gm26525-201ENSMUST00000180666 3616 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Tmem253Q3UNB8 AC164107.1-201ENSMUST00000227730 2161 ntBASIC12.57□□□□□ -0.4
Tmem253Q3UNB8 Arhgap33-207ENSMUST00000208538 4372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Tmem253Q3UNB8 AC115735.4-201ENSMUST00000227460 1944 ntBASIC12.57□□□□□ -0.4
Tmem253Q3UNB8 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Tmem253Q3UNB8 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Tmem253Q3UNB8 Pphln1-203ENSMUST00000109256 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Tmem253Q3UNB8 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Tmem253Q3UNB8 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Tmem253Q3UNB8 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Tmem253Q3UNB8 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Tmem253Q3UNB8 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Tmem253Q3UNB8 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC12.57□□□□□ -0.4
Tmem253Q3UNB8 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Tmem253Q3UNB8 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.5 ms