Protein–RNA interactions for Protein: Q3UN04

Usp30, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 30, mousemouse

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Length 517 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp30Q3UN04 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Usp30Q3UN04 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Usp30Q3UN04 Sgce-203ENSMUST00000101677 1656 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Usp30Q3UN04 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Usp30Q3UN04 Etv3-202ENSMUST00000119109 5309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Usp30Q3UN04 Pex2-202ENSMUST00000071280 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Usp30Q3UN04 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Usp30Q3UN04 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
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Usp30Q3UN04 Apol7a-201ENSMUST00000010745 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Usp30Q3UN04 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Usp30Q3UN04 Phyh-201ENSMUST00000027975 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Usp30Q3UN04 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Usp30Q3UN04 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Usp30Q3UN04 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Usp30Q3UN04 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
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Usp30Q3UN04 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Usp30Q3UN04 Gm2762-202ENSMUST00000201517 2339 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Usp30Q3UN04 Tmem55a-201ENSMUST00000029875 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
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Usp30Q3UN04 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Usp30Q3UN04 Prss45-201ENSMUST00000011391 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
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Usp30Q3UN04 Sntb2-203ENSMUST00000212524 9945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
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Usp30Q3UN04 Arid5a-208ENSMUST00000137906 5504 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
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Usp30Q3UN04 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
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Usp30Q3UN04 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Usp30Q3UN04 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
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Usp30Q3UN04 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
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Usp30Q3UN04 Med4-201ENSMUST00000022705 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
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Usp30Q3UN04 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Usp30Q3UN04 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Usp30Q3UN04 Sirt3-201ENSMUST00000026559 1461 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Usp30Q3UN04 Eaf2-204ENSMUST00000114829 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
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Usp30Q3UN04 Rpl12-203ENSMUST00000126610 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
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Usp30Q3UN04 Neat1-203ENSMUST00000174829 1030 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
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Usp30Q3UN04 Slc35d2-202ENSMUST00000220792 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
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Usp30Q3UN04 Mettl11b-201ENSMUST00000159679 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Usp30Q3UN04 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Usp30Q3UN04 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Usp30Q3UN04 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Usp30Q3UN04 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Usp30Q3UN04 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
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Usp30Q3UN04 Mypn-202ENSMUST00000218978 1833 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Usp30Q3UN04 Cnot7-201ENSMUST00000034012 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Usp30Q3UN04 Kcnc2-201ENSMUST00000092175 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Usp30Q3UN04 F10-204ENSMUST00000128418 1395 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Usp30Q3UN04 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Usp30Q3UN04 Dlg4-201ENSMUST00000018700 3204 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Usp30Q3UN04 Ptgr2-205ENSMUST00000135001 1286 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Usp30Q3UN04 Mir1982-201ENSMUST00000157368 74 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Usp30Q3UN04 Gm5276-201ENSMUST00000196683 1047 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Usp30Q3UN04 Gm5149-201ENSMUST00000199768 620 ntTSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Usp30Q3UN04 1700123K08Rik-201ENSMUST00000031501 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Usp30Q3UN04 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Usp30Q3UN04 Olfr222-201ENSMUST00000071943 1115 ntAPPRIS P1 BASIC13.88□□□□□ -0.19
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Usp30Q3UN04 Tmem181b-ps-203ENSMUST00000188746 1626 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Usp30Q3UN04 Pcdha11-201ENSMUST00000115658 5359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Usp30Q3UN04 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Usp30Q3UN04 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Usp30Q3UN04 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
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