Protein–RNA interactions for Protein: Q3ULW6

Ccdc33, Coiled-coil domain-containing protein 33, mousemouse

Predictions only

Length 985 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc33Q3ULW6 Tmc8-201ENSMUST00000050874 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc33Q3ULW6 Os9-201ENSMUST00000080975 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc33Q3ULW6 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc33Q3ULW6 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc33Q3ULW6 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc33Q3ULW6 Gm10125-203ENSMUST00000161096 3493 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc33Q3ULW6 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc33Q3ULW6 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc33Q3ULW6 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc33Q3ULW6 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc33Q3ULW6 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc33Q3ULW6 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc33Q3ULW6 Sgce-207ENSMUST00000126151 1522 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc33Q3ULW6 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc33Q3ULW6 Hsd3b3-201ENSMUST00000090743 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc33Q3ULW6 Dera-207ENSMUST00000203693 1446 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc33Q3ULW6 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc33Q3ULW6 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc33Q3ULW6 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc33Q3ULW6 Ndufa13-201ENSMUST00000110167 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc33Q3ULW6 Snap47-202ENSMUST00000120940 1192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc33Q3ULW6 H60b-202ENSMUST00000131558 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc33Q3ULW6 Gm20033-203ENSMUST00000180912 796 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc33Q3ULW6 Gm4804-201ENSMUST00000182234 999 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc33Q3ULW6 Gm27847-201ENSMUST00000183711 107 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc33Q3ULW6 Gm27375-201ENSMUST00000183799 107 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc33Q3ULW6 Gm867-202ENSMUST00000219979 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc33Q3ULW6 Mbtd1-201ENSMUST00000063645 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc33Q3ULW6 Smo-201ENSMUST00000001812 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc33Q3ULW6 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc33Q3ULW6 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc33Q3ULW6 Wdr13-205ENSMUST00000130832 4374 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc33Q3ULW6 Adat1-203ENSMUST00000139820 2762 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc33Q3ULW6 Plekhb1-206ENSMUST00000107047 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc33Q3ULW6 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc33Q3ULW6 Ltbp4-203ENSMUST00000118583 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc33Q3ULW6 Tsku-206ENSMUST00000179780 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc33Q3ULW6 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc33Q3ULW6 Pnck-201ENSMUST00000002087 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc33Q3ULW6 P3h2-201ENSMUST00000039990 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc33Q3ULW6 Fut7-202ENSMUST00000100320 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc33Q3ULW6 Cyp2ab1-205ENSMUST00000182741 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc33Q3ULW6 Acin1-201ENSMUST00000022793 4735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc33Q3ULW6 Gm18222-201ENSMUST00000202416 1387 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc33Q3ULW6 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc33Q3ULW6 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc33Q3ULW6 Gucd1-201ENSMUST00000039796 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc33Q3ULW6 Ace-202ENSMUST00000001964 2418 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc33Q3ULW6 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc33Q3ULW6 Pdia4-201ENSMUST00000077290 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc33Q3ULW6 Pkig-203ENSMUST00000109400 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc33Q3ULW6 Pole-203ENSMUST00000112482 747 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc33Q3ULW6 Car15-201ENSMUST00000118960 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc33Q3ULW6 Gm11814-201ENSMUST00000119515 929 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc33Q3ULW6 Gm26542-201ENSMUST00000180443 1235 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc33Q3ULW6 Net1-207ENSMUST00000223258 597 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc33Q3ULW6 Mal-201ENSMUST00000028853 486 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc33Q3ULW6 Tpd52-204ENSMUST00000094381 1074 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc33Q3ULW6 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc33Q3ULW6 Cdk11b-203ENSMUST00000105600 3170 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc33Q3ULW6 Sema6c-203ENSMUST00000107217 3595 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc33Q3ULW6 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc33Q3ULW6 Tbkbp1-201ENSMUST00000066078 3338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc33Q3ULW6 Pdlim3-203ENSMUST00000210422 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc33Q3ULW6 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc33Q3ULW6 Cabp4-201ENSMUST00000025761 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc33Q3ULW6 Ube2d-ps-205ENSMUST00000142942 1840 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc33Q3ULW6 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc33Q3ULW6 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc33Q3ULW6 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc33Q3ULW6 Gpr137b-202ENSMUST00000220628 3634 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc33Q3ULW6 Eif1ad-201ENSMUST00000025759 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc33Q3ULW6 Erg-206ENSMUST00000122199 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc33Q3ULW6 Rasl10b-203ENSMUST00000164425 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc33Q3ULW6 Rpl36al-203ENSMUST00000110620 757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc33Q3ULW6 Pisd-ps2-202ENSMUST00000142526 1175 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc33Q3ULW6 Gm17409-201ENSMUST00000167423 962 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc33Q3ULW6 Txnl4b-202ENSMUST00000178445 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc33Q3ULW6 Carmn-202ENSMUST00000182244 988 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc33Q3ULW6 1700011B04Rik-206ENSMUST00000221013 824 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc33Q3ULW6 AC125117.1-201ENSMUST00000228121 468 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc33Q3ULW6 AC123645.1-201ENSMUST00000228469 605 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc33Q3ULW6 Fam241b-202ENSMUST00000064050 1096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc33Q3ULW6 Tmem256-201ENSMUST00000094065 492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc33Q3ULW6 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc33Q3ULW6 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc33Q3ULW6 Retsat-205ENSMUST00000176364 1647 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc33Q3ULW6 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ccdc33Q3ULW6 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ccdc33Q3ULW6 Rnaseh2a-210ENSMUST00000147812 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ccdc33Q3ULW6 Tifa-203ENSMUST00000164447 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ccdc33Q3ULW6 Tdrd6-203ENSMUST00000168073 7062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ccdc33Q3ULW6 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ccdc33Q3ULW6 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc33Q3ULW6 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc33Q3ULW6 Adck5-207ENSMUST00000160784 1998 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc33Q3ULW6 Mzf1-204ENSMUST00000182490 2872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc33Q3ULW6 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc33Q3ULW6 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc33Q3ULW6 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.6 ms