Protein–RNA interactions for Protein: Q3UE70

Gm21748, Predicted gene, 21748, mousemouse

Predictions only

Length 102 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21748Q3UE70 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm21748Q3UE70 Scn4b-201ENSMUST00000060125 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm21748Q3UE70 Galnt6-203ENSMUST00000161514 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm21748Q3UE70 Epb41l1-205ENSMUST00000109574 5904 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm21748Q3UE70 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm21748Q3UE70 Amhr2-201ENSMUST00000023809 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm21748Q3UE70 1110028F18Rik-201ENSMUST00000183365 1341 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm21748Q3UE70 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm21748Q3UE70 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm21748Q3UE70 Unc119b-201ENSMUST00000060798 3659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm21748Q3UE70 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm21748Q3UE70 Ppig-201ENSMUST00000040915 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm21748Q3UE70 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm21748Q3UE70 Mob3c-201ENSMUST00000030477 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm21748Q3UE70 Hp1bp3-202ENSMUST00000097836 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm21748Q3UE70 Foxred2-201ENSMUST00000016696 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm21748Q3UE70 Pak1-205ENSMUST00000206984 2794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm21748Q3UE70 Clpb-202ENSMUST00000106998 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm21748Q3UE70 Slc7a7-206ENSMUST00000197440 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm21748Q3UE70 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm21748Q3UE70 Prpf3-201ENSMUST00000015892 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm21748Q3UE70 Hoxd8-203ENSMUST00000151380 557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm21748Q3UE70 Gm9002-201ENSMUST00000178437 499 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm21748Q3UE70 A330069E16Rik-201ENSMUST00000181191 887 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm21748Q3UE70 Agrp-202ENSMUST00000194091 734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm21748Q3UE70 Ighv1-25-201ENSMUST00000195638 345 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm21748Q3UE70 Gm6916-202ENSMUST00000205523 195 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm21748Q3UE70 CT030161.3-201ENSMUST00000218235 367 ntTSL 3 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm21748Q3UE70 AC154846.1-201ENSMUST00000226278 862 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm21748Q3UE70 Nup62-203ENSMUST00000207103 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm21748Q3UE70 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm21748Q3UE70 Rap2b-201ENSMUST00000049064 6793 ntAPPRIS P1 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm21748Q3UE70 Ciart-202ENSMUST00000159739 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm21748Q3UE70 Il18r1-203ENSMUST00000167723 1919 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm21748Q3UE70 Kcnma1-214ENSMUST00000190044 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm21748Q3UE70 Kif3c-205ENSMUST00000220210 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm21748Q3UE70 Ubiad1-201ENSMUST00000051633 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm21748Q3UE70 Sgsm1-201ENSMUST00000048112 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm21748Q3UE70 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm21748Q3UE70 Ints3-202ENSMUST00000071488 4038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm21748Q3UE70 Syt1-201ENSMUST00000064054 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm21748Q3UE70 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm21748Q3UE70 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm21748Q3UE70 Cadps2-209ENSMUST00000142913 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm21748Q3UE70 Adgrg5-205ENSMUST00000166802 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm21748Q3UE70 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm21748Q3UE70 Rnf152-201ENSMUST00000058688 8492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm21748Q3UE70 Ntrk2-208ENSMUST00000225583 2719 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm21748Q3UE70 Tle3-215ENSMUST00000162583 4299 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm21748Q3UE70 Tcf25-208ENSMUST00000212571 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm21748Q3UE70 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm21748Q3UE70 Gprc5c-208ENSMUST00000177952 1809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm21748Q3UE70 Gm16175-201ENSMUST00000128181 248 ntTSL 3 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm21748Q3UE70 Fam219aos-201ENSMUST00000151164 708 ntTSL 2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm21748Q3UE70 Otx2os1-202ENSMUST00000183803 743 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm21748Q3UE70 Mir124-2hg-206ENSMUST00000189754 525 ntTSL 3 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm21748Q3UE70 Gm38197-201ENSMUST00000192320 2122 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm21748Q3UE70 Gm42846-201ENSMUST00000201771 514 ntTSL 3 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm21748Q3UE70 Gm44719-201ENSMUST00000206404 149 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm21748Q3UE70 Il13-201ENSMUST00000020650 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm21748Q3UE70 AC158987.1-201ENSMUST00000214586 961 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm21748Q3UE70 Rnf113a1-201ENSMUST00000046433 1223 ntAPPRIS P1 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm21748Q3UE70 Cobl-208ENSMUST00000172919 2566 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm21748Q3UE70 Socs3-201ENSMUST00000054002 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm21748Q3UE70 BC003965-201ENSMUST00000088307 3022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm21748Q3UE70 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm21748Q3UE70 Apaf1-201ENSMUST00000020157 6577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm21748Q3UE70 Ptp4a2-207ENSMUST00000165853 3382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
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Gm21748Q3UE70 Myg1-202ENSMUST00000113682 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm21748Q3UE70 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm21748Q3UE70 Spns1-201ENSMUST00000032994 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm21748Q3UE70 Cdsn-201ENSMUST00000044804 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm21748Q3UE70 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm21748Q3UE70 Dnm1-214ENSMUST00000201433 3146 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm21748Q3UE70 Ube3a-201ENSMUST00000107537 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm21748Q3UE70 Ccp110-202ENSMUST00000106557 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm21748Q3UE70 Tpr-201ENSMUST00000119161 7480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm21748Q3UE70 March8-213ENSMUST00000203193 4245 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm21748Q3UE70 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm21748Q3UE70 Gm5763-201ENSMUST00000155951 1530 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm21748Q3UE70 Uhrf1bp1l-201ENSMUST00000020112 6448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm21748Q3UE70 Unc5b-203ENSMUST00000218637 3653 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm21748Q3UE70 Trim27-206ENSMUST00000222544 4312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm21748Q3UE70 Mcf2l-207ENSMUST00000110876 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm21748Q3UE70 Mfsd3-201ENSMUST00000019224 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm21748Q3UE70 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm21748Q3UE70 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm21748Q3UE70 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm21748Q3UE70 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm21748Q3UE70 Mbd3-202ENSMUST00000105347 914 ntTSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm21748Q3UE70 Bola2-202ENSMUST00000106369 642 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm21748Q3UE70 Gm15460-201ENSMUST00000118147 391 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm21748Q3UE70 Ldha-ps-201ENSMUST00000119390 995 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm21748Q3UE70 3000002C10Rik-202ENSMUST00000133495 1008 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm21748Q3UE70 Gm11574-201ENSMUST00000139752 946 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm21748Q3UE70 Gm26600-201ENSMUST00000181637 1256 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm21748Q3UE70 Ilkap-208ENSMUST00000187306 377 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm21748Q3UE70 H2-Bl-210ENSMUST00000195833 829 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm21748Q3UE70 Gm6266-201ENSMUST00000203844 806 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.9 ms