Protein–RNA interactions for Protein: Q3U4B1

Ssbp4, Single stranded DNA binding protein 4, isoform CRA_b, mousemouse

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Length 363 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssbp4Q3U4B1 Ccdc8-201ENSMUST00000094805 4809 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ssbp4Q3U4B1 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ssbp4Q3U4B1 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ssbp4Q3U4B1 Trim2-203ENSMUST00000107691 7428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ssbp4Q3U4B1 Hcrtr1-201ENSMUST00000030562 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ssbp4Q3U4B1 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ssbp4Q3U4B1 Gemin5-205ENSMUST00000172035 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ssbp4Q3U4B1 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ssbp4Q3U4B1 Fggy-202ENSMUST00000079223 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ssbp4Q3U4B1 Zc3h13-201ENSMUST00000022577 6151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ssbp4Q3U4B1 Slco3a1-202ENSMUST00000098371 2709 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ssbp4Q3U4B1 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ssbp4Q3U4B1 Rita1-201ENSMUST00000031599 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ssbp4Q3U4B1 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ssbp4Q3U4B1 Eogt-202ENSMUST00000113387 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ssbp4Q3U4B1 Mrps10-202ENSMUST00000119841 1113 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ssbp4Q3U4B1 Tmem80-205ENSMUST00000132061 667 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ssbp4Q3U4B1 Dhrs2-202ENSMUST00000165432 849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ssbp4Q3U4B1 BC023719-201ENSMUST00000174728 978 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ssbp4Q3U4B1 Carmn-202ENSMUST00000182244 988 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ssbp4Q3U4B1 Gm5069-202ENSMUST00000192714 1011 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Ssbp4Q3U4B1 AC162801.1-201ENSMUST00000220612 198 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Ssbp4Q3U4B1 AC130829.1-201ENSMUST00000221548 494 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Ssbp4Q3U4B1 CT030657.3-201ENSMUST00000222707 1200 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Ssbp4Q3U4B1 Nanos3-201ENSMUST00000070102 730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ssbp4Q3U4B1 Olfr373-201ENSMUST00000074540 945 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ssbp4Q3U4B1 Celf5-201ENSMUST00000118763 4391 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ssbp4Q3U4B1 Gprc5c-208ENSMUST00000177952 1809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ssbp4Q3U4B1 Kcnq2-202ENSMUST00000049792 2920 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ssbp4Q3U4B1 Bmp4-201ENSMUST00000074077 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ssbp4Q3U4B1 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ssbp4Q3U4B1 Glmn-202ENSMUST00000082121 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ssbp4Q3U4B1 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ssbp4Q3U4B1 Gm26788-201ENSMUST00000181692 1750 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ssbp4Q3U4B1 Tnn-201ENSMUST00000039178 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ssbp4Q3U4B1 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ssbp4Q3U4B1 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ssbp4Q3U4B1 Rubie-203ENSMUST00000227803 2430 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Ssbp4Q3U4B1 Tspan32-205ENSMUST00000105924 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ssbp4Q3U4B1 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ssbp4Q3U4B1 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ssbp4Q3U4B1 Vangl1-201ENSMUST00000029453 6531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ssbp4Q3U4B1 Osbpl11-201ENSMUST00000039733 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ssbp4Q3U4B1 Taf3-201ENSMUST00000026888 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ssbp4Q3U4B1 2610507B11Rik-201ENSMUST00000010421 7443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ssbp4Q3U4B1 Frmpd4-204ENSMUST00000112149 8456 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ssbp4Q3U4B1 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ssbp4Q3U4B1 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ssbp4Q3U4B1 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ssbp4Q3U4B1 Pip5k1c-201ENSMUST00000045469 4323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ssbp4Q3U4B1 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ssbp4Q3U4B1 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ssbp4Q3U4B1 2900026A02Rik-201ENSMUST00000050125 5876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ssbp4Q3U4B1 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ssbp4Q3U4B1 Dhx29-201ENSMUST00000038574 4682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ssbp4Q3U4B1 Gnas-210ENSMUST00000109095 2059 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ssbp4Q3U4B1 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ssbp4Q3U4B1 Ablim1-202ENSMUST00000099294 6232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ssbp4Q3U4B1 Sgce-205ENSMUST00000115579 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ssbp4Q3U4B1 Morn1-201ENSMUST00000030915 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ssbp4Q3U4B1 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ssbp4Q3U4B1 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ssbp4Q3U4B1 Gm20465-201ENSMUST00000174768 1932 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ssbp4Q3U4B1 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ssbp4Q3U4B1 Etfrf1-206ENSMUST00000111725 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ssbp4Q3U4B1 Sumo2-204ENSMUST00000118155 884 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ssbp4Q3U4B1 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Ssbp4Q3U4B1 Gm10142-201ENSMUST00000179767 363 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
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Ssbp4Q3U4B1 Gm4971-201ENSMUST00000205991 1108 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Ssbp4Q3U4B1 Hddc3-208ENSMUST00000206122 696 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ssbp4Q3U4B1 Pomc-202ENSMUST00000218089 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ssbp4Q3U4B1 AC192088.1-201ENSMUST00000227561 301 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Ssbp4Q3U4B1 Gm8973-201ENSMUST00000079818 315 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ssbp4Q3U4B1 Cybrd1-201ENSMUST00000028403 5339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ssbp4Q3U4B1 Tmtc3-202ENSMUST00000099318 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ssbp4Q3U4B1 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ssbp4Q3U4B1 Nomo1-201ENSMUST00000033121 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ssbp4Q3U4B1 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ssbp4Q3U4B1 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ssbp4Q3U4B1 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ssbp4Q3U4B1 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ssbp4Q3U4B1 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ssbp4Q3U4B1 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ssbp4Q3U4B1 Nfasc-207ENSMUST00000187861 4927 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ssbp4Q3U4B1 Pcdha11-201ENSMUST00000115658 5359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ssbp4Q3U4B1 Lysmd3-202ENSMUST00000224300 4250 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ssbp4Q3U4B1 Slc25a46-201ENSMUST00000060396 4371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ssbp4Q3U4B1 Thap2-202ENSMUST00000218842 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ssbp4Q3U4B1 Snrpa-202ENSMUST00000122202 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ssbp4Q3U4B1 Gm11978-202ENSMUST00000127510 1303 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ssbp4Q3U4B1 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ssbp4Q3U4B1 Lamb2-201ENSMUST00000065014 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ssbp4Q3U4B1 Sgce-203ENSMUST00000101677 1656 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ssbp4Q3U4B1 Gucy2e-202ENSMUST00000108664 4415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ssbp4Q3U4B1 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ssbp4Q3U4B1 Gm36065-202ENSMUST00000219654 1424 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ssbp4Q3U4B1 Aqp3-201ENSMUST00000055327 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ssbp4Q3U4B1 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ssbp4Q3U4B1 Socs5-201ENSMUST00000041369 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
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