Protein–RNA interactions for Protein: Q3U285

Lcorl, Ligand-dependent nuclear receptor corepressor-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 600 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LcorlQ3U285 Diaph1-204ENSMUST00000115631 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
LcorlQ3U285 Rbmx-202ENSMUST00000114726 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
LcorlQ3U285 Krt36-201ENSMUST00000107416 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
LcorlQ3U285 Gm42878-202ENSMUST00000200170 4783 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
LcorlQ3U285 Arhgap28-201ENSMUST00000024840 5322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
LcorlQ3U285 Atp2a3-203ENSMUST00000108485 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
LcorlQ3U285 Armcx1-204ENSMUST00000113198 2085 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
LcorlQ3U285 Plcd1-203ENSMUST00000214470 2706 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
LcorlQ3U285 Cacna1b-205ENSMUST00000114447 6987 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
LcorlQ3U285 Thap2-202ENSMUST00000218842 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
LcorlQ3U285 Cggbp1-201ENSMUST00000067744 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
LcorlQ3U285 Pja1-202ENSMUST00000113790 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
LcorlQ3U285 Gm8410-201ENSMUST00000117225 605 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
LcorlQ3U285 Rpl27a-203ENSMUST00000143107 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
LcorlQ3U285 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
LcorlQ3U285 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
LcorlQ3U285 Gm28630-201ENSMUST00000187806 498 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
LcorlQ3U285 9430085M18Rik-201ENSMUST00000198824 1178 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
LcorlQ3U285 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
LcorlQ3U285 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC13.65□□□□□ -0.22
LcorlQ3U285 Kcnk13-202ENSMUST00000160413 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
LcorlQ3U285 Arhgap33-203ENSMUST00000207858 4337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
LcorlQ3U285 Sept1-202ENSMUST00000106314 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
LcorlQ3U285 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
LcorlQ3U285 Gpc2-201ENSMUST00000014089 2514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
LcorlQ3U285 Sun1-202ENSMUST00000078690 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
LcorlQ3U285 Zbtb5-202ENSMUST00000107817 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
LcorlQ3U285 Slc25a54-201ENSMUST00000029478 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
LcorlQ3U285 Sirt5-207ENSMUST00000221515 1793 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
LcorlQ3U285 Naa30-201ENSMUST00000037362 4464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
LcorlQ3U285 Col6a2-202ENSMUST00000105413 4653 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
LcorlQ3U285 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
LcorlQ3U285 Kctd20-203ENSMUST00000118762 3839 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
LcorlQ3U285 Igsf9b-202ENSMUST00000133213 4239 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
LcorlQ3U285 Mocs1-204ENSMUST00000173033 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
LcorlQ3U285 Amz1-201ENSMUST00000060918 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
LcorlQ3U285 Inhba-201ENSMUST00000042603 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
LcorlQ3U285 Dnm1-203ENSMUST00000113350 3258 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.23
LcorlQ3U285 Cyfip1-201ENSMUST00000032629 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.23
LcorlQ3U285 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
LcorlQ3U285 Ikzf4-201ENSMUST00000133342 5150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
LcorlQ3U285 Zfp385b-203ENSMUST00000111830 2642 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
LcorlQ3U285 Nos1ap-202ENSMUST00000160456 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
LcorlQ3U285 Ripk4-201ENSMUST00000019386 3541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
LcorlQ3U285 Nr2f2-201ENSMUST00000032768 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
LcorlQ3U285 Camk2d-202ENSMUST00000066466 4075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
LcorlQ3U285 Inpp4a-209ENSMUST00000140264 3676 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
LcorlQ3U285 Cnnm2-202ENSMUST00000099373 3558 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
LcorlQ3U285 1600014C10Rik-205ENSMUST00000178876 3283 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
LcorlQ3U285 Peli3-202ENSMUST00000120475 2988 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
LcorlQ3U285 Adam15-201ENSMUST00000029676 2975 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
LcorlQ3U285 B230319C09Rik-201ENSMUST00000063376 1689 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
LcorlQ3U285 Adamts20-204ENSMUST00000155907 6886 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
LcorlQ3U285 Kif5c-201ENSMUST00000028102 6856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
LcorlQ3U285 Mir1897-201ENSMUST00000122581 272 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
LcorlQ3U285 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
LcorlQ3U285 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
LcorlQ3U285 Gm29741-201ENSMUST00000192667 421 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
LcorlQ3U285 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
LcorlQ3U285 Gm33337-201ENSMUST00000219594 228 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
LcorlQ3U285 Rnf113a1-201ENSMUST00000046433 1223 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
LcorlQ3U285 Cox6b1-201ENSMUST00000075738 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
LcorlQ3U285 Cenpm-201ENSMUST00000089155 1109 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
LcorlQ3U285 Lrfn2-201ENSMUST00000046254 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
LcorlQ3U285 Eya4-206ENSMUST00000219315 3100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
LcorlQ3U285 Pigg-202ENSMUST00000118910 3030 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
LcorlQ3U285 Gemin5-205ENSMUST00000172035 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
LcorlQ3U285 Cyp11a1-201ENSMUST00000034874 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
LcorlQ3U285 Bnc2-215ENSMUST00000176691 3385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
LcorlQ3U285 Glud1-201ENSMUST00000022322 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
LcorlQ3U285 Tcn2-204ENSMUST00000109990 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
LcorlQ3U285 Gm37133-201ENSMUST00000192705 1922 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
LcorlQ3U285 Hnrnpa1-201ENSMUST00000036004 1918 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
LcorlQ3U285 Ppt2-201ENSMUST00000064953 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
LcorlQ3U285 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
LcorlQ3U285 Zfpm2-201ENSMUST00000053467 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
LcorlQ3U285 Awat2-201ENSMUST00000033567 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
LcorlQ3U285 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
LcorlQ3U285 P4ha1-202ENSMUST00000092512 2387 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
LcorlQ3U285 Nt5c3b-202ENSMUST00000092689 1344 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
LcorlQ3U285 Tsn-201ENSMUST00000027623 7063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
LcorlQ3U285 Klf12-201ENSMUST00000097079 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
LcorlQ3U285 Eif4e3-201ENSMUST00000032151 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
LcorlQ3U285 Ift52-201ENSMUST00000018002 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
LcorlQ3U285 Kif9-204ENSMUST00000198043 2233 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
LcorlQ3U285 Ero1lb-202ENSMUST00000220811 3341 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
LcorlQ3U285 Eml3-201ENSMUST00000096241 3322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
LcorlQ3U285 R3hcc1-206ENSMUST00000216152 1467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
LcorlQ3U285 Efemp1-201ENSMUST00000020759 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
LcorlQ3U285 Gps1-201ENSMUST00000100134 1925 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
LcorlQ3U285 Tspan32-206ENSMUST00000105925 1376 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
LcorlQ3U285 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
LcorlQ3U285 Mboat2-201ENSMUST00000078902 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
LcorlQ3U285 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
LcorlQ3U285 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
LcorlQ3U285 Abhd11os-201ENSMUST00000136022 604 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
LcorlQ3U285 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
LcorlQ3U285 Gm10044-204ENSMUST00000170177 659 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
LcorlQ3U285 Gm3809-201ENSMUST00000180973 1006 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
LcorlQ3U285 Dap-204ENSMUST00000186425 597 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.8 ms