Protein–RNA interactions for Protein: Q3U0Y2

Tmem35b, Transmembrane protein 35B, mousemouse

Predictions only

Length 150 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem35bQ3U0Y2 Pdgfc-201ENSMUST00000029652 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Tmem35bQ3U0Y2 Prkacb-202ENSMUST00000102515 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Tmem35bQ3U0Y2 E2f3-203ENSMUST00000221536 4597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Tmem35bQ3U0Y2 E2f3-204ENSMUST00000222730 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Tmem35bQ3U0Y2 AC238940.1-201ENSMUST00000225106 1858 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Tmem35bQ3U0Y2 Cog3-201ENSMUST00000049168 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Tmem35bQ3U0Y2 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Tmem35bQ3U0Y2 Kpnb1-201ENSMUST00000001479 5894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Tmem35bQ3U0Y2 Armcx6-202ENSMUST00000113194 2120 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Tmem35bQ3U0Y2 Slc19a2-202ENSMUST00000159230 3432 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Tmem35bQ3U0Y2 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Tmem35bQ3U0Y2 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Tmem35bQ3U0Y2 3000002C10Rik-202ENSMUST00000133495 1008 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Tmem35bQ3U0Y2 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Tmem35bQ3U0Y2 Gm28630-201ENSMUST00000187806 498 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Tmem35bQ3U0Y2 4930502C17Rik-201ENSMUST00000200282 948 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Tmem35bQ3U0Y2 AC156016.3-201ENSMUST00000228623 344 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Tmem35bQ3U0Y2 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Tmem35bQ3U0Y2 Calcr-203ENSMUST00000168592 2064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Tmem35bQ3U0Y2 Pias3-202ENSMUST00000107076 2858 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Tmem35bQ3U0Y2 Lpcat1-201ENSMUST00000022099 3675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Tmem35bQ3U0Y2 Fbxw9-201ENSMUST00000095220 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Tmem35bQ3U0Y2 Ddx27-205ENSMUST00000150571 2151 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Tmem35bQ3U0Y2 Slc25a14-201ENSMUST00000033431 1760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Tmem35bQ3U0Y2 E230029C05Rik-202ENSMUST00000207458 2445 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Tmem35bQ3U0Y2 Bcl2l1-201ENSMUST00000007803 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Tmem35bQ3U0Y2 Phldb1-213ENSMUST00000144251 3589 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Tmem35bQ3U0Y2 Rnase10-201ENSMUST00000022424 1629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Tmem35bQ3U0Y2 Mark2-201ENSMUST00000025921 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Tmem35bQ3U0Y2 P3h2-201ENSMUST00000039990 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Tmem35bQ3U0Y2 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Tmem35bQ3U0Y2 Pard3-222ENSMUST00000162536 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Tmem35bQ3U0Y2 Kbtbd7-201ENSMUST00000061222 4526 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Tmem35bQ3U0Y2 Gbgt1-203ENSMUST00000163121 1335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Tmem35bQ3U0Y2 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Tmem35bQ3U0Y2 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Tmem35bQ3U0Y2 Bmp4-201ENSMUST00000074077 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Tmem35bQ3U0Y2 Ppp1r18-205ENSMUST00000187690 3185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Tmem35bQ3U0Y2 Gm6871-201ENSMUST00000073410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Tmem35bQ3U0Y2 Srrm1-203ENSMUST00000105861 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Tmem35bQ3U0Y2 Mfsd4a-205ENSMUST00000144548 3288 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Tmem35bQ3U0Y2 H3f3b-202ENSMUST00000106454 2514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Tmem35bQ3U0Y2 Lingo1-202ENSMUST00000114247 2287 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Tmem35bQ3U0Y2 Pcdha12-201ENSMUST00000047614 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Tmem35bQ3U0Y2 Ctgf-201ENSMUST00000020171 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Tmem35bQ3U0Y2 Zkscan17-201ENSMUST00000013262 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Tmem35bQ3U0Y2 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Tmem35bQ3U0Y2 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Tmem35bQ3U0Y2 Gm15917-201ENSMUST00000162771 487 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Tmem35bQ3U0Y2 Hsf4-207ENSMUST00000174837 1251 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Tmem35bQ3U0Y2 Gm24158-201ENSMUST00000175263 71 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Tmem35bQ3U0Y2 Gm33320-201ENSMUST00000192232 530 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Tmem35bQ3U0Y2 AC166997.1-201ENSMUST00000225122 572 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Tmem35bQ3U0Y2 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Tmem35bQ3U0Y2 Prss38-201ENSMUST00000061481 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Tmem35bQ3U0Y2 Atp5h-202ENSMUST00000073791 659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Tmem35bQ3U0Y2 Rpusd2-201ENSMUST00000028796 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Tmem35bQ3U0Y2 Adal-205ENSMUST00000119031 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Tmem35bQ3U0Y2 Kcnh7-202ENSMUST00000112452 2849 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Tmem35bQ3U0Y2 Mafk-201ENSMUST00000018287 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Tmem35bQ3U0Y2 Ubap2l-204ENSMUST00000195995 3516 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Tmem35bQ3U0Y2 Zfp367-201ENSMUST00000059817 3532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Tmem35bQ3U0Y2 Gm2762-202ENSMUST00000201517 2339 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Tmem35bQ3U0Y2 March8-213ENSMUST00000203193 4245 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Tmem35bQ3U0Y2 Slc52a3-202ENSMUST00000109858 2094 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Tmem35bQ3U0Y2 Arhgef40-201ENSMUST00000093813 5621 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Tmem35bQ3U0Y2 Ctsa-203ENSMUST00000103093 2534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Tmem35bQ3U0Y2 Hid1-201ENSMUST00000044152 3236 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Tmem35bQ3U0Y2 Spef1-202ENSMUST00000110218 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Tmem35bQ3U0Y2 Col26a1-201ENSMUST00000057497 2724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Tmem35bQ3U0Y2 Mir17hg-201ENSMUST00000134140 3536 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tmem35bQ3U0Y2 Mutyh-201ENSMUST00000102699 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tmem35bQ3U0Y2 Fam131b-202ENSMUST00000095974 3992 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tmem35bQ3U0Y2 Gm43364-201ENSMUST00000196046 3274 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Tmem35bQ3U0Y2 Slc22a2-201ENSMUST00000046959 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tmem35bQ3U0Y2 Pkp3-202ENSMUST00000106039 2919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tmem35bQ3U0Y2 Kcnma1-214ENSMUST00000190044 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tmem35bQ3U0Y2 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tmem35bQ3U0Y2 Adsl-206ENSMUST00000168756 1439 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tmem35bQ3U0Y2 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tmem35bQ3U0Y2 Rgs16-201ENSMUST00000027748 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tmem35bQ3U0Y2 Hspb7-201ENSMUST00000102486 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tmem35bQ3U0Y2 Psmd8-207ENSMUST00000209034 1983 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tmem35bQ3U0Y2 Emc3-201ENSMUST00000032425 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tmem35bQ3U0Y2 Ace-202ENSMUST00000001964 2418 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tmem35bQ3U0Y2 Kifc3-202ENSMUST00000169353 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tmem35bQ3U0Y2 Ap2a1-201ENSMUST00000085399 3442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tmem35bQ3U0Y2 Hps5-201ENSMUST00000014562 4953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tmem35bQ3U0Y2 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tmem35bQ3U0Y2 Arl4a-205ENSMUST00000146905 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tmem35bQ3U0Y2 Gm37644-201ENSMUST00000192190 2270 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Tmem35bQ3U0Y2 Hras-203ENSMUST00000124314 1073 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tmem35bQ3U0Y2 Ilkap-208ENSMUST00000187306 377 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tmem35bQ3U0Y2 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tmem35bQ3U0Y2 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tmem35bQ3U0Y2 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tmem35bQ3U0Y2 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tmem35bQ3U0Y2 Tnk1-203ENSMUST00000108628 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tmem35bQ3U0Y2 Arid4b-202ENSMUST00000110533 3020 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tmem35bQ3U0Y2 Kcnf1-201ENSMUST00000170580 4789 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.3 ms