Protein–RNA interactions for Protein: Q3TX51

Lrrc28, Leucine-rich repeat-containing protein 28, mousemouse

Predictions only

Length 367 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc28Q3TX51 Med10-201ENSMUST00000022089 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lrrc28Q3TX51 AC149294.4-201ENSMUST00000227870 882 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Lrrc28Q3TX51 Hdhd3-201ENSMUST00000037820 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lrrc28Q3TX51 Upk3bl-201ENSMUST00000006303 1045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lrrc28Q3TX51 Mir497b-201ENSMUST00000093601 125 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Lrrc28Q3TX51 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lrrc28Q3TX51 Hps5-201ENSMUST00000014562 4953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lrrc28Q3TX51 Cnot7-201ENSMUST00000034012 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lrrc28Q3TX51 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lrrc28Q3TX51 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lrrc28Q3TX51 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lrrc28Q3TX51 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lrrc28Q3TX51 Ankrd50-201ENSMUST00000094300 1944 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lrrc28Q3TX51 Ank1-208ENSMUST00000121075 1740 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lrrc28Q3TX51 Gm9347-201ENSMUST00000211473 1607 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Lrrc28Q3TX51 Kcnf1-201ENSMUST00000170580 4789 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lrrc28Q3TX51 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lrrc28Q3TX51 Rnf152-201ENSMUST00000058688 8492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lrrc28Q3TX51 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lrrc28Q3TX51 Gm36065-202ENSMUST00000219654 1424 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lrrc28Q3TX51 Opn4-201ENSMUST00000022331 2156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lrrc28Q3TX51 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Lrrc28Q3TX51 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Lrrc28Q3TX51 Synj1-203ENSMUST00000121759 7090 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Lrrc28Q3TX51 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Lrrc28Q3TX51 Syt6-203ENSMUST00000118117 1856 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Lrrc28Q3TX51 4932422M17Rik-201ENSMUST00000195992 2639 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Lrrc28Q3TX51 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Lrrc28Q3TX51 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Lrrc28Q3TX51 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Lrrc28Q3TX51 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Lrrc28Q3TX51 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Lrrc28Q3TX51 Syce1-201ENSMUST00000026553 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Lrrc28Q3TX51 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Lrrc28Q3TX51 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Lrrc28Q3TX51 Lman2-201ENSMUST00000021940 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Lrrc28Q3TX51 Fgfr3-210ENSMUST00000169212 4245 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Lrrc28Q3TX51 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Lrrc28Q3TX51 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Lrrc28Q3TX51 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Lrrc28Q3TX51 Gnb5-202ENSMUST00000213990 1803 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Lrrc28Q3TX51 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Lrrc28Q3TX51 Ggt6-203ENSMUST00000108499 874 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Lrrc28Q3TX51 Gm14127-201ENSMUST00000117906 678 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Lrrc28Q3TX51 Map2k3os-201ENSMUST00000123544 1291 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Lrrc28Q3TX51 Cpne8-201ENSMUST00000014777 697 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Lrrc28Q3TX51 Gm15494-202ENSMUST00000171665 451 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Lrrc28Q3TX51 Gm21887-201ENSMUST00000178789 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Lrrc28Q3TX51 Lrcol1-202ENSMUST00000185691 764 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Lrrc28Q3TX51 Gm29417-201ENSMUST00000188160 571 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Lrrc28Q3TX51 Gm37748-201ENSMUST00000194379 1140 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Lrrc28Q3TX51 Hddc3-208ENSMUST00000206122 696 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Lrrc28Q3TX51 Gm19078-201ENSMUST00000206311 727 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Lrrc28Q3TX51 Lcmt1-204ENSMUST00000206574 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Lrrc28Q3TX51 Gm7446-201ENSMUST00000221035 1240 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Lrrc28Q3TX51 CT030657.3-201ENSMUST00000222707 1200 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Lrrc28Q3TX51 Dctn6-201ENSMUST00000033913 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Lrrc28Q3TX51 Ndufa4l2-201ENSMUST00000035735 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Lrrc28Q3TX51 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Lrrc28Q3TX51 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Lrrc28Q3TX51 Mvk-202ENSMUST00000112239 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Lrrc28Q3TX51 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Lrrc28Q3TX51 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Lrrc28Q3TX51 Kcnq1-202ENSMUST00000185383 1535 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Lrrc28Q3TX51 Slc35b1-201ENSMUST00000021243 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Lrrc28Q3TX51 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Lrrc28Q3TX51 Gm33195-201ENSMUST00000220827 2337 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Lrrc28Q3TX51 Tle3-210ENSMUST00000161207 2592 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Lrrc28Q3TX51 Slco3a1-202ENSMUST00000098371 2709 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Lrrc28Q3TX51 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Lrrc28Q3TX51 Epb41l1-205ENSMUST00000109574 5904 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Lrrc28Q3TX51 Olfr683-202ENSMUST00000209879 3841 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Lrrc28Q3TX51 Cenpt-201ENSMUST00000040776 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Lrrc28Q3TX51 Lmx1b-201ENSMUST00000041730 4790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Lrrc28Q3TX51 Anks1b-231ENSMUST00000183136 2786 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Lrrc28Q3TX51 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Lrrc28Q3TX51 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Lrrc28Q3TX51 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Lrrc28Q3TX51 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Lrrc28Q3TX51 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Lrrc28Q3TX51 Rbbp7-201ENSMUST00000033720 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Lrrc28Q3TX51 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Lrrc28Q3TX51 Nedd8-201ENSMUST00000010520 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Lrrc28Q3TX51 Eogt-202ENSMUST00000113387 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Lrrc28Q3TX51 Gm15755-201ENSMUST00000133698 659 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Lrrc28Q3TX51 Gm16122-201ENSMUST00000142625 1158 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Lrrc28Q3TX51 Gm15948-201ENSMUST00000150616 403 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Lrrc28Q3TX51 Gm17634-201ENSMUST00000181383 1285 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Lrrc28Q3TX51 Tm2d3-207ENSMUST00000206517 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Lrrc28Q3TX51 Tdrp-206ENSMUST00000210414 323 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Lrrc28Q3TX51 Gm11427-203ENSMUST00000215482 1203 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Lrrc28Q3TX51 Ccdc159-204ENSMUST00000216710 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Lrrc28Q3TX51 1700011B04Rik-206ENSMUST00000221013 824 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Lrrc28Q3TX51 AC150560.1-201ENSMUST00000227731 1187 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Lrrc28Q3TX51 A730061H03Rik-201ENSMUST00000066106 465 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Lrrc28Q3TX51 Wdr83-201ENSMUST00000093357 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Lrrc28Q3TX51 Catip-201ENSMUST00000097697 2101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Lrrc28Q3TX51 Tada3-203ENSMUST00000099118 1282 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Lrrc28Q3TX51 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Lrrc28Q3TX51 Evc-201ENSMUST00000031005 4325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.1 ms