Protein–RNA interactions for Protein: Q3TVC7

Ccndbp1, Cyclin-D1-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 356 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccndbp1Q3TVC7 Hlcs-202ENSMUST00000163193 5371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Ccndbp1Q3TVC7 Acap2-201ENSMUST00000058033 6493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Ccndbp1Q3TVC7 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Ccndbp1Q3TVC7 Trib1-202ENSMUST00000118228 3081 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Ccndbp1Q3TVC7 Tnfaip8-207ENSMUST00000148159 1921 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Ccndbp1Q3TVC7 Top1mt-201ENSMUST00000000958 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Ccndbp1Q3TVC7 Adamts8-201ENSMUST00000068135 3631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Ccndbp1Q3TVC7 Dlg4-201ENSMUST00000018700 3204 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Ccndbp1Q3TVC7 Sgo2a-201ENSMUST00000027202 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Ccndbp1Q3TVC7 Spata5-209ENSMUST00000198968 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Ccndbp1Q3TVC7 Plch2-201ENSMUST00000105631 5053 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Ccndbp1Q3TVC7 Mir698-201ENSMUST00000102164 109 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
Ccndbp1Q3TVC7 Maged2-204ENSMUST00000112700 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Ccndbp1Q3TVC7 Tmem219-202ENSMUST00000119781 1118 ntTSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Ccndbp1Q3TVC7 Tmem219-204ENSMUST00000121532 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Ccndbp1Q3TVC7 Zfp715-201ENSMUST00000012796 907 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Ccndbp1Q3TVC7 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Ccndbp1Q3TVC7 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Ccndbp1Q3TVC7 AC153872.1-201ENSMUST00000199539 128 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
Ccndbp1Q3TVC7 Plpp4-203ENSMUST00000205896 714 ntTSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Ccndbp1Q3TVC7 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Ccndbp1Q3TVC7 Aif1-201ENSMUST00000025257 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Ccndbp1Q3TVC7 Tmem219-201ENSMUST00000032926 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Ccndbp1Q3TVC7 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Ccndbp1Q3TVC7 Atp5h-202ENSMUST00000073791 659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Ccndbp1Q3TVC7 Sipa1-202ENSMUST00000080824 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Ccndbp1Q3TVC7 Gm37691-201ENSMUST00000192147 2573 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
Ccndbp1Q3TVC7 Ppt2-201ENSMUST00000064953 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Ccndbp1Q3TVC7 Ncbp1-201ENSMUST00000030014 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Ccndbp1Q3TVC7 Tmprss9-201ENSMUST00000105333 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Ccndbp1Q3TVC7 Tfap2a-201ENSMUST00000021787 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Ccndbp1Q3TVC7 Atp6ap1-201ENSMUST00000019231 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Ccndbp1Q3TVC7 Dpysl5-202ENSMUST00000101442 1309 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Ccndbp1Q3TVC7 Gbgt1-203ENSMUST00000163121 1335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Ccndbp1Q3TVC7 Sirt5-207ENSMUST00000221515 1793 ntTSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Ccndbp1Q3TVC7 Ttc8-202ENSMUST00000085109 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Ccndbp1Q3TVC7 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Ccndbp1Q3TVC7 Grin3a-202ENSMUST00000093859 7491 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Ccndbp1Q3TVC7 Gpr45-203ENSMUST00000179766 3776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Ccndbp1Q3TVC7 Gm8337-201ENSMUST00000187358 1938 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
Ccndbp1Q3TVC7 Emb-201ENSMUST00000022242 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Ccndbp1Q3TVC7 Ppp1r12b-209ENSMUST00000168381 3621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Ccndbp1Q3TVC7 Steap2-201ENSMUST00000015797 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Ccndbp1Q3TVC7 Nek7-201ENSMUST00000027642 3737 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Ccndbp1Q3TVC7 Myt1l-204ENSMUST00000218198 2735 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Ccndbp1Q3TVC7 Kctd20-203ENSMUST00000118762 3839 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Ccndbp1Q3TVC7 Nob1-201ENSMUST00000003946 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Ccndbp1Q3TVC7 Gdf10-201ENSMUST00000168727 5210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Ccndbp1Q3TVC7 Tdg-208ENSMUST00000151390 3502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Ccndbp1Q3TVC7 Chtop-206ENSMUST00000107344 2972 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Ccndbp1Q3TVC7 Plod2-201ENSMUST00000070522 3649 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Ccndbp1Q3TVC7 Pigg-202ENSMUST00000118910 3030 ntTSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Ccndbp1Q3TVC7 Trim27-206ENSMUST00000222544 4312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Ccndbp1Q3TVC7 Ncor2-203ENSMUST00000111393 8661 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Ccndbp1Q3TVC7 Lamb2-201ENSMUST00000065014 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Ccndbp1Q3TVC7 Osbpl9-202ENSMUST00000084366 3134 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Ccndbp1Q3TVC7 Tbl1xr1-203ENSMUST00000193734 8237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Ccndbp1Q3TVC7 Lamtor2-202ENSMUST00000119002 568 ntTSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Ccndbp1Q3TVC7 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
Ccndbp1Q3TVC7 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
Ccndbp1Q3TVC7 Gm10044-204ENSMUST00000170177 659 ntTSL 3 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Ccndbp1Q3TVC7 Gm27430-201ENSMUST00000184585 107 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
Ccndbp1Q3TVC7 Gm21470-201ENSMUST00000187680 696 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
Ccndbp1Q3TVC7 Gm44333-201ENSMUST00000197168 107 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
Ccndbp1Q3TVC7 Tmem86b-204ENSMUST00000206610 522 ntTSL 3 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Ccndbp1Q3TVC7 AC154595.3-201ENSMUST00000224579 384 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
Ccndbp1Q3TVC7 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Ccndbp1Q3TVC7 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Ccndbp1Q3TVC7 Hist1h2aa-201ENSMUST00000072391 390 ntAPPRIS P1 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Ccndbp1Q3TVC7 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Ccndbp1Q3TVC7 Entpd2-201ENSMUST00000028328 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Ccndbp1Q3TVC7 Cobl-208ENSMUST00000172919 2566 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Ccndbp1Q3TVC7 Frmpd4-204ENSMUST00000112149 8456 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Ccndbp1Q3TVC7 Dnmt3b-206ENSMUST00000103151 3956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Ccndbp1Q3TVC7 Slc6a7-201ENSMUST00000025520 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Ccndbp1Q3TVC7 Fut7-202ENSMUST00000100320 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Ccndbp1Q3TVC7 Dnaaf5-201ENSMUST00000026975 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Ccndbp1Q3TVC7 Pbrm1-203ENSMUST00000052239 5065 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Ccndbp1Q3TVC7 Litaf-201ENSMUST00000023143 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Ccndbp1Q3TVC7 Noct-203ENSMUST00000167780 2992 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Ccndbp1Q3TVC7 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Ccndbp1Q3TVC7 Fnbp1-209ENSMUST00000113562 4515 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Ccndbp1Q3TVC7 Dapk1-201ENSMUST00000044083 5304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Ccndbp1Q3TVC7 Eya4-206ENSMUST00000219315 3100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Ccndbp1Q3TVC7 Gnai1-201ENSMUST00000074694 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Ccndbp1Q3TVC7 Trim32-202ENSMUST00000107366 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Ccndbp1Q3TVC7 Mff-201ENSMUST00000073025 1706 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Ccndbp1Q3TVC7 Tcirg1-201ENSMUST00000001801 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Ccndbp1Q3TVC7 Rbm47-201ENSMUST00000094756 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Ccndbp1Q3TVC7 Gm14752-201ENSMUST00000120719 2075 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
Ccndbp1Q3TVC7 Vamp8-202ENSMUST00000142613 2076 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Ccndbp1Q3TVC7 Kmt5c-203ENSMUST00000108583 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Ccndbp1Q3TVC7 Arfgap1-203ENSMUST00000108860 2326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Ccndbp1Q3TVC7 Rnf114-201ENSMUST00000078050 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Ccndbp1Q3TVC7 Shf-202ENSMUST00000110530 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Ccndbp1Q3TVC7 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Ccndbp1Q3TVC7 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Ccndbp1Q3TVC7 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
Ccndbp1Q3TVC7 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Ccndbp1Q3TVC7 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.5 ms