Protein–RNA interactions for Protein: Q3TTP0

Shcbp1l, Testicular spindle-associated protein SHCBP1L, mousemouse

Predictions only

Length 639 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shcbp1lQ3TTP0 Gm13883-201ENSMUST00000150450 1404 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Shcbp1lQ3TTP0 Pde4a-202ENSMUST00000039413 4653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Shcbp1lQ3TTP0 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Shcbp1lQ3TTP0 Urm1-201ENSMUST00000091142 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Shcbp1lQ3TTP0 Alg10b-201ENSMUST00000100309 3727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Shcbp1lQ3TTP0 Jaml-204ENSMUST00000215880 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Shcbp1lQ3TTP0 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Shcbp1lQ3TTP0 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
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Shcbp1lQ3TTP0 Gm12490-201ENSMUST00000120255 560 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Shcbp1lQ3TTP0 Gm16000-201ENSMUST00000146657 447 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Shcbp1lQ3TTP0 Gm20412-201ENSMUST00000173249 633 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Shcbp1lQ3TTP0 Gm5354-201ENSMUST00000182417 973 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Shcbp1lQ3TTP0 Atp5h-202ENSMUST00000073791 659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Shcbp1lQ3TTP0 Hist1h3b-201ENSMUST00000091703 620 ntAPPRIS P1 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Shcbp1lQ3TTP0 Rbm34-201ENSMUST00000045994 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Shcbp1lQ3TTP0 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Shcbp1lQ3TTP0 Gm43738-201ENSMUST00000200659 2635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Shcbp1lQ3TTP0 Olfr56-201ENSMUST00000056759 1925 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Shcbp1lQ3TTP0 Gm37240-203ENSMUST00000154148 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Shcbp1lQ3TTP0 Pcdh7-203ENSMUST00000191837 8785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Shcbp1lQ3TTP0 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Shcbp1lQ3TTP0 Zfp365-201ENSMUST00000064656 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Shcbp1lQ3TTP0 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Shcbp1lQ3TTP0 Bcl11b-201ENSMUST00000066060 8111 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Shcbp1lQ3TTP0 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Shcbp1lQ3TTP0 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Shcbp1lQ3TTP0 Iffo2-201ENSMUST00000040023 5227 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Shcbp1lQ3TTP0 Cfap157-201ENSMUST00000102813 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Shcbp1lQ3TTP0 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Shcbp1lQ3TTP0 Mpped1-203ENSMUST00000109470 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Shcbp1lQ3TTP0 Ptprn2-201ENSMUST00000070733 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Shcbp1lQ3TTP0 Tppp3-203ENSMUST00000177126 1396 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Shcbp1lQ3TTP0 Pde10a-202ENSMUST00000089085 7717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Shcbp1lQ3TTP0 Kmt2e-202ENSMUST00000115128 7317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
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Shcbp1lQ3TTP0 Tle3-215ENSMUST00000162583 4299 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Shcbp1lQ3TTP0 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Shcbp1lQ3TTP0 Kcnq1-201ENSMUST00000009689 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Shcbp1lQ3TTP0 Mob1a-202ENSMUST00000055261 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Shcbp1lQ3TTP0 Heatr3-201ENSMUST00000034079 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Shcbp1lQ3TTP0 Safb2-201ENSMUST00000075510 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Shcbp1lQ3TTP0 Ins2-205ENSMUST00000105933 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Shcbp1lQ3TTP0 Ins2-206ENSMUST00000105934 480 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.98□□□□□ -0.17
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Shcbp1lQ3TTP0 Fcnb-202ENSMUST00000117486 873 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Shcbp1lQ3TTP0 E130201H02Rik-201ENSMUST00000123576 851 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Shcbp1lQ3TTP0 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Shcbp1lQ3TTP0 Spata3-209ENSMUST00000152501 743 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Shcbp1lQ3TTP0 Unkl-205ENSMUST00000161679 1053 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
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Shcbp1lQ3TTP0 9430085M18Rik-201ENSMUST00000198824 1178 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Shcbp1lQ3TTP0 Gm6745-201ENSMUST00000199216 526 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Shcbp1lQ3TTP0 Gm40493-201ENSMUST00000210223 400 ntTSL 3 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Shcbp1lQ3TTP0 Prrg2-207ENSMUST00000210500 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
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Shcbp1lQ3TTP0 Gm7653-201ENSMUST00000214567 508 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Shcbp1lQ3TTP0 Gm18624-201ENSMUST00000220966 658 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Shcbp1lQ3TTP0 Tmem179-202ENSMUST00000222836 521 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Shcbp1lQ3TTP0 Lamtor1-201ENSMUST00000033131 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Shcbp1lQ3TTP0 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Shcbp1lQ3TTP0 Arrdc5-201ENSMUST00000097303 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Shcbp1lQ3TTP0 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Shcbp1lQ3TTP0 Syt13-201ENSMUST00000028648 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Shcbp1lQ3TTP0 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Shcbp1lQ3TTP0 Zfp296-201ENSMUST00000108453 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
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Shcbp1lQ3TTP0 Ascc1-201ENSMUST00000050516 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Shcbp1lQ3TTP0 Pramel1-201ENSMUST00000037419 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Shcbp1lQ3TTP0 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Shcbp1lQ3TTP0 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Shcbp1lQ3TTP0 Adam15-201ENSMUST00000029676 2975 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Shcbp1lQ3TTP0 Car7-202ENSMUST00000159416 1943 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Shcbp1lQ3TTP0 Tacc3-201ENSMUST00000074849 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Shcbp1lQ3TTP0 Yap1-201ENSMUST00000065353 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Shcbp1lQ3TTP0 Camk2b-208ENSMUST00000109812 1875 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
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Shcbp1lQ3TTP0 Gnpda2-201ENSMUST00000031117 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Shcbp1lQ3TTP0 Cd3d-201ENSMUST00000034602 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Shcbp1lQ3TTP0 Ltbp4-201ENSMUST00000038618 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Shcbp1lQ3TTP0 Tmem211-201ENSMUST00000086615 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Shcbp1lQ3TTP0 AC114543.1-201ENSMUST00000226451 1558 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Shcbp1lQ3TTP0 Prkacb-202ENSMUST00000102515 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Shcbp1lQ3TTP0 Ldha-ps-201ENSMUST00000119390 995 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Shcbp1lQ3TTP0 Map2k3os-201ENSMUST00000123544 1291 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Shcbp1lQ3TTP0 Gm12091-201ENSMUST00000146791 830 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Shcbp1lQ3TTP0 Gm23984-201ENSMUST00000157139 203 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Shcbp1lQ3TTP0 Aqp10-ps-201ENSMUST00000199555 611 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Shcbp1lQ3TTP0 Ins1-201ENSMUST00000039652 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Shcbp1lQ3TTP0 Smim11-201ENSMUST00000063641 517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Shcbp1lQ3TTP0 Gm6180-201ENSMUST00000065243 498 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Shcbp1lQ3TTP0 Tbx6-201ENSMUST00000094037 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Shcbp1lQ3TTP0 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Shcbp1lQ3TTP0 Kcnh2-201ENSMUST00000036092 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Shcbp1lQ3TTP0 Wwox-202ENSMUST00000109107 2383 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Shcbp1lQ3TTP0 Ociad2-204ENSMUST00000200830 2384 ntTSL 3 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Shcbp1lQ3TTP0 Cblb-204ENSMUST00000227062 3728 ntAPPRIS P2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
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