Protein–RNA interactions for Protein: Q3TL54

Trim43a, Tripartite motif-containing protein 43A, mousemouse

Predictions only

Length 445 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim43aQ3TL54 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Trim43aQ3TL54 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Trim43aQ3TL54 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Trim43aQ3TL54 AC121598.1-201ENSMUST00000228224 1019 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Trim43aQ3TL54 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Trim43aQ3TL54 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Trim43aQ3TL54 Matn3-201ENSMUST00000020899 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Trim43aQ3TL54 Pomt2-201ENSMUST00000037788 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Trim43aQ3TL54 C130080G10Rik-203ENSMUST00000154140 1564 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Trim43aQ3TL54 Cxcl16-201ENSMUST00000019064 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Trim43aQ3TL54 Mafk-201ENSMUST00000018287 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Trim43aQ3TL54 Lamc2-201ENSMUST00000027753 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Trim43aQ3TL54 Armcx1-203ENSMUST00000113197 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Trim43aQ3TL54 Cabp7-201ENSMUST00000009219 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Trim43aQ3TL54 R3hdm2-212ENSMUST00000166820 4281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Trim43aQ3TL54 Spred2-202ENSMUST00000093299 4449 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Trim43aQ3TL54 Wdr13-205ENSMUST00000130832 4374 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Trim43aQ3TL54 Grin3a-202ENSMUST00000093859 7491 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trim43aQ3TL54 Ptger3-201ENSMUST00000041175 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trim43aQ3TL54 Got1-201ENSMUST00000026196 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trim43aQ3TL54 Fasn-201ENSMUST00000055655 10050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trim43aQ3TL54 Stk38-202ENSMUST00000119274 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trim43aQ3TL54 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trim43aQ3TL54 Fbxo41-203ENSMUST00000161546 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trim43aQ3TL54 Hadhb-203ENSMUST00000114786 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trim43aQ3TL54 Nptn-206ENSMUST00000176557 1898 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trim43aQ3TL54 Malt1-202ENSMUST00000224056 4028 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trim43aQ3TL54 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trim43aQ3TL54 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trim43aQ3TL54 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Trim43aQ3TL54 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Trim43aQ3TL54 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trim43aQ3TL54 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Trim43aQ3TL54 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Trim43aQ3TL54 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trim43aQ3TL54 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trim43aQ3TL54 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Trim43aQ3TL54 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Trim43aQ3TL54 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trim43aQ3TL54 Fbxo34-205ENSMUST00000168833 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trim43aQ3TL54 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trim43aQ3TL54 Hist1h3h-201ENSMUST00000188775 411 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trim43aQ3TL54 Hist1h3i-201ENSMUST00000189457 411 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trim43aQ3TL54 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trim43aQ3TL54 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trim43aQ3TL54 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trim43aQ3TL54 Cpeb3-210ENSMUST00000136286 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trim43aQ3TL54 Cep295nl-201ENSMUST00000103024 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trim43aQ3TL54 Adat3-201ENSMUST00000178231 4516 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trim43aQ3TL54 Pias3-202ENSMUST00000107076 2858 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trim43aQ3TL54 Cbarp-214ENSMUST00000169546 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trim43aQ3TL54 Smg5-201ENSMUST00000001451 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Trim43aQ3TL54 Endov-202ENSMUST00000106244 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Trim43aQ3TL54 Tlk2-209ENSMUST00000145048 2776 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Trim43aQ3TL54 Gstcd-202ENSMUST00000080583 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Trim43aQ3TL54 Mcm9-206ENSMUST00000220007 3513 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Trim43aQ3TL54 Itga6-202ENSMUST00000112101 4156 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Trim43aQ3TL54 Nek6-203ENSMUST00000112902 3147 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Trim43aQ3TL54 Osbpl9-202ENSMUST00000084366 3134 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Trim43aQ3TL54 Slc25a54-201ENSMUST00000029478 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Trim43aQ3TL54 Olfr71-202ENSMUST00000107862 2587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Trim43aQ3TL54 Gm26777-201ENSMUST00000181852 2573 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Trim43aQ3TL54 Tnpo2-201ENSMUST00000093360 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Trim43aQ3TL54 Mdm2-201ENSMUST00000020408 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Trim43aQ3TL54 Hells-201ENSMUST00000025965 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Trim43aQ3TL54 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Trim43aQ3TL54 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Trim43aQ3TL54 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Trim43aQ3TL54 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Trim43aQ3TL54 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Trim43aQ3TL54 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Trim43aQ3TL54 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Trim43aQ3TL54 AC139350.3-201ENSMUST00000226151 420 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Trim43aQ3TL54 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Trim43aQ3TL54 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Trim43aQ3TL54 Setd1b-204ENSMUST00000163030 8857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Trim43aQ3TL54 Micu1-202ENSMUST00000092508 2294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Trim43aQ3TL54 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Trim43aQ3TL54 Zbtb33-201ENSMUST00000049740 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Trim43aQ3TL54 Arl4a-205ENSMUST00000146905 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Trim43aQ3TL54 Zfp57-201ENSMUST00000069250 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Trim43aQ3TL54 Gpr19-204ENSMUST00000116515 2075 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Trim43aQ3TL54 Mei4-202ENSMUST00000189391 1817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Trim43aQ3TL54 Zfpm2-201ENSMUST00000053467 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Trim43aQ3TL54 Tbl1xr1-203ENSMUST00000193734 8237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Trim43aQ3TL54 Gm9920-204ENSMUST00000148544 2752 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Trim43aQ3TL54 Dlgap1-208ENSMUST00000135938 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Trim43aQ3TL54 Myl6-202ENSMUST00000217733 1668 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Trim43aQ3TL54 Tmem8b-202ENSMUST00000107865 4775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Trim43aQ3TL54 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Trim43aQ3TL54 Alx1-201ENSMUST00000040859 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Trim43aQ3TL54 Lmod3-201ENSMUST00000095655 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Trim43aQ3TL54 Gm9754-201ENSMUST00000031305 3004 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Trim43aQ3TL54 Ces2e-202ENSMUST00000109410 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Trim43aQ3TL54 Col18a1-201ENSMUST00000072755 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Trim43aQ3TL54 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Trim43aQ3TL54 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Trim43aQ3TL54 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Trim43aQ3TL54 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Trim43aQ3TL54 Ighv8-14-201ENSMUST00000196781 358 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.4 ms