Protein–RNA interactions for Protein: Q3TIR1

Trappc13, Trafficking protein particle complex subunit 13, mousemouse

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Length 417 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc13Q3TIR1 Mecp2-203ENSMUST00000123362 1675 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Trappc13Q3TIR1 Hdac7-202ENSMUST00000088402 4223 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Trappc13Q3TIR1 Vldlr-207ENSMUST00000167487 7971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Trappc13Q3TIR1 Grk4-201ENSMUST00000001112 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Trappc13Q3TIR1 Trim2-203ENSMUST00000107691 7428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Trappc13Q3TIR1 Kdm2b-204ENSMUST00000118027 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Trappc13Q3TIR1 Myt1l-204ENSMUST00000218198 2735 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Trappc13Q3TIR1 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Trappc13Q3TIR1 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Trappc13Q3TIR1 Pigg-202ENSMUST00000118910 3030 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Trappc13Q3TIR1 B430305J03Rik-201ENSMUST00000066298 3702 ntAPPRIS P1 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Trappc13Q3TIR1 Zbtb39-201ENSMUST00000054287 5960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Trappc13Q3TIR1 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Trappc13Q3TIR1 Dusp14-203ENSMUST00000108101 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Trappc13Q3TIR1 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Trappc13Q3TIR1 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Trappc13Q3TIR1 Fbxo44-205ENSMUST00000151127 1403 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Trappc13Q3TIR1 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Trappc13Q3TIR1 Mocs2-208ENSMUST00000166176 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Trappc13Q3TIR1 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Trappc13Q3TIR1 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Trappc13Q3TIR1 Lrp8os2-204ENSMUST00000188737 3078 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Trappc13Q3TIR1 Gm37714-201ENSMUST00000194742 342 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Trappc13Q3TIR1 Ighv1-25-201ENSMUST00000195638 345 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Trappc13Q3TIR1 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Trappc13Q3TIR1 Mpv17-203ENSMUST00000200833 1171 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Trappc13Q3TIR1 Sesn3-207ENSMUST00000209187 1700 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Trappc13Q3TIR1 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Trappc13Q3TIR1 Gm18244-201ENSMUST00000219747 1566 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Trappc13Q3TIR1 Dupd1-202ENSMUST00000224735 548 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Trappc13Q3TIR1 2310002L09Rik-201ENSMUST00000030101 958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Trappc13Q3TIR1 Psph-201ENSMUST00000031399 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Trappc13Q3TIR1 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Trappc13Q3TIR1 Rtn3-203ENSMUST00000088169 1709 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Trappc13Q3TIR1 Ccdc134-201ENSMUST00000089174 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Trappc13Q3TIR1 Pja1-203ENSMUST00000113792 3038 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Trappc13Q3TIR1 Ncbp1-201ENSMUST00000030014 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Trappc13Q3TIR1 Pax6-201ENSMUST00000090391 2869 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Trappc13Q3TIR1 Asb3-206ENSMUST00000203878 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Trappc13Q3TIR1 Krt36-201ENSMUST00000107416 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Trappc13Q3TIR1 Hdac5-203ENSMUST00000107151 4852 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Trappc13Q3TIR1 Nkain3-202ENSMUST00000119374 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Trappc13Q3TIR1 Gm28539-201ENSMUST00000190050 2982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Trappc13Q3TIR1 R3hdm2-212ENSMUST00000166820 4281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Trappc13Q3TIR1 Lrfn2-201ENSMUST00000046254 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Trappc13Q3TIR1 Kcnk13-204ENSMUST00000177549 3075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Trappc13Q3TIR1 Mpp4-201ENSMUST00000066374 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Trappc13Q3TIR1 Mpp4-202ENSMUST00000078874 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Trappc13Q3TIR1 Grin1-204ENSMUST00000114310 4276 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Trappc13Q3TIR1 Sbk1-201ENSMUST00000056028 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Trappc13Q3TIR1 Gm45667-201ENSMUST00000210380 1316 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Trappc13Q3TIR1 Gsg1l-201ENSMUST00000073935 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Trappc13Q3TIR1 Smim14-205ENSMUST00000139122 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Trappc13Q3TIR1 Dap3-207ENSMUST00000173135 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Trappc13Q3TIR1 Epb41-208ENSMUST00000105981 5303 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Trappc13Q3TIR1 Aatk-201ENSMUST00000064307 5336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Trappc13Q3TIR1 Dnajc5-202ENSMUST00000108796 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Trappc13Q3TIR1 Crybb3-204ENSMUST00000119627 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Trappc13Q3TIR1 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Trappc13Q3TIR1 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Trappc13Q3TIR1 Tpi-rs5-201ENSMUST00000216947 774 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Trappc13Q3TIR1 AC149294.4-201ENSMUST00000227870 882 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Trappc13Q3TIR1 Sipa1-202ENSMUST00000080824 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Trappc13Q3TIR1 March8-213ENSMUST00000203193 4245 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Trappc13Q3TIR1 Dnm1-203ENSMUST00000113350 3258 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Trappc13Q3TIR1 Hapln4-201ENSMUST00000007738 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Trappc13Q3TIR1 Samd4-203ENSMUST00000125113 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Trappc13Q3TIR1 Kcnk13-202ENSMUST00000160413 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Trappc13Q3TIR1 Togaram2-205ENSMUST00000153445 3302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Trappc13Q3TIR1 Arap1-204ENSMUST00000107010 5147 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Trappc13Q3TIR1 B3gat1-204ENSMUST00000160899 3801 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Trappc13Q3TIR1 Gpc2-201ENSMUST00000014089 2514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Trappc13Q3TIR1 Prrg3-203ENSMUST00000170096 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Trappc13Q3TIR1 Cyp11a1-201ENSMUST00000034874 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Trappc13Q3TIR1 Acrbp-205ENSMUST00000112414 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Trappc13Q3TIR1 R3hcc1-206ENSMUST00000216152 1467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Trappc13Q3TIR1 Ankra2-208ENSMUST00000226100 1476 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Trappc13Q3TIR1 Cggbp1-201ENSMUST00000067744 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Trappc13Q3TIR1 Rxrg-204ENSMUST00000111386 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Trappc13Q3TIR1 Mfap4-202ENSMUST00000064783 1722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Trappc13Q3TIR1 Eya4-206ENSMUST00000219315 3100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Trappc13Q3TIR1 Eml6-201ENSMUST00000058902 8083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Trappc13Q3TIR1 Prss23-201ENSMUST00000041761 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Trappc13Q3TIR1 Zdhhc19-201ENSMUST00000064192 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Trappc13Q3TIR1 Armcx1-204ENSMUST00000113198 2085 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Trappc13Q3TIR1 Fermt2-201ENSMUST00000045905 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Trappc13Q3TIR1 Src-202ENSMUST00000092576 3887 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Trappc13Q3TIR1 Cttnbp2nl-202ENSMUST00000098763 4834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Trappc13Q3TIR1 Nfe2l1-204ENSMUST00000107659 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Trappc13Q3TIR1 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Trappc13Q3TIR1 Rpl27a-203ENSMUST00000143107 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Trappc13Q3TIR1 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Trappc13Q3TIR1 Gm42560-201ENSMUST00000201216 1023 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Trappc13Q3TIR1 Gm16476-201ENSMUST00000221544 139 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Trappc13Q3TIR1 AC121804.3-201ENSMUST00000223420 295 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Trappc13Q3TIR1 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Trappc13Q3TIR1 Cox6b1-201ENSMUST00000075738 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Trappc13Q3TIR1 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Trappc13Q3TIR1 Macrod2-204ENSMUST00000110062 3554 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Trappc13Q3TIR1 Men1-202ENSMUST00000078137 2738 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.6 ms