Protein–RNA interactions for Protein: Q3THW5

H2afv, Histone H2A.V, mousemouse

Predictions only

Length 128 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2afvQ3THW5 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
H2afvQ3THW5 Ap2m1-201ENSMUST00000007216 2937 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
H2afvQ3THW5 Rasd2-202ENSMUST00000139848 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
H2afvQ3THW5 Rap1gap2-202ENSMUST00000102521 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
H2afvQ3THW5 Dusp14-203ENSMUST00000108101 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
H2afvQ3THW5 Gm9719-201ENSMUST00000162765 543 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
H2afvQ3THW5 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
H2afvQ3THW5 Gm37714-201ENSMUST00000194742 342 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
H2afvQ3THW5 Gm43125-201ENSMUST00000201724 730 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
H2afvQ3THW5 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
H2afvQ3THW5 Gm36236-201ENSMUST00000220780 701 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
H2afvQ3THW5 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.05
H2afvQ3THW5 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
H2afvQ3THW5 Gtf2ird1-205ENSMUST00000100654 3156 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
H2afvQ3THW5 Mob1a-202ENSMUST00000055261 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
H2afvQ3THW5 Mcoln2-201ENSMUST00000011152 2520 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
H2afvQ3THW5 Bag6-203ENSMUST00000172571 3599 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
H2afvQ3THW5 Gm28230-201ENSMUST00000053932 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
H2afvQ3THW5 Mpp4-201ENSMUST00000066374 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
H2afvQ3THW5 Mpp4-202ENSMUST00000078874 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
H2afvQ3THW5 Ptbp2-201ENSMUST00000029780 3364 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
H2afvQ3THW5 Oasl1-202ENSMUST00000112143 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
H2afvQ3THW5 Map7d1-202ENSMUST00000106132 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
H2afvQ3THW5 Ube2k-210ENSMUST00000202679 4682 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
H2afvQ3THW5 Ankrd34a-201ENSMUST00000058943 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
H2afvQ3THW5 Gm14371-201ENSMUST00000138925 1518 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
H2afvQ3THW5 Zbtb39-201ENSMUST00000054287 5960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
H2afvQ3THW5 Slc19a2-202ENSMUST00000159230 3432 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
H2afvQ3THW5 Hdac5-203ENSMUST00000107151 4852 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
H2afvQ3THW5 Gemin5-205ENSMUST00000172035 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
H2afvQ3THW5 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
H2afvQ3THW5 Frmpd4-204ENSMUST00000112149 8456 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
H2afvQ3THW5 Clstn2-202ENSMUST00000162295 4174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
H2afvQ3THW5 Nkain3-202ENSMUST00000119374 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
H2afvQ3THW5 Cul5-209ENSMUST00000166367 5942 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
H2afvQ3THW5 Fktn-204ENSMUST00000221657 6241 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
H2afvQ3THW5 Gm45667-201ENSMUST00000210380 1316 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
H2afvQ3THW5 Gm38346-201ENSMUST00000192379 2639 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
H2afvQ3THW5 Sesn3-207ENSMUST00000209187 1700 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
H2afvQ3THW5 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
H2afvQ3THW5 Gstt1-201ENSMUST00000001713 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
H2afvQ3THW5 2810047C21Rik1-201ENSMUST00000172930 915 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
H2afvQ3THW5 Gm29541-201ENSMUST00000191351 678 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
H2afvQ3THW5 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
H2afvQ3THW5 AC149294.4-201ENSMUST00000227870 882 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
H2afvQ3THW5 Nob1-201ENSMUST00000003946 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
H2afvQ3THW5 Cacna2d2-208ENSMUST00000170737 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
H2afvQ3THW5 Fermt2-201ENSMUST00000045905 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
H2afvQ3THW5 Zfp146-201ENSMUST00000062181 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
H2afvQ3THW5 Ssh1-204ENSMUST00000159592 8436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
H2afvQ3THW5 Pisd-202ENSMUST00000071829 1986 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
H2afvQ3THW5 Zfp367-201ENSMUST00000059817 3532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
H2afvQ3THW5 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
H2afvQ3THW5 Diaph2-207ENSMUST00000167619 8439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
H2afvQ3THW5 Rubcn-204ENSMUST00000119810 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
H2afvQ3THW5 Radil-204ENSMUST00000110785 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
H2afvQ3THW5 Gnb5-202ENSMUST00000213990 1803 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
H2afvQ3THW5 Snph-201ENSMUST00000028951 4730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
H2afvQ3THW5 Lrig2-205ENSMUST00000198332 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
H2afvQ3THW5 Krt26-201ENSMUST00000100482 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
H2afvQ3THW5 Eif1ad-201ENSMUST00000025759 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
H2afvQ3THW5 Hoxd3-202ENSMUST00000111982 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
H2afvQ3THW5 Dhrs4-201ENSMUST00000022821 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
H2afvQ3THW5 Psd2-206ENSMUST00000177432 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
H2afvQ3THW5 Grk6-205ENSMUST00000224653 2976 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
H2afvQ3THW5 Pla2g5-204ENSMUST00000102513 2289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
H2afvQ3THW5 Rabep2-201ENSMUST00000106405 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
H2afvQ3THW5 Entpd2-201ENSMUST00000028328 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
H2afvQ3THW5 Atat1-201ENSMUST00000056034 1930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
H2afvQ3THW5 Arap1-204ENSMUST00000107010 5147 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
H2afvQ3THW5 Cit-203ENSMUST00000112008 6087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
H2afvQ3THW5 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
H2afvQ3THW5 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
H2afvQ3THW5 Romo1-203ENSMUST00000109598 362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
H2afvQ3THW5 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
H2afvQ3THW5 Rpl27a-203ENSMUST00000143107 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
H2afvQ3THW5 4930544D05Rik-203ENSMUST00000144960 624 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
H2afvQ3THW5 Gm38182-203ENSMUST00000192984 993 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
H2afvQ3THW5 Pcdhgc5-204ENSMUST00000193941 593 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
H2afvQ3THW5 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
H2afvQ3THW5 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
H2afvQ3THW5 Rxfp4-201ENSMUST00000063119 1245 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
H2afvQ3THW5 S100a7a-201ENSMUST00000079286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
H2afvQ3THW5 Zkscan14-203ENSMUST00000198959 2243 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
H2afvQ3THW5 AC114543.1-201ENSMUST00000226451 1558 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
H2afvQ3THW5 AC139054.1-201ENSMUST00000226898 1598 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
H2afvQ3THW5 Zfp276-201ENSMUST00000001092 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
H2afvQ3THW5 Atp6ap1-201ENSMUST00000019231 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
H2afvQ3THW5 Xrra1-201ENSMUST00000036155 2731 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
H2afvQ3THW5 Lrrc8a-202ENSMUST00000113654 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
H2afvQ3THW5 Pde4a-203ENSMUST00000115458 2962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
H2afvQ3THW5 Cplx4-201ENSMUST00000025397 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
H2afvQ3THW5 Fnbp4-201ENSMUST00000013759 4691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
H2afvQ3THW5 Exoc6b-203ENSMUST00000160197 5439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
H2afvQ3THW5 Cttnbp2nl-202ENSMUST00000098763 4834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
H2afvQ3THW5 Xkr5-202ENSMUST00000095438 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
H2afvQ3THW5 BC006965-201ENSMUST00000124028 1952 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
H2afvQ3THW5 4933434M16Rik-202ENSMUST00000153429 1940 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
H2afvQ3THW5 Agpat4-201ENSMUST00000024594 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
H2afvQ3THW5 Maged2-203ENSMUST00000112699 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.8 ms