Protein–RNA interactions for Protein: Q1RME4

Gm1123, CAR-like soluble protein, mousemouse

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Length 390 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm1123Q1RME4 Muc20-201ENSMUST00000041123 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm1123Q1RME4 Vangl1-201ENSMUST00000029453 6531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm1123Q1RME4 Orc6-202ENSMUST00000170141 1466 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm1123Q1RME4 Ppt2-201ENSMUST00000064953 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm1123Q1RME4 Tspan32-206ENSMUST00000105925 1376 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm1123Q1RME4 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm1123Q1RME4 Gm7324-201ENSMUST00000094051 1647 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm1123Q1RME4 Arhgap10-201ENSMUST00000076316 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm1123Q1RME4 Apbb1-215ENSMUST00000190369 1882 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm1123Q1RME4 Ndufa13-201ENSMUST00000110167 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm1123Q1RME4 Shf-202ENSMUST00000110530 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm1123Q1RME4 Sumo2-204ENSMUST00000118155 884 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm1123Q1RME4 Mrps10-202ENSMUST00000119841 1113 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm1123Q1RME4 Gm12416-201ENSMUST00000120911 1008 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm1123Q1RME4 Gm15821-201ENSMUST00000121995 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm1123Q1RME4 Gm26464-201ENSMUST00000157094 305 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm1123Q1RME4 BC023719-201ENSMUST00000174728 978 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm1123Q1RME4 Carmn-202ENSMUST00000182244 988 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm1123Q1RME4 Gm8602-201ENSMUST00000184045 607 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm1123Q1RME4 Gm37748-201ENSMUST00000194379 1140 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm1123Q1RME4 4930432H08Rik-201ENSMUST00000198220 1284 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm1123Q1RME4 Lcmt1-204ENSMUST00000206574 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm1123Q1RME4 Pdzd11-202ENSMUST00000059099 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm1123Q1RME4 Olfr373-201ENSMUST00000074540 945 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm1123Q1RME4 Gm8973-201ENSMUST00000079818 315 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm1123Q1RME4 Ap2s1-201ENSMUST00000086112 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm1123Q1RME4 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm1123Q1RME4 Gm36065-202ENSMUST00000219654 1424 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm1123Q1RME4 Osbpl11-201ENSMUST00000039733 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm1123Q1RME4 Nbeal2-210ENSMUST00000167320 8803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm1123Q1RME4 Ppig-201ENSMUST00000040915 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm1123Q1RME4 Gprc5c-208ENSMUST00000177952 1809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm1123Q1RME4 Gm29253-201ENSMUST00000185727 5231 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm1123Q1RME4 Gm11978-202ENSMUST00000127510 1303 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm1123Q1RME4 Nfxl1-202ENSMUST00000087216 3712 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm1123Q1RME4 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm1123Q1RME4 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm1123Q1RME4 Slco3a1-202ENSMUST00000098371 2709 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm1123Q1RME4 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm1123Q1RME4 Gid4-201ENSMUST00000070681 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm1123Q1RME4 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm1123Q1RME4 Gpc5-201ENSMUST00000022707 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm1123Q1RME4 H13-202ENSMUST00000089059 1743 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm1123Q1RME4 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm1123Q1RME4 Sntb2-203ENSMUST00000212524 9945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm1123Q1RME4 B4galnt1-201ENSMUST00000006914 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm1123Q1RME4 Dgke-201ENSMUST00000000285 5208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm1123Q1RME4 Rap2b-201ENSMUST00000049064 6793 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm1123Q1RME4 Sh3glb1-201ENSMUST00000163279 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm1123Q1RME4 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm1123Q1RME4 Plekha1-201ENSMUST00000048180 3321 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm1123Q1RME4 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm1123Q1RME4 Itpripl1-203ENSMUST00000154021 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm1123Q1RME4 Fars2-208ENSMUST00000224611 1750 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm1123Q1RME4 Il6ra-202ENSMUST00000197679 8639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm1123Q1RME4 AC161252.3-201ENSMUST00000225465 1549 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm1123Q1RME4 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm1123Q1RME4 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm1123Q1RME4 Enpp1-203ENSMUST00000135846 2721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm1123Q1RME4 P4hb-201ENSMUST00000026122 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm1123Q1RME4 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm1123Q1RME4 Gm15376-201ENSMUST00000122258 783 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm1123Q1RME4 Lrcol1-202ENSMUST00000185691 764 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm1123Q1RME4 Ngf-201ENSMUST00000035952 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm1123Q1RME4 Cby3-201ENSMUST00000052596 703 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm1123Q1RME4 Gm5356-201ENSMUST00000093326 615 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm1123Q1RME4 6430531B16Rik-201ENSMUST00000097970 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm1123Q1RME4 Taf3-201ENSMUST00000026888 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm1123Q1RME4 Slc25a46-201ENSMUST00000060396 4371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm1123Q1RME4 Papd7-201ENSMUST00000044081 3994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm1123Q1RME4 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm1123Q1RME4 Sipa1-204ENSMUST00000169854 3583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm1123Q1RME4 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm1123Q1RME4 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm1123Q1RME4 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm1123Q1RME4 Ildr2-201ENSMUST00000111416 8251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm1123Q1RME4 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm1123Q1RME4 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm1123Q1RME4 Degs2-202ENSMUST00000167978 1729 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm1123Q1RME4 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm1123Q1RME4 Rbmx2-201ENSMUST00000033433 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm1123Q1RME4 Cacna2d1-205ENSMUST00000167946 7436 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm1123Q1RME4 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm1123Q1RME4 Snrpa-202ENSMUST00000122202 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm1123Q1RME4 Hjurp-206ENSMUST00000147393 2030 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm1123Q1RME4 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm1123Q1RME4 Hps5-201ENSMUST00000014562 4953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm1123Q1RME4 Tmem55a-201ENSMUST00000029875 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm1123Q1RME4 Dmrtc1c1-201ENSMUST00000118218 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm1123Q1RME4 Dmrtc1c2-203ENSMUST00000120314 1611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm1123Q1RME4 Gnao1-203ENSMUST00000125716 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm1123Q1RME4 Mettl11b-201ENSMUST00000159679 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm1123Q1RME4 Slc7a7-202ENSMUST00000195970 2057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm1123Q1RME4 Wls-205ENSMUST00000198878 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm1123Q1RME4 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm1123Q1RME4 Kctd18-202ENSMUST00000114410 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm1123Q1RME4 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm1123Q1RME4 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm1123Q1RME4 Lamb2-201ENSMUST00000065014 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm1123Q1RME4 Gm26565-201ENSMUST00000181642 1968 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.2 ms