Protein–RNA interactions for Protein: Q14CH0

Fam171b, Protein FAM171B, mousemouse

Predictions only

Length 825 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam171bQ14CH0 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
Fam171bQ14CH0 Stip1-201ENSMUST00000025918 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Fam171bQ14CH0 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Fam171bQ14CH0 H2-Q6-202ENSMUST00000174699 2085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.12
Fam171bQ14CH0 Umad1-208ENSMUST00000162034 2015 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.27□□□□□ -0.12
Fam171bQ14CH0 Ces1h-201ENSMUST00000145041 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.12
Fam171bQ14CH0 Sgce-204ENSMUST00000115577 1776 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Fam171bQ14CH0 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Fam171bQ14CH0 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Fam171bQ14CH0 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Fam171bQ14CH0 Slfn2-201ENSMUST00000038038 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Fam171bQ14CH0 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Fam171bQ14CH0 Rreb1-202ENSMUST00000110237 4617 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Fam171bQ14CH0 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Fam171bQ14CH0 Mylk2-201ENSMUST00000028970 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Fam171bQ14CH0 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Fam171bQ14CH0 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Fam171bQ14CH0 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Fam171bQ14CH0 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Fam171bQ14CH0 Tmem53-202ENSMUST00000106433 913 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Fam171bQ14CH0 Gm11918-201ENSMUST00000121660 179 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
Fam171bQ14CH0 Rab15-204ENSMUST00000122419 856 ntTSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Fam171bQ14CH0 1700061E18Rik-201ENSMUST00000154159 588 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Fam171bQ14CH0 4933405L10Rik-202ENSMUST00000211852 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Fam171bQ14CH0 Gm648-201ENSMUST00000081133 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Fam171bQ14CH0 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Fam171bQ14CH0 Slc7a7-206ENSMUST00000197440 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Fam171bQ14CH0 Dlg4-204ENSMUST00000108589 3271 ntTSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Fam171bQ14CH0 5033426O07Rik-202ENSMUST00000212635 2110 ntTSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Fam171bQ14CH0 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Fam171bQ14CH0 Iqcm-203ENSMUST00000212704 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Fam171bQ14CH0 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Fam171bQ14CH0 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
Fam171bQ14CH0 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Fam171bQ14CH0 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Fam171bQ14CH0 2700080J24Rik-201ENSMUST00000205314 1662 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
Fam171bQ14CH0 Map2k7-203ENSMUST00000110994 1600 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Fam171bQ14CH0 Gm11992-201ENSMUST00000043285 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Fam171bQ14CH0 Ppp1r18-205ENSMUST00000187690 3185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Fam171bQ14CH0 Rtraf-201ENSMUST00000022341 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Fam171bQ14CH0 Ctsk-201ENSMUST00000015664 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Fam171bQ14CH0 Gnb2-202ENSMUST00000111020 1470 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Fam171bQ14CH0 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Fam171bQ14CH0 Ppp1r18-206ENSMUST00000190496 1395 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Fam171bQ14CH0 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Fam171bQ14CH0 Gbe1-207ENSMUST00000171132 3303 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Fam171bQ14CH0 Gm11978-202ENSMUST00000127510 1303 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Fam171bQ14CH0 Adcyap1r1-208ENSMUST00000172084 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Fam171bQ14CH0 Msh2-201ENSMUST00000024967 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Fam171bQ14CH0 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Fam171bQ14CH0 Gm13689-201ENSMUST00000119360 685 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
Fam171bQ14CH0 Gm12416-201ENSMUST00000120911 1008 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
Fam171bQ14CH0 Gm15755-201ENSMUST00000133698 659 ntTSL 3 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Fam171bQ14CH0 Synj2bp-205ENSMUST00000169158 691 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Fam171bQ14CH0 Gm5069-202ENSMUST00000192714 1011 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
Fam171bQ14CH0 Gm43568-203ENSMUST00000199116 1270 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Fam171bQ14CH0 AC087891.2-201ENSMUST00000219293 658 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Fam171bQ14CH0 Gm17330-201ENSMUST00000221047 165 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
Fam171bQ14CH0 Rad23b-201ENSMUST00000030134 3810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Fam171bQ14CH0 Lamtor1-201ENSMUST00000033131 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Fam171bQ14CH0 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Fam171bQ14CH0 Ccdc121-201ENSMUST00000058825 1819 ntAPPRIS P1 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Fam171bQ14CH0 Gm20632-201ENSMUST00000176760 2427 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
Fam171bQ14CH0 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Fam171bQ14CH0 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Fam171bQ14CH0 Tmem55a-201ENSMUST00000029875 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Fam171bQ14CH0 Ulk3-201ENSMUST00000053230 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Fam171bQ14CH0 BC051537-201ENSMUST00000183290 1668 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Fam171bQ14CH0 Slc12a8-202ENSMUST00000117134 2081 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Fam171bQ14CH0 Gm42872-201ENSMUST00000200026 1967 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
Fam171bQ14CH0 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Fam171bQ14CH0 Amhr2-201ENSMUST00000023809 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Fam171bQ14CH0 Apol7a-201ENSMUST00000010745 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Fam171bQ14CH0 Nsd3-211ENSMUST00000155861 2834 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Fam171bQ14CH0 Cpeb4-201ENSMUST00000020543 2312 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Fam171bQ14CH0 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Fam171bQ14CH0 Fam71f1-204ENSMUST00000166462 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Fam171bQ14CH0 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Fam171bQ14CH0 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Fam171bQ14CH0 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Fam171bQ14CH0 Gm15770-201ENSMUST00000117498 584 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
Fam171bQ14CH0 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Fam171bQ14CH0 Ly6g6e-203ENSMUST00000172678 750 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Fam171bQ14CH0 Smyd3-207ENSMUST00000194237 1047 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Fam171bQ14CH0 4930449I04Rik-201ENSMUST00000198191 1123 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
Fam171bQ14CH0 Gm42722-201ENSMUST00000198855 940 ntTSL 3 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Fam171bQ14CH0 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Fam171bQ14CH0 Gm45059-201ENSMUST00000205558 1077 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
Fam171bQ14CH0 AC150560.1-201ENSMUST00000227731 1187 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
Fam171bQ14CH0 Dpm3-201ENSMUST00000040824 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Fam171bQ14CH0 Rps15-201ENSMUST00000062674 572 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Fam171bQ14CH0 A730061H03Rik-201ENSMUST00000066106 465 ntAPPRIS P1 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Fam171bQ14CH0 Zmat5-201ENSMUST00000009220 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Fam171bQ14CH0 Gypc-202ENSMUST00000174000 2072 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Fam171bQ14CH0 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Fam171bQ14CH0 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Fam171bQ14CH0 Catsper4-204ENSMUST00000169381 1506 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Fam171bQ14CH0 Mpp4-210ENSMUST00000191200 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Fam171bQ14CH0 Mrgprh-201ENSMUST00000075296 1809 ntAPPRIS P1 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Fam171bQ14CH0 Ube2g1-203ENSMUST00000138247 3931 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
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