Protein–RNA interactions for Protein: Q14AI6

Rpusd3, Mitochondrial mRNA pseudouridine synthase Rpusd3, mousemouse

Predictions only

Length 344 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpusd3Q14AI6 Gm18057-201ENSMUST00000208220 503 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Rpusd3Q14AI6 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Rpusd3Q14AI6 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Rpusd3Q14AI6 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Rpusd3Q14AI6 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Rpusd3Q14AI6 Slc33a1-201ENSMUST00000029402 3150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Rpusd3Q14AI6 Pde4a-203ENSMUST00000115458 2962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Rpusd3Q14AI6 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Rpusd3Q14AI6 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Rpusd3Q14AI6 Zfyve28-201ENSMUST00000094868 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Rpusd3Q14AI6 Nol10-201ENSMUST00000046011 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Rpusd3Q14AI6 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Rpusd3Q14AI6 Srebf2-201ENSMUST00000023100 4989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Rpusd3Q14AI6 Adamts16-201ENSMUST00000080145 4981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Rpusd3Q14AI6 Syt10-201ENSMUST00000029441 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Rpusd3Q14AI6 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Rpusd3Q14AI6 Dnmt1-207ENSMUST00000216540 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Rpusd3Q14AI6 Phka1-203ENSMUST00000113611 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Rpusd3Q14AI6 Phka1-205ENSMUST00000120270 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Rpusd3Q14AI6 Edrf1-202ENSMUST00000128901 4380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Rpusd3Q14AI6 Prrxl1-202ENSMUST00000186452 2371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Rpusd3Q14AI6 Tex10-201ENSMUST00000030030 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Rpusd3Q14AI6 Gnpda2-201ENSMUST00000031117 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Rpusd3Q14AI6 Fgfr1-203ENSMUST00000119398 3789 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Rpusd3Q14AI6 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Rpusd3Q14AI6 Rbl1-201ENSMUST00000029170 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Rpusd3Q14AI6 Neu2-203ENSMUST00000164128 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Rpusd3Q14AI6 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Rpusd3Q14AI6 Sgo2a-201ENSMUST00000027202 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Rpusd3Q14AI6 Cmip-201ENSMUST00000095172 2276 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Rpusd3Q14AI6 Ankrd6-204ENSMUST00000084750 4444 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Rpusd3Q14AI6 2610507B11Rik-201ENSMUST00000010421 7443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Rpusd3Q14AI6 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Rpusd3Q14AI6 Rab10os-202ENSMUST00000177896 2872 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Rpusd3Q14AI6 Sp9-201ENSMUST00000090813 4514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Rpusd3Q14AI6 Pnpla2-203ENSMUST00000164016 2625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Rpusd3Q14AI6 Rph3a-203ENSMUST00000202326 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Rpusd3Q14AI6 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Rpusd3Q14AI6 Plcb2-202ENSMUST00000102524 5145 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Rpusd3Q14AI6 Bap1-201ENSMUST00000022458 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Rpusd3Q14AI6 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Rpusd3Q14AI6 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Rpusd3Q14AI6 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Rpusd3Q14AI6 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Rpusd3Q14AI6 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Rpusd3Q14AI6 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Rpusd3Q14AI6 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Rpusd3Q14AI6 Gm18737-201ENSMUST00000173594 937 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Rpusd3Q14AI6 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Rpusd3Q14AI6 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Rpusd3Q14AI6 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Rpusd3Q14AI6 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Rpusd3Q14AI6 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Rpusd3Q14AI6 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Rpusd3Q14AI6 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Rpusd3Q14AI6 Atxn7l3b-201ENSMUST00000099276 3566 ntAPPRIS P1 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Rpusd3Q14AI6 Apaf1-207ENSMUST00000161987 2710 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Rpusd3Q14AI6 Tnfrsf21-201ENSMUST00000024708 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Rpusd3Q14AI6 Gm36995-201ENSMUST00000126170 5727 ntTSL 2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Rpusd3Q14AI6 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Rpusd3Q14AI6 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Rpusd3Q14AI6 L1td1-204ENSMUST00000173659 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Rpusd3Q14AI6 Gm17029-202ENSMUST00000146124 2899 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Rpusd3Q14AI6 Ablim2-209ENSMUST00000129347 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Rpusd3Q14AI6 Gm2155-201ENSMUST00000181581 1974 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Rpusd3Q14AI6 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Rpusd3Q14AI6 Ccne2-202ENSMUST00000108324 2908 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Rpusd3Q14AI6 Rhobtb1-210ENSMUST00000167384 2331 ntTSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Rpusd3Q14AI6 Mfge8-202ENSMUST00000107409 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Rpusd3Q14AI6 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Rpusd3Q14AI6 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Rpusd3Q14AI6 Dusp23-201ENSMUST00000027826 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Rpusd3Q14AI6 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Rpusd3Q14AI6 Rgs9bp-201ENSMUST00000069912 6590 ntAPPRIS P1 BASIC12.02□□□□□ -0.48
Rpusd3Q14AI6 Dido1-202ENSMUST00000087517 8723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Rpusd3Q14AI6 Acin1-221ENSMUST00000150371 2494 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Rpusd3Q14AI6 Stox2-201ENSMUST00000079195 10467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Rpusd3Q14AI6 Cecr2-202ENSMUST00000112686 9212 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.48
Rpusd3Q14AI6 Sipa1-201ENSMUST00000071857 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Rpusd3Q14AI6 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Rpusd3Q14AI6 2900026A02Rik-201ENSMUST00000050125 5876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Rpusd3Q14AI6 Sema3d-201ENSMUST00000030868 6307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Rpusd3Q14AI6 Tpd52-203ENSMUST00000091355 3081 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Rpusd3Q14AI6 Grin1-203ENSMUST00000114308 4165 ntTSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Rpusd3Q14AI6 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Rpusd3Q14AI6 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Rpusd3Q14AI6 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
Rpusd3Q14AI6 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
Rpusd3Q14AI6 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Rpusd3Q14AI6 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Rpusd3Q14AI6 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
Rpusd3Q14AI6 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Rpusd3Q14AI6 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Rpusd3Q14AI6 Zmiz1os1-201ENSMUST00000156682 3469 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Rpusd3Q14AI6 Pcdha11-203ENSMUST00000192447 4583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Rpusd3Q14AI6 Lag3-201ENSMUST00000032217 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Rpusd3Q14AI6 Dok7-203ENSMUST00000114270 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Rpusd3Q14AI6 Wdr54-205ENSMUST00000153148 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Rpusd3Q14AI6 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Rpusd3Q14AI6 Micu1-204ENSMUST00000165563 2442 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.1 ms