Protein–RNA interactions for Protein: Q0VG85

Ccdc162p, Coiled-coil domain-containing protein 162, mousemouse

Predictions only

Length 912 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc162pQ0VG85 Abhd14b-201ENSMUST00000048527 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc162pQ0VG85 Rgs12-205ENSMUST00000114283 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc162pQ0VG85 Krt36-201ENSMUST00000107416 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc162pQ0VG85 S100pbp-205ENSMUST00000117350 2241 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc162pQ0VG85 Gtf2a1l-201ENSMUST00000024970 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc162pQ0VG85 Nkain3-202ENSMUST00000119374 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc162pQ0VG85 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc162pQ0VG85 Prss36-202ENSMUST00000118755 3028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc162pQ0VG85 1810008I18Rik-201ENSMUST00000185464 2419 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc162pQ0VG85 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc162pQ0VG85 Cacnb2-202ENSMUST00000114719 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc162pQ0VG85 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc162pQ0VG85 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc162pQ0VG85 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc162pQ0VG85 Gm44414-201ENSMUST00000203660 2109 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc162pQ0VG85 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc162pQ0VG85 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc162pQ0VG85 Tnks1bp1-202ENSMUST00000111605 5747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc162pQ0VG85 Slc12a8-202ENSMUST00000117134 2081 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc162pQ0VG85 Hlcs-202ENSMUST00000163193 5371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc162pQ0VG85 Tmem8b-202ENSMUST00000107865 4775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc162pQ0VG85 Mdm2-202ENSMUST00000105263 3145 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc162pQ0VG85 Sema4a-213ENSMUST00000165898 3125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc162pQ0VG85 Rcor2-202ENSMUST00000113369 2013 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc162pQ0VG85 Brd2-201ENSMUST00000025193 4374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc162pQ0VG85 4931440F15Rik-201ENSMUST00000104962 3274 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc162pQ0VG85 Nub1-201ENSMUST00000068825 3269 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc162pQ0VG85 Edc4-201ENSMUST00000040254 4780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc162pQ0VG85 Ltbp4-204ENSMUST00000118961 3444 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc162pQ0VG85 Shroom1-201ENSMUST00000018531 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc162pQ0VG85 Cep170b-204ENSMUST00000220627 5395 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc162pQ0VG85 Rlbp1-201ENSMUST00000053718 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc162pQ0VG85 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc162pQ0VG85 Cxcr5-204ENSMUST00000215293 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc162pQ0VG85 Gngt2-201ENSMUST00000036088 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc162pQ0VG85 Fbxo41-202ENSMUST00000161078 6562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc162pQ0VG85 Hadhb-202ENSMUST00000114783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc162pQ0VG85 Tmem186-201ENSMUST00000052505 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc162pQ0VG85 Fam53b-201ENSMUST00000065371 5052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc162pQ0VG85 Nhs-202ENSMUST00000087085 8805 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc162pQ0VG85 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc162pQ0VG85 Emp1-206ENSMUST00000205156 2911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc162pQ0VG85 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc162pQ0VG85 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc162pQ0VG85 Gm16251-201ENSMUST00000162649 338 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc162pQ0VG85 Gm8337-201ENSMUST00000187358 1938 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc162pQ0VG85 BC003331-205ENSMUST00000111913 3273 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc162pQ0VG85 Mier3-203ENSMUST00000109272 5279 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc162pQ0VG85 Bap1-201ENSMUST00000022458 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc162pQ0VG85 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc162pQ0VG85 Gm10176-201ENSMUST00000159707 2264 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc162pQ0VG85 Ahcyl2-205ENSMUST00000125911 2039 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc162pQ0VG85 1600020E01Rik-206ENSMUST00000204663 2007 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc162pQ0VG85 Paf1-201ENSMUST00000003529 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc162pQ0VG85 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc162pQ0VG85 Tsku-206ENSMUST00000179780 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc162pQ0VG85 Ulk3-201ENSMUST00000053230 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc162pQ0VG85 Ddx39b-202ENSMUST00000172549 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc162pQ0VG85 Ablim2-209ENSMUST00000129347 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc162pQ0VG85 Rnf19b-202ENSMUST00000097874 1992 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc162pQ0VG85 Ssc5d-201ENSMUST00000057612 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc162pQ0VG85 Senp5-201ENSMUST00000023457 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc162pQ0VG85 Fhl4-202ENSMUST00000216889 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc162pQ0VG85 Parp2-201ENSMUST00000036126 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc162pQ0VG85 Mmab-202ENSMUST00000112245 644 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc162pQ0VG85 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc162pQ0VG85 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc162pQ0VG85 Gm29741-201ENSMUST00000192667 421 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc162pQ0VG85 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc162pQ0VG85 Gstm1-201ENSMUST00000004140 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc162pQ0VG85 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc162pQ0VG85 Gjb4-202ENSMUST00000106090 1446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc162pQ0VG85 Gjb4-201ENSMUST00000060419 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc162pQ0VG85 Vwa3b-202ENSMUST00000067178 1769 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc162pQ0VG85 Vrtn-202ENSMUST00000166772 3098 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc162pQ0VG85 Tacc3-202ENSMUST00000079534 2899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc162pQ0VG85 Olfr1411-203ENSMUST00000216444 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc162pQ0VG85 Sesn3-207ENSMUST00000209187 1700 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc162pQ0VG85 Clcn6-201ENSMUST00000030879 3306 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc162pQ0VG85 5830432E09Rik-203ENSMUST00000210953 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc162pQ0VG85 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc162pQ0VG85 Bscl2-203ENSMUST00000159634 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc162pQ0VG85 Plin3-201ENSMUST00000019726 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc162pQ0VG85 AC125108.1-201ENSMUST00000218986 2330 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc162pQ0VG85 Grin3a-202ENSMUST00000093859 7491 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc162pQ0VG85 Zbtb7b-203ENSMUST00000107433 3650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc162pQ0VG85 Grin3a-201ENSMUST00000076674 7431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc162pQ0VG85 Fzd1-201ENSMUST00000054294 4197 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc162pQ0VG85 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc162pQ0VG85 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc162pQ0VG85 Proser1-201ENSMUST00000058577 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc162pQ0VG85 Hnrnpf-203ENSMUST00000167182 2271 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc162pQ0VG85 Ephb1-202ENSMUST00000085169 4101 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc162pQ0VG85 Zbtb33-201ENSMUST00000049740 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc162pQ0VG85 Rp2-201ENSMUST00000033372 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc162pQ0VG85 Kdm4b-201ENSMUST00000025036 4577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc162pQ0VG85 Polr3g-201ENSMUST00000048993 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc162pQ0VG85 Nif3l1-206ENSMUST00000171597 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc162pQ0VG85 Taf1c-201ENSMUST00000093099 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc162pQ0VG85 Hnrnpk-232ENSMUST00000225674 2704 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.8 ms