Protein–RNA interactions for Protein: Q0VF76

Ttc39d, Tetratricopeptide repeat domain 39D, mousemouse

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Length 604 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc39dQ0VF76 Dnajc6-204ENSMUST00000106930 5127 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ttc39dQ0VF76 Mtif3-202ENSMUST00000066675 4927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ttc39dQ0VF76 Slc6a4-202ENSMUST00000108402 2796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ttc39dQ0VF76 Fmnl2-205ENSMUST00000155586 3939 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ttc39dQ0VF76 Shmt2-206ENSMUST00000219239 2238 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ttc39dQ0VF76 Gm14963-201ENSMUST00000146751 2558 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ttc39dQ0VF76 Gas2l3-207ENSMUST00000220128 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ttc39dQ0VF76 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ttc39dQ0VF76 Clpb-202ENSMUST00000106998 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ttc39dQ0VF76 Ccser2-202ENSMUST00000090024 7509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ttc39dQ0VF76 Ttc5-201ENSMUST00000006451 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ttc39dQ0VF76 Mrgprh-201ENSMUST00000075296 1809 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ttc39dQ0VF76 Ncbp1-201ENSMUST00000030014 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ttc39dQ0VF76 Cfap157-201ENSMUST00000102813 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ttc39dQ0VF76 Maged2-201ENSMUST00000026302 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ttc39dQ0VF76 Mvk-202ENSMUST00000112239 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ttc39dQ0VF76 Nomo1-201ENSMUST00000033121 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ttc39dQ0VF76 Grm5-204ENSMUST00000155358 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ttc39dQ0VF76 Gatd1-201ENSMUST00000106008 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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Ttc39dQ0VF76 Zbtb45-202ENSMUST00000172240 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ttc39dQ0VF76 Ngef-201ENSMUST00000027477 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ttc39dQ0VF76 E130201H02Rik-201ENSMUST00000123576 851 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
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Ttc39dQ0VF76 Smim17-203ENSMUST00000161855 664 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ttc39dQ0VF76 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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Ttc39dQ0VF76 Slc25a14-201ENSMUST00000033431 1760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ttc39dQ0VF76 Osbpl9-202ENSMUST00000084366 3134 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ttc39dQ0VF76 Yap1-202ENSMUST00000086580 4115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ttc39dQ0VF76 Leng8-201ENSMUST00000037472 5105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ttc39dQ0VF76 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ttc39dQ0VF76 Ric8b-202ENSMUST00000095385 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ttc39dQ0VF76 Fut11-201ENSMUST00000048016 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ttc39dQ0VF76 Pcdha1-202ENSMUST00000193839 4925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ttc39dQ0VF76 Ptprk-201ENSMUST00000166468 6177 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ttc39dQ0VF76 Socs3-201ENSMUST00000054002 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ttc39dQ0VF76 Mylk2-201ENSMUST00000028970 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ttc39dQ0VF76 Rtn4-205ENSMUST00000102843 4618 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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Ttc39dQ0VF76 S100b-201ENSMUST00000036387 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ttc39dQ0VF76 Me1-201ENSMUST00000034989 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ttc39dQ0VF76 Nr4a2-203ENSMUST00000112629 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ttc39dQ0VF76 Zkscan17-201ENSMUST00000013262 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ttc39dQ0VF76 Atp2a3-202ENSMUST00000108484 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ttc39dQ0VF76 Map2k7-203ENSMUST00000110994 1600 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ttc39dQ0VF76 Ulk3-201ENSMUST00000053230 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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Ttc39dQ0VF76 Myt1l-204ENSMUST00000218198 2735 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ttc39dQ0VF76 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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Ttc39dQ0VF76 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ttc39dQ0VF76 Gstcd-202ENSMUST00000080583 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ttc39dQ0VF76 Rims1-201ENSMUST00000081544 5954 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
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Ttc39dQ0VF76 Bscl2-201ENSMUST00000086058 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ttc39dQ0VF76 Peli3-202ENSMUST00000120475 2988 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ttc39dQ0VF76 Eya4-206ENSMUST00000219315 3100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ttc39dQ0VF76 Apln-201ENSMUST00000039026 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ttc39dQ0VF76 Prrg3-203ENSMUST00000170096 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ttc39dQ0VF76 Rnf217-201ENSMUST00000081989 11013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ttc39dQ0VF76 Nfxl1-202ENSMUST00000087216 3712 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ttc39dQ0VF76 Erg-203ENSMUST00000113848 2139 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ttc39dQ0VF76 Pigg-202ENSMUST00000118910 3030 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ttc39dQ0VF76 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ttc39dQ0VF76 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ttc39dQ0VF76 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ttc39dQ0VF76 Cenpa-206ENSMUST00000149759 346 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ttc39dQ0VF76 Desi1-206ENSMUST00000152227 2934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ttc39dQ0VF76 Cox16-206ENSMUST00000168463 431 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ttc39dQ0VF76 Cyp2d11-201ENSMUST00000170255 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ttc39dQ0VF76 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ttc39dQ0VF76 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ttc39dQ0VF76 Gm26953-206ENSMUST00000212840 619 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.9 ms