Protein–RNA interactions for Protein: Q0VDN7

Rundc1, RUN domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 615 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rundc1Q0VDN7 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Rundc1Q0VDN7 Cnih4-203ENSMUST00000111059 3127 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Rundc1Q0VDN7 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Rundc1Q0VDN7 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Rundc1Q0VDN7 Ska1-201ENSMUST00000040188 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Rundc1Q0VDN7 Tmem53-202ENSMUST00000106433 913 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Rundc1Q0VDN7 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Rundc1Q0VDN7 Gm28911-201ENSMUST00000188837 117 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Rundc1Q0VDN7 Dpm3-201ENSMUST00000040824 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Rundc1Q0VDN7 Olfr222-201ENSMUST00000071943 1115 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Rundc1Q0VDN7 Rita1-201ENSMUST00000031599 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Rundc1Q0VDN7 B3galt4-201ENSMUST00000087543 1569 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Rundc1Q0VDN7 Pbx3-202ENSMUST00000113132 2734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Rundc1Q0VDN7 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Rundc1Q0VDN7 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Rundc1Q0VDN7 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Rundc1Q0VDN7 Snrpa-202ENSMUST00000122202 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Rundc1Q0VDN7 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Rundc1Q0VDN7 Amhr2-201ENSMUST00000023809 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Rundc1Q0VDN7 Mpp4-210ENSMUST00000191200 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Rundc1Q0VDN7 Gm43738-201ENSMUST00000200659 2635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Rundc1Q0VDN7 Fbrs-202ENSMUST00000205432 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Rundc1Q0VDN7 Hnrnpul1-201ENSMUST00000043765 3354 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Rundc1Q0VDN7 Nfxl1-202ENSMUST00000087216 3712 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Rundc1Q0VDN7 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Rundc1Q0VDN7 Me1-201ENSMUST00000034989 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Rundc1Q0VDN7 Pex11b-207ENSMUST00000165842 1562 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Rundc1Q0VDN7 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Rundc1Q0VDN7 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Rundc1Q0VDN7 Sumo2-204ENSMUST00000118155 884 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Rundc1Q0VDN7 Gm13070-201ENSMUST00000146532 768 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Rundc1Q0VDN7 Hddc3-208ENSMUST00000206122 696 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Rundc1Q0VDN7 Taldo1-201ENSMUST00000026576 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Rundc1Q0VDN7 Duoxa1-201ENSMUST00000028653 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Rundc1Q0VDN7 Nup37-201ENSMUST00000052355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Rundc1Q0VDN7 Gm24447-201ENSMUST00000083977 338 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Rundc1Q0VDN7 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Rundc1Q0VDN7 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Rundc1Q0VDN7 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Rundc1Q0VDN7 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Rundc1Q0VDN7 Gm37240-203ENSMUST00000154148 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Rundc1Q0VDN7 Ubtf-209ENSMUST00000173870 2936 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Rundc1Q0VDN7 Rwdd4a-201ENSMUST00000033973 2921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Rundc1Q0VDN7 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Rundc1Q0VDN7 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Rundc1Q0VDN7 Slc25a22-202ENSMUST00000106006 2277 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Rundc1Q0VDN7 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Rundc1Q0VDN7 Ctsk-201ENSMUST00000015664 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Rundc1Q0VDN7 Gm42872-201ENSMUST00000200026 1967 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Rundc1Q0VDN7 Hjurp-206ENSMUST00000147393 2030 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Rundc1Q0VDN7 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Rundc1Q0VDN7 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Rundc1Q0VDN7 Gins3-201ENSMUST00000034094 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Rundc1Q0VDN7 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Rundc1Q0VDN7 Ebf4-201ENSMUST00000110286 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Rundc1Q0VDN7 Gm13016-201ENSMUST00000126252 1720 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Rundc1Q0VDN7 Sgce-204ENSMUST00000115577 1776 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Rundc1Q0VDN7 Eogt-202ENSMUST00000113387 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Rundc1Q0VDN7 Vps29-204ENSMUST00000118830 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Rundc1Q0VDN7 Gm5069-202ENSMUST00000192714 1011 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Rundc1Q0VDN7 Abhd18-205ENSMUST00000203472 588 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Rundc1Q0VDN7 1700018B08Rik-201ENSMUST00000034265 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Rundc1Q0VDN7 Gm5161-201ENSMUST00000075243 853 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Rundc1Q0VDN7 Lrrc34-201ENSMUST00000029252 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Rundc1Q0VDN7 Apol7a-201ENSMUST00000010745 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Rundc1Q0VDN7 Srr-204ENSMUST00000121738 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Rundc1Q0VDN7 Gypc-202ENSMUST00000174000 2072 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Rundc1Q0VDN7 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Rundc1Q0VDN7 Ncln-202ENSMUST00000118498 2841 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Rundc1Q0VDN7 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Rundc1Q0VDN7 Cpeb4-201ENSMUST00000020543 2312 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Rundc1Q0VDN7 Mmp21-201ENSMUST00000033278 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Rundc1Q0VDN7 Slc12a8-202ENSMUST00000117134 2081 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Rundc1Q0VDN7 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Rundc1Q0VDN7 Anapc15-204ENSMUST00000106973 650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Rundc1Q0VDN7 Gm12416-201ENSMUST00000120911 1008 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Rundc1Q0VDN7 Dynlt1b-201ENSMUST00000179569 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Rundc1Q0VDN7 1700029B24Rik-201ENSMUST00000194040 497 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Rundc1Q0VDN7 Gm42722-201ENSMUST00000198855 940 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Rundc1Q0VDN7 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Rundc1Q0VDN7 Tmed5-202ENSMUST00000061203 2194 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Rundc1Q0VDN7 Osm-201ENSMUST00000075221 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Rundc1Q0VDN7 Ppp1r18-206ENSMUST00000190496 1395 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Rundc1Q0VDN7 Gm33195-201ENSMUST00000220827 2337 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Rundc1Q0VDN7 Apbb1-213ENSMUST00000189265 1429 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Rundc1Q0VDN7 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Rundc1Q0VDN7 Slc4a1ap-213ENSMUST00000202950 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Rundc1Q0VDN7 Cpped1-203ENSMUST00000121750 2614 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Rundc1Q0VDN7 Grid2ip-202ENSMUST00000110733 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Rundc1Q0VDN7 Slc6a4-202ENSMUST00000108402 2796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Rundc1Q0VDN7 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Rundc1Q0VDN7 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Rundc1Q0VDN7 Nop58-201ENSMUST00000027174 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Rundc1Q0VDN7 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Rundc1Q0VDN7 Gm4858-202ENSMUST00000194595 1810 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Rundc1Q0VDN7 Mrgprh-201ENSMUST00000075296 1809 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Rundc1Q0VDN7 Ppp1r18-205ENSMUST00000187690 3185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Rundc1Q0VDN7 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Rundc1Q0VDN7 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Rundc1Q0VDN7 Mbtd1-201ENSMUST00000063645 2138 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.3 ms