Protein–RNA interactions for Protein: Q0PD08

Rab42, Ras-related protein Rab-42, mousemouse

Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab42Q0PD08 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Rab42Q0PD08 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Rab42Q0PD08 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Rab42Q0PD08 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Rab42Q0PD08 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Rab42Q0PD08 Upk3b-201ENSMUST00000062606 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Rab42Q0PD08 Rsl1-201ENSMUST00000021997 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Rab42Q0PD08 Epb41l2-204ENSMUST00000217929 3621 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Rab42Q0PD08 Nudt18-202ENSMUST00000228554 3619 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Rab42Q0PD08 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Rab42Q0PD08 Mbp-205ENSMUST00000091789 4797 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Rab42Q0PD08 Foxl2os-201ENSMUST00000181706 3095 ntTSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Rab42Q0PD08 Otud4-203ENSMUST00000173286 7213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Rab42Q0PD08 Asl-202ENSMUST00000159619 2088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Rab42Q0PD08 Strada-201ENSMUST00000007444 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Rab42Q0PD08 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Rab42Q0PD08 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Rab42Q0PD08 Hdac5-203ENSMUST00000107151 4852 ntTSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Rab42Q0PD08 Cog3-201ENSMUST00000049168 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Rab42Q0PD08 Me2-201ENSMUST00000025439 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Rab42Q0PD08 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Rab42Q0PD08 Pou4f2-201ENSMUST00000034115 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Rab42Q0PD08 Pex12-207ENSMUST00000176518 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Rab42Q0PD08 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Rab42Q0PD08 Ntsr1-202ENSMUST00000170448 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Rab42Q0PD08 Fgd2-201ENSMUST00000024810 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Rab42Q0PD08 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Rab42Q0PD08 Armcx2-203ENSMUST00000119010 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Rab42Q0PD08 Pomgnt1-205ENSMUST00000121052 2693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.44
Rab42Q0PD08 Lrp10-201ENSMUST00000022782 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Rab42Q0PD08 Mpp3-204ENSMUST00000107168 3094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.44
Rab42Q0PD08 Dbn1-201ENSMUST00000021950 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Rab42Q0PD08 Prnd-203ENSMUST00000110171 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Rab42Q0PD08 R3hdm2-212ENSMUST00000166820 4281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.44
Rab42Q0PD08 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.44
Rab42Q0PD08 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.44
Rab42Q0PD08 Zfp467-204ENSMUST00000114559 3163 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Rab42Q0PD08 Syt1-202ENSMUST00000105276 4820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Rab42Q0PD08 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.44
Rab42Q0PD08 Ntm-203ENSMUST00000115237 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Rab42Q0PD08 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Rab42Q0PD08 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Rab42Q0PD08 Mpl-201ENSMUST00000006556 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Rab42Q0PD08 Emc7-201ENSMUST00000069747 5826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Rab42Q0PD08 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Rab42Q0PD08 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Rab42Q0PD08 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Rab42Q0PD08 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Rab42Q0PD08 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Rab42Q0PD08 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
Rab42Q0PD08 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Rab42Q0PD08 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Rab42Q0PD08 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Rab42Q0PD08 Selenbp1-201ENSMUST00000090839 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Rab42Q0PD08 Selenbp2-201ENSMUST00000090848 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Rab42Q0PD08 Atp6ap1-202ENSMUST00000114171 2157 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Rab42Q0PD08 Naa15-205ENSMUST00000193266 7480 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Rab42Q0PD08 Grm5-201ENSMUST00000107263 3516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Rab42Q0PD08 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Rab42Q0PD08 Zbtb46-201ENSMUST00000029106 5309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Rab42Q0PD08 Sbsn-201ENSMUST00000080518 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Rab42Q0PD08 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Rab42Q0PD08 Gm26525-201ENSMUST00000180666 3616 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Rab42Q0PD08 Eef1akmt3-201ENSMUST00000116231 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Rab42Q0PD08 Foxred1-202ENSMUST00000127996 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Rab42Q0PD08 Sept8-204ENSMUST00000121334 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Rab42Q0PD08 Ildr1-202ENSMUST00000089618 2850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Rab42Q0PD08 Flt4-201ENSMUST00000020617 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Rab42Q0PD08 Plxdc1-203ENSMUST00000107565 2439 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Rab42Q0PD08 Slc7a11-205ENSMUST00000194462 2419 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Rab42Q0PD08 Stx3-203ENSMUST00000075304 2430 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Rab42Q0PD08 Kcnc2-204ENSMUST00000219301 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Rab42Q0PD08 Nup88-203ENSMUST00000108531 2453 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Rab42Q0PD08 Klhl18-203ENSMUST00000198164 4538 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Rab42Q0PD08 Hcls1-201ENSMUST00000023531 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Rab42Q0PD08 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Rab42Q0PD08 Hmga2-203ENSMUST00000159699 3810 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Rab42Q0PD08 Hvcn1-201ENSMUST00000072602 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Rab42Q0PD08 Pbrm1-203ENSMUST00000052239 5065 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Rab42Q0PD08 Frmpd4-204ENSMUST00000112149 8456 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Rab42Q0PD08 Alkbh4-202ENSMUST00000100568 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Rab42Q0PD08 Rad17-202ENSMUST00000177848 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Rab42Q0PD08 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Rab42Q0PD08 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Rab42Q0PD08 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Rab42Q0PD08 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Rab42Q0PD08 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Rab42Q0PD08 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Rab42Q0PD08 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Rab42Q0PD08 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Rab42Q0PD08 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Rab42Q0PD08 Saa2-201ENSMUST00000075982 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Rab42Q0PD08 G6pdx-201ENSMUST00000004327 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Rab42Q0PD08 Tmem51os1-204ENSMUST00000153023 3440 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Rab42Q0PD08 Limd2-201ENSMUST00000045923 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Rab42Q0PD08 Mdm2-201ENSMUST00000020408 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Rab42Q0PD08 Gm16244-201ENSMUST00000159313 2327 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Rab42Q0PD08 Sema4b-201ENSMUST00000032754 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Rab42Q0PD08 Zfp64-201ENSMUST00000087971 2438 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Rab42Q0PD08 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 76.6 ms