Protein–RNA interactions for Protein: Q0HA38

Ttc21b, Tetratricopeptide repeat protein 21B, mousemouse

Predictions only

Length 1,315 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc21bQ0HA38 Gemin2-201ENSMUST00000021379 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ttc21bQ0HA38 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ttc21bQ0HA38 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ttc21bQ0HA38 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ttc21bQ0HA38 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ttc21bQ0HA38 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Ttc21bQ0HA38 Avpr2-201ENSMUST00000033765 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ttc21bQ0HA38 Cyth2-208ENSMUST00000211783 1983 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ttc21bQ0HA38 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Ttc21bQ0HA38 Cant1-203ENSMUST00000106287 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ttc21bQ0HA38 Ddo-203ENSMUST00000213503 1759 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ttc21bQ0HA38 4931406C07Rik-208ENSMUST00000216955 1750 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ttc21bQ0HA38 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ttc21bQ0HA38 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ttc21bQ0HA38 Gm2231-201ENSMUST00000125661 612 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Ttc21bQ0HA38 Gm20404-201ENSMUST00000174032 621 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ttc21bQ0HA38 Duoxa2-201ENSMUST00000028656 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ttc21bQ0HA38 1700007G11Rik-201ENSMUST00000080333 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ttc21bQ0HA38 Cryge-201ENSMUST00000087359 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ttc21bQ0HA38 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ttc21bQ0HA38 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ttc21bQ0HA38 Abcg8-202ENSMUST00000170725 2415 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ttc21bQ0HA38 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ttc21bQ0HA38 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ttc21bQ0HA38 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ttc21bQ0HA38 Saxo1-201ENSMUST00000030216 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ttc21bQ0HA38 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ttc21bQ0HA38 Psmd8-207ENSMUST00000209034 1983 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ttc21bQ0HA38 Cox16-202ENSMUST00000110340 668 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ttc21bQ0HA38 Prss41-202ENSMUST00000122936 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ttc21bQ0HA38 2310057J18Rik-201ENSMUST00000015663 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ttc21bQ0HA38 Gm38161-201ENSMUST00000195344 576 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ttc21bQ0HA38 Gm7118-201ENSMUST00000200167 1003 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Ttc21bQ0HA38 CT033793.1-201ENSMUST00000216883 565 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ttc21bQ0HA38 Dph3-201ENSMUST00000022461 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ttc21bQ0HA38 Tnfrsf4-201ENSMUST00000030952 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ttc21bQ0HA38 Chchd1-201ENSMUST00000071215 616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ttc21bQ0HA38 H2-Q6-202ENSMUST00000174699 2085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ttc21bQ0HA38 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ttc21bQ0HA38 Car10-203ENSMUST00000107858 2742 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ttc21bQ0HA38 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ttc21bQ0HA38 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ttc21bQ0HA38 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ttc21bQ0HA38 Gm12500-202ENSMUST00000186471 2428 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Ttc21bQ0HA38 BC039966-201ENSMUST00000141582 1371 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ttc21bQ0HA38 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ttc21bQ0HA38 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ttc21bQ0HA38 Kyat1-205ENSMUST00000113662 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ttc21bQ0HA38 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ttc21bQ0HA38 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ttc21bQ0HA38 Slc12a8-202ENSMUST00000117134 2081 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ttc21bQ0HA38 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ttc21bQ0HA38 Ulk3-201ENSMUST00000053230 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ttc21bQ0HA38 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ttc21bQ0HA38 Gm29455-201ENSMUST00000186504 2659 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ttc21bQ0HA38 Exosc5-206ENSMUST00000206561 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ttc21bQ0HA38 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ttc21bQ0HA38 Slc6a19os-201ENSMUST00000022049 1532 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ttc21bQ0HA38 Gm24255-201ENSMUST00000104481 128 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Ttc21bQ0HA38 Tomm5-204ENSMUST00000107810 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ttc21bQ0HA38 Gm16191-202ENSMUST00000148464 484 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ttc21bQ0HA38 Gm7809-201ENSMUST00000153199 742 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Ttc21bQ0HA38 Cdk3-ps-202ENSMUST00000174177 915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ttc21bQ0HA38 Gm6621-201ENSMUST00000193251 772 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Ttc21bQ0HA38 AC160029.2-201ENSMUST00000218285 548 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ttc21bQ0HA38 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ttc21bQ0HA38 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ttc21bQ0HA38 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ttc21bQ0HA38 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ttc21bQ0HA38 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ttc21bQ0HA38 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ttc21bQ0HA38 Lrp1-202ENSMUST00000118455 2097 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ttc21bQ0HA38 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ttc21bQ0HA38 Ccdc151-201ENSMUST00000044926 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ttc21bQ0HA38 Gm14608-201ENSMUST00000120030 1553 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Ttc21bQ0HA38 Plekha1-201ENSMUST00000048180 3321 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ttc21bQ0HA38 Msantd3-201ENSMUST00000061135 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ttc21bQ0HA38 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ttc21bQ0HA38 Nt5c3b-203ENSMUST00000107397 1348 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ttc21bQ0HA38 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ttc21bQ0HA38 Il17re-202ENSMUST00000058548 2940 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ttc21bQ0HA38 Fam71f1-203ENSMUST00000164560 1411 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ttc21bQ0HA38 Cpped1-203ENSMUST00000121750 2614 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ttc21bQ0HA38 Rasgrp2-207ENSMUST00000113475 573 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ttc21bQ0HA38 Selenoh-203ENSMUST00000117299 747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ttc21bQ0HA38 Gm13297-201ENSMUST00000120205 934 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
Ttc21bQ0HA38 Gm14508-201ENSMUST00000127049 901 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ttc21bQ0HA38 Gm29199-201ENSMUST00000187766 775 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
Ttc21bQ0HA38 Gm10608-202ENSMUST00000213924 676 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
Ttc21bQ0HA38 AC093022.1-201ENSMUST00000226949 1072 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
Ttc21bQ0HA38 Lcmt1-201ENSMUST00000033025 1369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ttc21bQ0HA38 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ttc21bQ0HA38 Iffo2-202ENSMUST00000123827 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ttc21bQ0HA38 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ttc21bQ0HA38 Gm38197-201ENSMUST00000192320 2122 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
Ttc21bQ0HA38 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ttc21bQ0HA38 Samd4-203ENSMUST00000125113 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ttc21bQ0HA38 Lypla1-201ENSMUST00000027036 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ttc21bQ0HA38 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ttc21bQ0HA38 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.7 ms