Protein–RNA interactions for Protein: Q09098

Pate4, Prostate and testis expressed protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 99 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pate4Q09098 1500015A07Rik-201ENSMUST00000184181 1865 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Pate4Q09098 Zscan22-203ENSMUST00000119989 2087 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Pate4Q09098 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Pate4Q09098 Egln3-201ENSMUST00000039516 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Pate4Q09098 Amz1-201ENSMUST00000060918 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Pate4Q09098 Obsl1-201ENSMUST00000113565 3379 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Pate4Q09098 Slc19a2-201ENSMUST00000044021 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Pate4Q09098 Znrf1-203ENSMUST00000168428 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Pate4Q09098 Proser1-201ENSMUST00000058577 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Pate4Q09098 Ate1-202ENSMUST00000035458 4685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Pate4Q09098 Pcdha1-202ENSMUST00000193839 4925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Pate4Q09098 Gtf2ird1-229ENSMUST00000202554 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Pate4Q09098 Pdgfc-201ENSMUST00000029652 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Pate4Q09098 Arhgef1-203ENSMUST00000117419 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Pate4Q09098 Arhgap4-204ENSMUST00000114406 2749 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Pate4Q09098 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Pate4Q09098 Ccdc134-201ENSMUST00000089174 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Pate4Q09098 Pik3cd-214ENSMUST00000177654 4765 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Pate4Q09098 Nrxn1-201ENSMUST00000054059 4697 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Pate4Q09098 Zfp296-201ENSMUST00000108453 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Pate4Q09098 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Pate4Q09098 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Pate4Q09098 Lin54-208ENSMUST00000149714 3869 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Pate4Q09098 Atp2a3-203ENSMUST00000108485 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Pate4Q09098 9330162012Rik-201ENSMUST00000154919 3836 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Pate4Q09098 Gm26525-201ENSMUST00000180666 3616 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Pate4Q09098 Gm26867-201ENSMUST00000180963 3615 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Pate4Q09098 Opn4-201ENSMUST00000022331 2156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Pate4Q09098 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Pate4Q09098 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Pate4Q09098 Il6ra-201ENSMUST00000029559 3343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Pate4Q09098 Lpar2-202ENSMUST00000164890 5800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Pate4Q09098 Pigg-202ENSMUST00000118910 3030 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Pate4Q09098 2810402E24Rik-201ENSMUST00000190699 3040 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Pate4Q09098 Cybrd1-201ENSMUST00000028403 5339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Pate4Q09098 Gm12404-201ENSMUST00000122839 1661 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Pate4Q09098 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Pate4Q09098 Amdhd2-201ENSMUST00000040735 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Pate4Q09098 Gm2762-202ENSMUST00000201517 2339 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Pate4Q09098 Ubl4b-201ENSMUST00000052853 1387 ntAPPRIS P1 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Pate4Q09098 Hist3h2bb-ps-201ENSMUST00000117558 465 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Pate4Q09098 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Pate4Q09098 Gm15458-201ENSMUST00000156950 709 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Pate4Q09098 Pbx2-205ENSMUST00000183827 1186 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Pate4Q09098 Ighv1-25-201ENSMUST00000195638 345 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Pate4Q09098 AC131690.1-201ENSMUST00000218406 374 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Pate4Q09098 Gm18027-201ENSMUST00000218947 619 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Pate4Q09098 AC121804.3-201ENSMUST00000223420 295 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Pate4Q09098 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Pate4Q09098 Oxt-201ENSMUST00000028764 537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Pate4Q09098 Rtl8c-201ENSMUST00000063384 401 ntAPPRIS P1 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Pate4Q09098 Prr23a2-201ENSMUST00000071302 881 ntAPPRIS P1 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Pate4Q09098 Cenpm-201ENSMUST00000089155 1109 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Pate4Q09098 Exoc6b-203ENSMUST00000160197 5439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Pate4Q09098 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Pate4Q09098 2900005J15Rik-202ENSMUST00000171190 2025 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Pate4Q09098 Spon2-201ENSMUST00000046186 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Pate4Q09098 Atxn2l-201ENSMUST00000040202 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Pate4Q09098 Scn4b-201ENSMUST00000060125 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Pate4Q09098 Nfe2-205ENSMUST00000133600 1605 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Pate4Q09098 Speg-205ENSMUST00000113590 3393 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Pate4Q09098 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Pate4Q09098 Cul5-209ENSMUST00000166367 5942 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Pate4Q09098 Gm2155-201ENSMUST00000181581 1974 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Pate4Q09098 Tyw1-203ENSMUST00000100662 1867 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Pate4Q09098 Mocs2-208ENSMUST00000166176 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Pate4Q09098 Cadps2-209ENSMUST00000142913 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Pate4Q09098 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Pate4Q09098 Heg1-205ENSMUST00000152782 8161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Pate4Q09098 Eif4g1-205ENSMUST00000115461 5507 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Pate4Q09098 Canx-201ENSMUST00000020637 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.59
Pate4Q09098 AI593442-203ENSMUST00000213937 5674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.59
Pate4Q09098 Dnajc6-204ENSMUST00000106930 5127 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.59
Pate4Q09098 Nek6-203ENSMUST00000112902 3147 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Pate4Q09098 Kcnj3-203ENSMUST00000112633 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Pate4Q09098 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Pate4Q09098 Pcdhga12-201ENSMUST00000044851 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Pate4Q09098 Sept1-202ENSMUST00000106314 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Pate4Q09098 Tmem9-201ENSMUST00000063719 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Pate4Q09098 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Pate4Q09098 Ero1lb-202ENSMUST00000220811 3341 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Pate4Q09098 Mcoln2-201ENSMUST00000011152 2520 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Pate4Q09098 Ppt2-201ENSMUST00000064953 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Pate4Q09098 Opa1-201ENSMUST00000038867 3230 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Pate4Q09098 Agap1-201ENSMUST00000027521 11921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Pate4Q09098 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Pate4Q09098 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Pate4Q09098 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Pate4Q09098 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Pate4Q09098 Styxl1-207ENSMUST00000177559 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Pate4Q09098 Gm27533-201ENSMUST00000183800 152 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Pate4Q09098 Gm37714-201ENSMUST00000194742 342 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Pate4Q09098 Tpi-rs5-201ENSMUST00000216947 774 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Pate4Q09098 Rnf113a1-201ENSMUST00000046433 1223 ntAPPRIS P1 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Pate4Q09098 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Pate4Q09098 Tmem181b-ps-203ENSMUST00000188746 1626 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Pate4Q09098 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Pate4Q09098 Slc45a1-201ENSMUST00000037827 3387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Pate4Q09098 Dnajc27-201ENSMUST00000020986 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Pate4Q09098 Zbtb39-201ENSMUST00000054287 5960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.5 ms