Protein–RNA interactions for Protein: Q08331

Calb2, Calretinin, mousemouse

Predictions only

Length 271 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Calb2Q08331 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Calb2Q08331 Miga2-208ENSMUST00000140075 2196 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Calb2Q08331 Ppara-202ENSMUST00000109422 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Calb2Q08331 Gm37105-201ENSMUST00000192251 2085 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Calb2Q08331 Csnk1a1-202ENSMUST00000163205 3204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Calb2Q08331 Egfl6-201ENSMUST00000000412 2704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Calb2Q08331 Inpp5e-205ENSMUST00000145701 4147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Calb2Q08331 Gm26525-201ENSMUST00000180666 3616 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Calb2Q08331 Gm5939-201ENSMUST00000119613 2874 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Calb2Q08331 D630014O11Rik-201ENSMUST00000160562 3019 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Calb2Q08331 Matn3-201ENSMUST00000020899 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Calb2Q08331 Micu1-202ENSMUST00000092508 2294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Calb2Q08331 Ntm-203ENSMUST00000115237 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Calb2Q08331 Gcnt2-205ENSMUST00000225759 1366 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Calb2Q08331 Lrrc8a-202ENSMUST00000113654 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Calb2Q08331 Apaf1-207ENSMUST00000161987 2710 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Calb2Q08331 Cyth1-203ENSMUST00000106302 3119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Calb2Q08331 Gm26616-202ENSMUST00000195676 3107 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Calb2Q08331 Gucy2e-201ENSMUST00000021259 8331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Calb2Q08331 Fbxl12-207ENSMUST00000151861 1668 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Calb2Q08331 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Calb2Q08331 Gm11899-201ENSMUST00000142373 745 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Calb2Q08331 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Calb2Q08331 Aqp10-ps-201ENSMUST00000199555 611 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Calb2Q08331 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Calb2Q08331 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Calb2Q08331 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Calb2Q08331 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Calb2Q08331 Espn-213ENSMUST00000105659 3595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Calb2Q08331 Cdyl-202ENSMUST00000163595 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Calb2Q08331 Caskin2-201ENSMUST00000041684 4929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Calb2Q08331 Atxn2l-201ENSMUST00000040202 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Calb2Q08331 Phf21b-201ENSMUST00000016768 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Calb2Q08331 Vmn1r45-207ENSMUST00000228492 2849 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Calb2Q08331 Cpeb1-201ENSMUST00000098331 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Calb2Q08331 Tcp10b-202ENSMUST00000116666 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Calb2Q08331 Mcpt9-201ENSMUST00000095798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Calb2Q08331 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Calb2Q08331 Gria4-203ENSMUST00000163309 2338 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Calb2Q08331 Bcl11b-201ENSMUST00000066060 8111 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Calb2Q08331 Drc1-201ENSMUST00000101448 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Calb2Q08331 Nkain3-201ENSMUST00000102998 3098 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Calb2Q08331 Phkg1-201ENSMUST00000026617 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Calb2Q08331 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Calb2Q08331 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Calb2Q08331 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Calb2Q08331 Nynrin-202ENSMUST00000168479 7511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Calb2Q08331 Gm45242-201ENSMUST00000210666 2129 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Calb2Q08331 Alox12e-201ENSMUST00000019051 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Calb2Q08331 Endou-201ENSMUST00000023105 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Calb2Q08331 Emc7-201ENSMUST00000069747 5826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Calb2Q08331 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Calb2Q08331 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Calb2Q08331 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Calb2Q08331 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Calb2Q08331 Atcayos-202ENSMUST00000129950 1117 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Calb2Q08331 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Calb2Q08331 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Calb2Q08331 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Calb2Q08331 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Calb2Q08331 Ank3-223ENSMUST00000182557 1569 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Calb2Q08331 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Calb2Q08331 9230110C19Rik-201ENSMUST00000065291 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Calb2Q08331 Dsp-202ENSMUST00000127906 7761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Calb2Q08331 Smim13-201ENSMUST00000165561 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Calb2Q08331 Ccdc22-201ENSMUST00000033483 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Calb2Q08331 Ttc25-202ENSMUST00000092684 2240 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Calb2Q08331 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Calb2Q08331 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Calb2Q08331 Camk2b-203ENSMUST00000066431 1603 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Calb2Q08331 Gm13730-201ENSMUST00000121036 1462 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Calb2Q08331 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Calb2Q08331 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Calb2Q08331 Zc3h13-201ENSMUST00000022577 6151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Calb2Q08331 Aldh6a1-201ENSMUST00000085192 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Calb2Q08331 Fktn-204ENSMUST00000221657 6241 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Calb2Q08331 Gm13814-201ENSMUST00000141341 3077 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Calb2Q08331 Cacna1g-203ENSMUST00000103166 8104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Calb2Q08331 Dmtn-208ENSMUST00000228009 2643 ntAPPRIS P2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Calb2Q08331 Pitpnm2-205ENSMUST00000161273 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Calb2Q08331 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Calb2Q08331 Mnt-201ENSMUST00000000291 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Calb2Q08331 Gpr153-203ENSMUST00000105651 3777 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Calb2Q08331 Gpr153-201ENSMUST00000055754 3757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Calb2Q08331 Trabd2b-201ENSMUST00000094894 6617 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Calb2Q08331 Ptk2-201ENSMUST00000110036 4184 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Calb2Q08331 Mpl-203ENSMUST00000106375 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Calb2Q08331 Pdlim5-208ENSMUST00000196220 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Calb2Q08331 Pik3r6-202ENSMUST00000102613 3225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Calb2Q08331 Pla2g15-204ENSMUST00000212963 2578 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Calb2Q08331 Pcdh7-203ENSMUST00000191837 8785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Calb2Q08331 Gm26788-201ENSMUST00000181692 1750 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Calb2Q08331 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Calb2Q08331 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Calb2Q08331 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Calb2Q08331 Gm14342-201ENSMUST00000137629 2119 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Calb2Q08331 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Calb2Q08331 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Calb2Q08331 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Calb2Q08331 Mobp-207ENSMUST00000215512 498 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.4 ms