Protein–RNA interactions for Protein: Q07409

Cntn3, Contactin-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,028 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cntn3Q07409 Slc5a2-202ENSMUST00000118169 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Cntn3Q07409 Ptk2-202ENSMUST00000170939 3598 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Cntn3Q07409 4933435F18Rik-202ENSMUST00000154878 2174 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cntn3Q07409 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cntn3Q07409 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cntn3Q07409 Fam20a-201ENSMUST00000020938 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cntn3Q07409 Cuedc2-201ENSMUST00000051234 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cntn3Q07409 Pax5-213ENSMUST00000173821 996 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cntn3Q07409 Tac2-202ENSMUST00000179960 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cntn3Q07409 Gm26787-201ENSMUST00000180474 608 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cntn3Q07409 Gm5279-201ENSMUST00000199575 745 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Cntn3Q07409 AC155286.1-201ENSMUST00000218632 448 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Cntn3Q07409 AC087891.2-201ENSMUST00000219293 658 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cntn3Q07409 Tac2-201ENSMUST00000026466 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cntn3Q07409 Tpd52-201ENSMUST00000063496 697 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cntn3Q07409 Eapp-201ENSMUST00000067272 590 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cntn3Q07409 Flt3-201ENSMUST00000049324 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cntn3Q07409 Adra1b-204ENSMUST00000167574 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cntn3Q07409 AC114543.1-201ENSMUST00000226451 1558 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Cntn3Q07409 Six3os1-211ENSMUST00000176958 2889 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cntn3Q07409 R3hcc1-202ENSMUST00000121142 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cntn3Q07409 Gng4-201ENSMUST00000021734 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cntn3Q07409 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cntn3Q07409 AC121801.1-201ENSMUST00000225363 1899 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Cntn3Q07409 Erc1-207ENSMUST00000183911 3865 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cntn3Q07409 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cntn3Q07409 Syncrip-209ENSMUST00000174361 1767 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cntn3Q07409 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cntn3Q07409 Gm9115-201ENSMUST00000120192 1348 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Cntn3Q07409 Syt8-201ENSMUST00000097939 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cntn3Q07409 AI480526-202ENSMUST00000159637 1697 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cntn3Q07409 Gm11555-202ENSMUST00000104929 638 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cntn3Q07409 Gm6912-201ENSMUST00000117218 544 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Cntn3Q07409 Gm15240-201ENSMUST00000118156 720 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Cntn3Q07409 Rnd1-203ENSMUST00000120997 856 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cntn3Q07409 Gm26600-201ENSMUST00000181637 1256 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cntn3Q07409 Mir6392-201ENSMUST00000184924 108 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Cntn3Q07409 Poc1a-205ENSMUST00000191434 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cntn3Q07409 9430085M18Rik-201ENSMUST00000198824 1178 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cntn3Q07409 Gm9908-201ENSMUST00000211534 448 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Cntn3Q07409 Sftpa1-201ENSMUST00000022314 851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cntn3Q07409 Tmco5b-201ENSMUST00000040856 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cntn3Q07409 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cntn3Q07409 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
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Cntn3Q07409 Tfap2a-202ENSMUST00000110193 2863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cntn3Q07409 Fam192a-201ENSMUST00000034226 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cntn3Q07409 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cntn3Q07409 Zfp169-203ENSMUST00000176176 2162 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cntn3Q07409 Gm45003-201ENSMUST00000205875 2158 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Cntn3Q07409 Dmkn-205ENSMUST00000165887 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cntn3Q07409 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cntn3Q07409 E2f3-203ENSMUST00000221536 4597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cntn3Q07409 E2f3-204ENSMUST00000222730 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cntn3Q07409 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cntn3Q07409 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cntn3Q07409 Kctd14-201ENSMUST00000050732 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cntn3Q07409 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cntn3Q07409 4930579G24Rik-201ENSMUST00000029388 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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Cntn3Q07409 Tcn2-204ENSMUST00000109990 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cntn3Q07409 Gm13657-201ENSMUST00000135682 1939 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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Cntn3Q07409 Ube2i-201ENSMUST00000049911 1138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cntn3Q07409 Nup37-201ENSMUST00000052355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cntn3Q07409 Tmem107-202ENSMUST00000094081 1263 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cntn3Q07409 Trim15-201ENSMUST00000025329 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cntn3Q07409 Ces2f-201ENSMUST00000076384 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cntn3Q07409 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cntn3Q07409 Gm30238-201ENSMUST00000195528 2603 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Cntn3Q07409 Kcnma1-214ENSMUST00000190044 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cntn3Q07409 Suv39h1-203ENSMUST00000115638 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cntn3Q07409 Olfr317-203ENSMUST00000216196 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cntn3Q07409 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cntn3Q07409 Hnrnpm-202ENSMUST00000114385 2550 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cntn3Q07409 Socs3-201ENSMUST00000054002 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cntn3Q07409 Eif4e3-201ENSMUST00000032151 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cntn3Q07409 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cntn3Q07409 Srp72-202ENSMUST00000120550 2297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cntn3Q07409 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cntn3Q07409 Keap1-205ENSMUST00000194542 3151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cntn3Q07409 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cntn3Q07409 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cntn3Q07409 Zfp747-201ENSMUST00000067425 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cntn3Q07409 Pde4d-203ENSMUST00000117420 1955 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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Cntn3Q07409 Isca2-201ENSMUST00000021667 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cntn3Q07409 Timm9-206ENSMUST00000221367 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
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