Protein–RNA interactions for Protein: Q06348

Prrx2, Paired mesoderm homeobox protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 247 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prrx2Q06348 Ints1-201ENSMUST00000072607 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Prrx2Q06348 Etv6-202ENSMUST00000111963 5707 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Prrx2Q06348 Nfe2-205ENSMUST00000133600 1605 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Prrx2Q06348 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Prrx2Q06348 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Prrx2Q06348 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Prrx2Q06348 Ppp1r12b-201ENSMUST00000045665 8840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Prrx2Q06348 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Prrx2Q06348 Apol7a-201ENSMUST00000010745 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Prrx2Q06348 Gm6871-201ENSMUST00000073410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Prrx2Q06348 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Prrx2Q06348 Apbb1-215ENSMUST00000190369 1882 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Prrx2Q06348 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Prrx2Q06348 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Prrx2Q06348 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Prrx2Q06348 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Prrx2Q06348 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Prrx2Q06348 Nid2-201ENSMUST00000022340 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Prrx2Q06348 Gpr18-201ENSMUST00000055475 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Prrx2Q06348 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Prrx2Q06348 Allc-202ENSMUST00000110917 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Prrx2Q06348 Gm12846-201ENSMUST00000120431 1373 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Prrx2Q06348 Creld2-201ENSMUST00000024042 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Prrx2Q06348 Cacna1g-207ENSMUST00000107789 8383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Prrx2Q06348 Map3k8-201ENSMUST00000025078 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Prrx2Q06348 Ildr2-201ENSMUST00000111416 8251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Prrx2Q06348 Wfdc9-202ENSMUST00000109335 547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Prrx2Q06348 Gm15371-201ENSMUST00000117057 784 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Prrx2Q06348 Cdk4-202ENSMUST00000120226 714 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Prrx2Q06348 Sbk3-201ENSMUST00000133272 1086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Prrx2Q06348 Gm17180-201ENSMUST00000172211 435 ntTSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Prrx2Q06348 Swi5-207ENSMUST00000183946 768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Prrx2Q06348 Gm44397-201ENSMUST00000195950 113 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Prrx2Q06348 Gm35409-201ENSMUST00000196412 1102 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Prrx2Q06348 4930447A16Rik-201ENSMUST00000022897 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Prrx2Q06348 Comt-201ENSMUST00000000335 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Prrx2Q06348 Lim2-201ENSMUST00000004732 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Prrx2Q06348 Gm7324-201ENSMUST00000094051 1647 ntAPPRIS P1 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Prrx2Q06348 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Prrx2Q06348 Kir3dl1-202ENSMUST00000113105 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Prrx2Q06348 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Prrx2Q06348 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Prrx2Q06348 Cgn-201ENSMUST00000107272 4963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Prrx2Q06348 C130012C08Rik-201ENSMUST00000194287 3665 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Prrx2Q06348 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Prrx2Q06348 Hadhb-201ENSMUST00000026841 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Prrx2Q06348 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Prrx2Q06348 Dab1-203ENSMUST00000106830 5278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Prrx2Q06348 Kctd18-202ENSMUST00000114410 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Prrx2Q06348 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
Prrx2Q06348 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
Prrx2Q06348 Pcdha11-201ENSMUST00000115658 5359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
Prrx2Q06348 Mypopos-202ENSMUST00000205975 2321 ntBASIC11.83□□□□□ -0.51
Prrx2Q06348 Ankra2-208ENSMUST00000226100 1476 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Prrx2Q06348 Nbeal2-206ENSMUST00000133191 8782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Prrx2Q06348 Pigg-203ENSMUST00000119014 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Prrx2Q06348 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Prrx2Q06348 Pdcd6ip-201ENSMUST00000035086 5951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Prrx2Q06348 Vldlr-207ENSMUST00000167487 7971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Prrx2Q06348 Fam71f1-204ENSMUST00000166462 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Prrx2Q06348 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Prrx2Q06348 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Prrx2Q06348 Taldo1-204ENSMUST00000211654 1362 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Prrx2Q06348 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Prrx2Q06348 Arhgap20-201ENSMUST00000065496 7161 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Prrx2Q06348 Sptb-201ENSMUST00000021458 10394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Prrx2Q06348 Xpot-201ENSMUST00000039810 5992 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Prrx2Q06348 Crem-201ENSMUST00000025069 2931 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Prrx2Q06348 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Prrx2Q06348 Txn2-202ENSMUST00000100486 676 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Prrx2Q06348 Rph3al-203ENSMUST00000108420 695 ntTSL 3 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Prrx2Q06348 Gm5678-201ENSMUST00000120115 939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Prrx2Q06348 Gm13385-201ENSMUST00000121089 220 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Prrx2Q06348 Gm16229-201ENSMUST00000133270 1232 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Prrx2Q06348 Spdye4b-202ENSMUST00000159781 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Prrx2Q06348 Ccdc70-201ENSMUST00000017193 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Prrx2Q06348 1700092C10Rik-201ENSMUST00000172547 585 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Prrx2Q06348 1700065I16Rik-202ENSMUST00000185477 813 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Prrx2Q06348 Gm38002-201ENSMUST00000193255 180 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Prrx2Q06348 1110006O24Rik-201ENSMUST00000201728 768 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Prrx2Q06348 Gm7783-201ENSMUST00000204795 781 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Prrx2Q06348 Gm19309-201ENSMUST00000218295 205 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Prrx2Q06348 Gm18027-201ENSMUST00000218947 619 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Prrx2Q06348 1700127F24Rik-201ENSMUST00000221685 604 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Prrx2Q06348 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Prrx2Q06348 Olfr718-ps1-202ENSMUST00000213631 4737 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Prrx2Q06348 Hlcs-202ENSMUST00000163193 5371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Prrx2Q06348 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Prrx2Q06348 Mageb10-ps-201ENSMUST00000119697 1407 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Prrx2Q06348 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Prrx2Q06348 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Prrx2Q06348 Tcf12-202ENSMUST00000183404 6299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Prrx2Q06348 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Prrx2Q06348 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Prrx2Q06348 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Prrx2Q06348 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Prrx2Q06348 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Prrx2Q06348 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Prrx2Q06348 Gatd1-201ENSMUST00000106008 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Prrx2Q06348 Klk7-201ENSMUST00000032955 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.8 ms