Protein–RNA interactions for Protein: Q06138

Cab39, Calcium-binding protein 39, mousemouse

Predictions only

Length 341 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cab39Q06138 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Cab39Q06138 Dph3-202ENSMUST00000067955 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Cab39Q06138 Dph2-201ENSMUST00000030265 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Cab39Q06138 Bcl2l13-201ENSMUST00000009256 6925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Cab39Q06138 Dennd4c-202ENSMUST00000082026 7940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Cab39Q06138 Snap23-202ENSMUST00000110711 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Cab39Q06138 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Cab39Q06138 Gm853-201ENSMUST00000023884 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Cab39Q06138 Camk2b-208ENSMUST00000109812 1875 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Cab39Q06138 Klf12-201ENSMUST00000097079 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Cab39Q06138 Stk25-201ENSMUST00000027498 4249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Cab39Q06138 Elf1-201ENSMUST00000040131 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Cab39Q06138 Eef1d-206ENSMUST00000109975 2842 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Cab39Q06138 Kansl3-205ENSMUST00000186470 2801 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Cab39Q06138 Pde4d-203ENSMUST00000117420 1955 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Cab39Q06138 Mfn2-203ENSMUST00000105715 4043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Cab39Q06138 Golga4-201ENSMUST00000084820 7583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Cab39Q06138 Gpsm1-204ENSMUST00000114134 2043 ntTSL 3 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Cab39Q06138 Anapc7-202ENSMUST00000119792 3599 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Cab39Q06138 Gnas-210ENSMUST00000109095 2059 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Cab39Q06138 Ciz1-202ENSMUST00000113331 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.36
Cab39Q06138 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Cab39Q06138 Mettl13-201ENSMUST00000028017 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Cab39Q06138 Ccdc155-201ENSMUST00000121017 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Cab39Q06138 Ddi2-202ENSMUST00000177592 3539 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Cab39Q06138 Gsdmd-201ENSMUST00000023238 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Cab39Q06138 Tbc1d10c-201ENSMUST00000045864 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Cab39Q06138 Ago1-201ENSMUST00000097888 7227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Cab39Q06138 Gm15889-202ENSMUST00000212669 2443 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Cab39Q06138 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Cab39Q06138 Thnsl2-201ENSMUST00000074241 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Cab39Q06138 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Cab39Q06138 Gm4981-201ENSMUST00000099726 1854 ntAPPRIS P1 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Cab39Q06138 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Cab39Q06138 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Cab39Q06138 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Cab39Q06138 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Cab39Q06138 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Cab39Q06138 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Cab39Q06138 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Cab39Q06138 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Cab39Q06138 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Cab39Q06138 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Cab39Q06138 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Cab39Q06138 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Cab39Q06138 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Cab39Q06138 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Cab39Q06138 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Cab39Q06138 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Cab39Q06138 Umad1-208ENSMUST00000162034 2015 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Cab39Q06138 Brwd1-201ENSMUST00000023631 8209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Cab39Q06138 Cngb1-202ENSMUST00000119870 6189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Cab39Q06138 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Cab39Q06138 Zfp385c-201ENSMUST00000103119 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Cab39Q06138 Cpxm2-201ENSMUST00000033149 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Cab39Q06138 Kif3b-201ENSMUST00000028977 5635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Cab39Q06138 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Cab39Q06138 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Cab39Q06138 Maged2-203ENSMUST00000112699 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Cab39Q06138 Serpinh1-201ENSMUST00000094154 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Cab39Q06138 Kif3a-208ENSMUST00000173744 2257 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Cab39Q06138 Olfr533-203ENSMUST00000215308 2345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Cab39Q06138 Nek6-203ENSMUST00000112902 3147 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Cab39Q06138 Fbxo46-201ENSMUST00000053109 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Cab39Q06138 Ddx31-201ENSMUST00000113853 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Cab39Q06138 Fam222b-201ENSMUST00000073705 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Cab39Q06138 Samd5-201ENSMUST00000100070 6818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Cab39Q06138 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Cab39Q06138 Gm37660-201ENSMUST00000192754 1732 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Cab39Q06138 Kndc1-201ENSMUST00000053445 7299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Cab39Q06138 Eif4enif1-213ENSMUST00000179770 3676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Cab39Q06138 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Cab39Q06138 Nhlh2-203ENSMUST00000198675 3943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Cab39Q06138 Atg16l1-203ENSMUST00000113190 3102 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Cab39Q06138 Il20ra-201ENSMUST00000020185 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Cab39Q06138 Il17rd-203ENSMUST00000225146 3366 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Cab39Q06138 Tmprss11d-202ENSMUST00000122377 2256 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Cab39Q06138 Troap-201ENSMUST00000039665 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Cab39Q06138 Slc41a3-201ENSMUST00000032177 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Cab39Q06138 Mcph1-201ENSMUST00000039412 4662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Cab39Q06138 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Cab39Q06138 Radil-204ENSMUST00000110785 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Cab39Q06138 Gpr153-203ENSMUST00000105651 3777 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Cab39Q06138 Gpr153-201ENSMUST00000055754 3757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Cab39Q06138 Zfp94-201ENSMUST00000032673 2529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Cab39Q06138 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Cab39Q06138 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Cab39Q06138 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Cab39Q06138 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Cab39Q06138 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Cab39Q06138 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Cab39Q06138 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Cab39Q06138 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Cab39Q06138 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Cab39Q06138 AI464131-201ENSMUST00000054920 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Cab39Q06138 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Cab39Q06138 Gm17029-202ENSMUST00000146124 2899 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Cab39Q06138 Tbc1d9b-201ENSMUST00000093138 4407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Cab39Q06138 Fn1-216ENSMUST00000189821 7410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Cab39Q06138 Pcnx-201ENSMUST00000021567 12139 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.2 ms