Protein–RNA interactions for Protein: Q05909

Ptprg, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase gamma, mousemouse

Predictions only

Length 1,442 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprgQ05909 Mymx-204ENSMUST00000208801 437 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PtprgQ05909 Olfr983-201ENSMUST00000050996 1050 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PtprgQ05909 Dnal4-202ENSMUST00000069877 1011 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PtprgQ05909 Rpl36-201ENSMUST00000080492 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PtprgQ05909 Olfr1209-201ENSMUST00000099809 933 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PtprgQ05909 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PtprgQ05909 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PtprgQ05909 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PtprgQ05909 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PtprgQ05909 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PtprgQ05909 Gm12500-202ENSMUST00000186471 2428 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
PtprgQ05909 Ttc5-201ENSMUST00000006451 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PtprgQ05909 Acsl6-201ENSMUST00000000145 2297 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PtprgQ05909 Golim4-208ENSMUST00000167078 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PtprgQ05909 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PtprgQ05909 Herpud1-205ENSMUST00000161576 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PtprgQ05909 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PtprgQ05909 Smpd2-201ENSMUST00000019965 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PtprgQ05909 BC051019-201ENSMUST00000033334 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PtprgQ05909 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PtprgQ05909 Nipsnap3b-202ENSMUST00000107665 848 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PtprgQ05909 Rpl3-ps2-201ENSMUST00000117131 1214 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
PtprgQ05909 Fzr1-202ENSMUST00000118812 1215 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PtprgQ05909 Gm11637-201ENSMUST00000120601 592 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
PtprgQ05909 Isg20-204ENSMUST00000121645 1087 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PtprgQ05909 Gm5850-201ENSMUST00000192923 1206 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
PtprgQ05909 Polr2e-201ENSMUST00000004786 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PtprgQ05909 Otud6a-201ENSMUST00000060241 873 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PtprgQ05909 n-R5s195-201ENSMUST00000082891 119 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
PtprgQ05909 Adamts3-204ENSMUST00000198151 1833 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PtprgQ05909 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PtprgQ05909 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PtprgQ05909 Clcnkb-202ENSMUST00000105788 2490 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PtprgQ05909 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
PtprgQ05909 Trim45-203ENSMUST00000106980 3337 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PtprgQ05909 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PtprgQ05909 Gm14608-201ENSMUST00000120030 1553 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
PtprgQ05909 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PtprgQ05909 P2ry2-201ENSMUST00000037540 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PtprgQ05909 Krt40-201ENSMUST00000074253 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PtprgQ05909 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PtprgQ05909 Lrguk-202ENSMUST00000101564 967 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PtprgQ05909 Gm16479-201ENSMUST00000121706 932 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
PtprgQ05909 Gm16124-201ENSMUST00000146938 516 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
PtprgQ05909 Gm45880-201ENSMUST00000213041 853 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
PtprgQ05909 AC154276.1-201ENSMUST00000228874 1299 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
PtprgQ05909 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PtprgQ05909 Chodl-203ENSMUST00000114216 1550 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PtprgQ05909 Slfn2-201ENSMUST00000038038 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PtprgQ05909 4931406C07Rik-208ENSMUST00000216955 1750 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PtprgQ05909 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
PtprgQ05909 Oprm1-202ENSMUST00000052751 1334 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PtprgQ05909 Oprm1-207ENSMUST00000092731 1332 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PtprgQ05909 Cmpk1-201ENSMUST00000030491 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PtprgQ05909 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PtprgQ05909 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PtprgQ05909 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PtprgQ05909 Nol4-208ENSMUST00000164893 2175 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
PtprgQ05909 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
PtprgQ05909 Scrn3-202ENSMUST00000112050 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
PtprgQ05909 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
PtprgQ05909 Krt17-201ENSMUST00000080893 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
PtprgQ05909 Casc4-203ENSMUST00000089915 3475 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
PtprgQ05909 Chchd10-203ENSMUST00000219839 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
PtprgQ05909 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
PtprgQ05909 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
PtprgQ05909 Tmem254b-202ENSMUST00000100806 1108 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
PtprgQ05909 Tmem254a-201ENSMUST00000100811 1108 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
PtprgQ05909 Toe1-202ENSMUST00000106455 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
PtprgQ05909 Timm10-202ENSMUST00000111631 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
PtprgQ05909 Gm14723-201ENSMUST00000118686 215 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
PtprgQ05909 Pcp2-206ENSMUST00000144977 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
PtprgQ05909 Gm6222-202ENSMUST00000182143 629 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
PtprgQ05909 Majin-201ENSMUST00000025699 1239 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
PtprgQ05909 Sh2b1-204ENSMUST00000205497 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
PtprgQ05909 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
PtprgQ05909 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
PtprgQ05909 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
PtprgQ05909 Prss8-202ENSMUST00000206124 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
PtprgQ05909 Klhl12-203ENSMUST00000116528 3277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
PtprgQ05909 Dmkn-205ENSMUST00000165887 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
PtprgQ05909 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
PtprgQ05909 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
PtprgQ05909 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
PtprgQ05909 Gm11992-201ENSMUST00000043285 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
PtprgQ05909 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
PtprgQ05909 Rbm34-201ENSMUST00000045994 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
PtprgQ05909 Ddo-203ENSMUST00000213503 1759 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
PtprgQ05909 Dnmt3l-208ENSMUST00000151242 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
PtprgQ05909 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
PtprgQ05909 Entpd2-201ENSMUST00000028328 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
PtprgQ05909 Bcs1l-203ENSMUST00000113733 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
PtprgQ05909 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
PtprgQ05909 1810058I24Rik-203ENSMUST00000152147 2521 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PtprgQ05909 Gm14209-201ENSMUST00000154946 462 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
PtprgQ05909 Mir3102-201ENSMUST00000175555 104 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
PtprgQ05909 Gm37008-201ENSMUST00000195712 319 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
PtprgQ05909 Men1-208ENSMUST00000113504 2663 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PtprgQ05909 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PtprgQ05909 Ppp1r15a-202ENSMUST00000167273 2809 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.8 ms