Protein–RNA interactions for Protein: Q05020

Apoc2, Apolipoprotein C-II, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apoc2Q05020 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Apoc2Q05020 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Apoc2Q05020 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Apoc2Q05020 Epb41l2-201ENSMUST00000053748 4385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Apoc2Q05020 Nfasc-207ENSMUST00000187861 4927 ntTSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Apoc2Q05020 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Apoc2Q05020 Hnrnpa1-201ENSMUST00000036004 1918 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Apoc2Q05020 Lca5-202ENSMUST00000034793 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Apoc2Q05020 Ankrd42-202ENSMUST00000118157 2782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Apoc2Q05020 Dhtkd1-202ENSMUST00000095147 5480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Apoc2Q05020 Ano6-201ENSMUST00000071874 4927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Apoc2Q05020 Gm28729-201ENSMUST00000190704 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Apoc2Q05020 Sdha-201ENSMUST00000022062 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Apoc2Q05020 Pla2g4c-204ENSMUST00000167232 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Apoc2Q05020 Pdcd6ip-202ENSMUST00000111861 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Apoc2Q05020 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Apoc2Q05020 Zfhx2os-202ENSMUST00000183750 4375 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Apoc2Q05020 Gpr132-201ENSMUST00000021729 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Apoc2Q05020 Alx1-201ENSMUST00000040859 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Apoc2Q05020 Tsku-205ENSMUST00000167405 2597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Apoc2Q05020 Rnase10-201ENSMUST00000022424 1629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Apoc2Q05020 Ncor2-205ENSMUST00000111398 8808 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Apoc2Q05020 Mypn-202ENSMUST00000218978 1833 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Apoc2Q05020 4931440F15Rik-201ENSMUST00000104962 3274 ntAPPRIS P1 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Apoc2Q05020 Ak4-201ENSMUST00000102780 4186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Apoc2Q05020 Minos1-203ENSMUST00000143971 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Apoc2Q05020 Csrnp1-201ENSMUST00000035101 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Apoc2Q05020 Brinp1-201ENSMUST00000030036 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Apoc2Q05020 Crybb2-202ENSMUST00000112336 906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Apoc2Q05020 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
Apoc2Q05020 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
Apoc2Q05020 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
Apoc2Q05020 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Apoc2Q05020 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Apoc2Q05020 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Apoc2Q05020 Gm40493-201ENSMUST00000210223 400 ntTSL 3 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Apoc2Q05020 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Apoc2Q05020 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Apoc2Q05020 Nob1-201ENSMUST00000003946 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Apoc2Q05020 Cplx4-201ENSMUST00000025397 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Apoc2Q05020 Grik2-210ENSMUST00000220263 2085 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Apoc2Q05020 Adal-204ENSMUST00000110665 2356 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Apoc2Q05020 Rab10os-202ENSMUST00000177896 2872 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Apoc2Q05020 Fam43a-201ENSMUST00000059078 3075 ntAPPRIS P1 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Apoc2Q05020 B230206H07Rik-202ENSMUST00000134845 3269 ntTSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Apoc2Q05020 Phf21b-201ENSMUST00000016768 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Apoc2Q05020 Trpm4-209ENSMUST00000211743 3673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Apoc2Q05020 Fbln1-201ENSMUST00000057410 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Apoc2Q05020 Il7-205ENSMUST00000194279 4858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Apoc2Q05020 Glis2-201ENSMUST00000014447 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Apoc2Q05020 Osbpl9-202ENSMUST00000084366 3134 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Apoc2Q05020 Dysf-201ENSMUST00000081904 6660 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Apoc2Q05020 Chst4-202ENSMUST00000211894 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Apoc2Q05020 Dda1-206ENSMUST00000138892 1738 ntTSL 3 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Apoc2Q05020 Esyt3-201ENSMUST00000042158 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Apoc2Q05020 Fam49b-201ENSMUST00000063838 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Apoc2Q05020 Espn-213ENSMUST00000105659 3595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Apoc2Q05020 Zfp853-202ENSMUST00000212355 2871 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Apoc2Q05020 Rinl-201ENSMUST00000059857 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Apoc2Q05020 Arrdc4-201ENSMUST00000048068 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Apoc2Q05020 Rpl21-201ENSMUST00000035983 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Apoc2Q05020 Mlxip-201ENSMUST00000068237 7303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Apoc2Q05020 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
Apoc2Q05020 Ugt1a5-201ENSMUST00000097659 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Apoc2Q05020 Vrtn-202ENSMUST00000166772 3098 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Apoc2Q05020 Nfkb2-201ENSMUST00000073116 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Apoc2Q05020 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Apoc2Q05020 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
Apoc2Q05020 Atcayos-202ENSMUST00000129950 1117 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Apoc2Q05020 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Apoc2Q05020 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
Apoc2Q05020 Ins2-209ENSMUST00000210288 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Apoc2Q05020 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Apoc2Q05020 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
Apoc2Q05020 Gm45638-201ENSMUST00000211507 2878 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
Apoc2Q05020 2900005J15Rik-202ENSMUST00000171190 2025 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
Apoc2Q05020 Epb41-203ENSMUST00000084253 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Apoc2Q05020 Ciart-202ENSMUST00000159739 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Apoc2Q05020 Gm28386-201ENSMUST00000189147 1849 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
Apoc2Q05020 Rxrg-204ENSMUST00000111386 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Apoc2Q05020 Rtn3-203ENSMUST00000088169 1709 ntTSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Apoc2Q05020 Plcd3-201ENSMUST00000103077 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Apoc2Q05020 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Apoc2Q05020 Noto-201ENSMUST00000089578 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Apoc2Q05020 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
Apoc2Q05020 Pax6-202ENSMUST00000090397 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Apoc2Q05020 Traf6-201ENSMUST00000004949 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Apoc2Q05020 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Apoc2Q05020 Clcn6-201ENSMUST00000030879 3306 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Apoc2Q05020 Mdga1-201ENSMUST00000073556 7566 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Apoc2Q05020 Mks1-201ENSMUST00000038196 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Apoc2Q05020 Tcf12-201ENSMUST00000034755 4621 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Apoc2Q05020 Gstcd-202ENSMUST00000080583 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Apoc2Q05020 Hnrnpf-210ENSMUST00000180341 1922 ntAPPRIS P1 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Apoc2Q05020 Entpd2-201ENSMUST00000028328 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Apoc2Q05020 Mcm8-201ENSMUST00000028831 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Apoc2Q05020 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Apoc2Q05020 Dab2ip-206ENSMUST00000112987 6287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Apoc2Q05020 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Apoc2Q05020 Mpl-203ENSMUST00000106375 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.5 ms