Protein–RNA interactions for Protein: Q03717

Kcnb1, Potassium voltage-gated channel subfamily B member 1, mousemouse

Predictions only

Length 857 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnb1Q03717 Adat1-203ENSMUST00000139820 2762 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Kcnb1Q03717 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Kcnb1Q03717 Stau2-215ENSMUST00000162435 2735 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Kcnb1Q03717 Gm15393-201ENSMUST00000120499 219 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Kcnb1Q03717 A930015D03Rik-201ENSMUST00000173900 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Kcnb1Q03717 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Kcnb1Q03717 Gm10766-202ENSMUST00000194123 606 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Kcnb1Q03717 4930502C17Rik-201ENSMUST00000200282 948 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Kcnb1Q03717 Tmem129-204ENSMUST00000200849 657 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Kcnb1Q03717 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Kcnb1Q03717 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Kcnb1Q03717 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Kcnb1Q03717 Mcoln2-201ENSMUST00000011152 2520 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Kcnb1Q03717 Usp1-202ENSMUST00000091358 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Kcnb1Q03717 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Kcnb1Q03717 Ank-201ENSMUST00000022875 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Kcnb1Q03717 Fbxo10-201ENSMUST00000052236 4635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Kcnb1Q03717 Gucy1a2-201ENSMUST00000115733 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Kcnb1Q03717 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Kcnb1Q03717 Rnpepl1-201ENSMUST00000027487 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Kcnb1Q03717 Adad1-203ENSMUST00000144629 3101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Kcnb1Q03717 Rbm47-201ENSMUST00000094756 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Kcnb1Q03717 Tcirg1-211ENSMUST00000145791 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Kcnb1Q03717 Galnt6-203ENSMUST00000161514 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Kcnb1Q03717 Rasl10b-203ENSMUST00000164425 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Kcnb1Q03717 E130317F20Rik-202ENSMUST00000217802 3420 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Kcnb1Q03717 Gpc2-201ENSMUST00000014089 2514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Kcnb1Q03717 Gm13589-201ENSMUST00000146404 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Kcnb1Q03717 Ccdc157-201ENSMUST00000093381 5015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Kcnb1Q03717 Trim52-201ENSMUST00000022708 3075 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Kcnb1Q03717 Gm5320-201ENSMUST00000207163 1519 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Kcnb1Q03717 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Kcnb1Q03717 Mark2-201ENSMUST00000025921 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Kcnb1Q03717 Alg10b-201ENSMUST00000100309 3727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Kcnb1Q03717 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Kcnb1Q03717 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Kcnb1Q03717 Iws1-206ENSMUST00000212675 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Kcnb1Q03717 Sh2b3-202ENSMUST00000086310 4195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Kcnb1Q03717 Dnmt3b-204ENSMUST00000088976 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Kcnb1Q03717 Ptp4a2-207ENSMUST00000165853 3382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Kcnb1Q03717 4933434M16Rik-202ENSMUST00000153429 1940 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Kcnb1Q03717 Ankrd50-201ENSMUST00000094300 1944 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Kcnb1Q03717 Gnb2-215ENSMUST00000170293 993 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Kcnb1Q03717 Gm22175-201ENSMUST00000175007 78 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Kcnb1Q03717 Gm29585-201ENSMUST00000185270 514 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Kcnb1Q03717 Gm44344-201ENSMUST00000200287 129 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Kcnb1Q03717 Gm43703-201ENSMUST00000200523 763 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Kcnb1Q03717 Rtl8c-201ENSMUST00000063384 401 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Kcnb1Q03717 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Kcnb1Q03717 Krtap6-5-201ENSMUST00000074637 600 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Kcnb1Q03717 Olfr554-201ENSMUST00000098221 954 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Kcnb1Q03717 Mrgprh-201ENSMUST00000075296 1809 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Kcnb1Q03717 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Kcnb1Q03717 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Kcnb1Q03717 Gas2l3-207ENSMUST00000220128 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Kcnb1Q03717 AC139054.1-201ENSMUST00000226898 1598 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Kcnb1Q03717 Ptx4-201ENSMUST00000054930 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Kcnb1Q03717 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Kcnb1Q03717 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Kcnb1Q03717 Olfml2a-201ENSMUST00000057279 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Kcnb1Q03717 Arl6ip6-201ENSMUST00000028336 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Kcnb1Q03717 Rnf10-203ENSMUST00000112097 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Kcnb1Q03717 I730028E13Rik-201ENSMUST00000216012 1959 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Kcnb1Q03717 Syce1-201ENSMUST00000026553 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Kcnb1Q03717 Desi1-206ENSMUST00000152227 2934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Kcnb1Q03717 Fam219a-202ENSMUST00000108050 3321 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Kcnb1Q03717 Ulk3-201ENSMUST00000053230 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Kcnb1Q03717 4632404H12Rik-201ENSMUST00000038450 2791 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Kcnb1Q03717 AC168058.1-201ENSMUST00000219521 2282 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Kcnb1Q03717 AC154262.2-201ENSMUST00000224310 2293 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Kcnb1Q03717 Mospd3-202ENSMUST00000111007 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Kcnb1Q03717 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Kcnb1Q03717 Ggt7-201ENSMUST00000029131 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Kcnb1Q03717 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Kcnb1Q03717 Tesmin-202ENSMUST00000127142 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Kcnb1Q03717 Dhrs3-202ENSMUST00000105744 1226 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Kcnb1Q03717 Gm12585-201ENSMUST00000117307 290 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Kcnb1Q03717 Gm11557-201ENSMUST00000120200 1008 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Kcnb1Q03717 Gm13385-201ENSMUST00000121089 220 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Kcnb1Q03717 Igfbp4-204ENSMUST00000140772 742 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Kcnb1Q03717 Baiap2l2-205ENSMUST00000170955 1058 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Kcnb1Q03717 Gm3436-201ENSMUST00000179930 840 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Kcnb1Q03717 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Kcnb1Q03717 Gm8927-201ENSMUST00000181978 981 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Kcnb1Q03717 Gm38197-201ENSMUST00000192320 2122 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Kcnb1Q03717 4930432H08Rik-201ENSMUST00000198220 1284 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Kcnb1Q03717 5430431A17Rik-201ENSMUST00000206342 795 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Kcnb1Q03717 Cela1-201ENSMUST00000023775 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Kcnb1Q03717 Nanos3-201ENSMUST00000070102 730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Kcnb1Q03717 Gm3222-201ENSMUST00000071282 990 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Kcnb1Q03717 Slc6a7-201ENSMUST00000025520 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Kcnb1Q03717 Stpg2-202ENSMUST00000106239 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Kcnb1Q03717 Gdap1l1-202ENSMUST00000109420 2475 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Kcnb1Q03717 Mob3c-201ENSMUST00000030477 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Kcnb1Q03717 Mvk-202ENSMUST00000112239 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Kcnb1Q03717 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Kcnb1Q03717 Fstl5-201ENSMUST00000038364 5107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Kcnb1Q03717 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Kcnb1Q03717 Frzb-201ENSMUST00000028389 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Kcnb1Q03717 Gm14371-201ENSMUST00000138925 1518 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.8 ms