Protein–RNA interactions for Protein: Q02650

Pax5, Paired box protein Pax-5, mousemouse

Predictions only

Length 391 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pax5Q02650 Nfe2-205ENSMUST00000133600 1605 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Pax5Q02650 Endou-201ENSMUST00000023105 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Pax5Q02650 Opa1-201ENSMUST00000038867 3230 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Pax5Q02650 Kcnq2-202ENSMUST00000049792 2920 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Pax5Q02650 N4bp3-201ENSMUST00000001080 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Pax5Q02650 Rnf152-202ENSMUST00000172299 8406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Pax5Q02650 Kcnk13-204ENSMUST00000177549 3075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Pax5Q02650 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Pax5Q02650 Orai3-202ENSMUST00000118865 768 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Pax5Q02650 Cmc2-202ENSMUST00000128304 394 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Pax5Q02650 3110053B16Rik-204ENSMUST00000145605 575 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Pax5Q02650 Gm24158-201ENSMUST00000175263 71 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Pax5Q02650 Gm38182-203ENSMUST00000192984 993 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Pax5Q02650 Pcdhgc5-204ENSMUST00000193941 593 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Pax5Q02650 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Pax5Q02650 Mpv17-203ENSMUST00000200833 1171 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Pax5Q02650 Gm5312-201ENSMUST00000203728 547 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Pax5Q02650 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Pax5Q02650 AC151828.1-201ENSMUST00000219552 661 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Pax5Q02650 Gm16476-201ENSMUST00000221544 139 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Pax5Q02650 AC149588.3-201ENSMUST00000227515 150 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Pax5Q02650 AC156016.3-201ENSMUST00000228623 344 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Pax5Q02650 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Pax5Q02650 Bccip-201ENSMUST00000033282 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Pax5Q02650 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Pax5Q02650 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Pax5Q02650 BC003331-205ENSMUST00000111913 3273 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Pax5Q02650 Gm28182-201ENSMUST00000188354 2477 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Pax5Q02650 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Pax5Q02650 Pbx2-203ENSMUST00000173328 1990 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Pax5Q02650 Gm28729-201ENSMUST00000190704 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Pax5Q02650 Jaml-204ENSMUST00000215880 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Pax5Q02650 Gm40765-201ENSMUST00000218612 1469 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Pax5Q02650 Fam53b-201ENSMUST00000065371 5052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Pax5Q02650 B230319C09Rik-201ENSMUST00000063376 1689 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Pax5Q02650 Rab11fip2-201ENSMUST00000051996 4482 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Pax5Q02650 Gm9347-201ENSMUST00000211473 1607 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Pax5Q02650 Mypn-202ENSMUST00000218978 1833 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Pax5Q02650 Trim15-201ENSMUST00000025329 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Pax5Q02650 Edc4-201ENSMUST00000040254 4780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Pax5Q02650 Rad9a-201ENSMUST00000025740 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Pax5Q02650 Gk5-202ENSMUST00000122383 4455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Pax5Q02650 Eif5b-201ENSMUST00000027252 7797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Pax5Q02650 Jade1-204ENSMUST00000170711 2896 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Pax5Q02650 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Pax5Q02650 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Pax5Q02650 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Pax5Q02650 Cobl-208ENSMUST00000172919 2566 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Pax5Q02650 Zfp444-204ENSMUST00000108567 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Pax5Q02650 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Pax5Q02650 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Pax5Q02650 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Pax5Q02650 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Pax5Q02650 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Pax5Q02650 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Pax5Q02650 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Pax5Q02650 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Pax5Q02650 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Pax5Q02650 AC140397.2-201ENSMUST00000224213 834 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Pax5Q02650 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Pax5Q02650 Ndufc2-201ENSMUST00000032882 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Pax5Q02650 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Pax5Q02650 Elk3-201ENSMUST00000008542 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Pax5Q02650 Gm42769-201ENSMUST00000198576 1659 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Pax5Q02650 Eif3j1-201ENSMUST00000028668 5413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Pax5Q02650 Snx29-207ENSMUST00000180792 2667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Pax5Q02650 Klhl12-203ENSMUST00000116528 3277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Pax5Q02650 Dap3-207ENSMUST00000173135 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Pax5Q02650 Tmem181b-ps-203ENSMUST00000188746 1626 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Pax5Q02650 Shank2-203ENSMUST00000105902 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Pax5Q02650 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Pax5Q02650 Prpf3-201ENSMUST00000015892 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Pax5Q02650 D230025D16Rik-201ENSMUST00000034361 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Pax5Q02650 Cacnb4-206ENSMUST00000178799 7981 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Pax5Q02650 Kctd14-206ENSMUST00000206658 2339 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Pax5Q02650 Olfr533-203ENSMUST00000215308 2345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Pax5Q02650 Slc39a2-201ENSMUST00000047726 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Pax5Q02650 Pef1-202ENSMUST00000118199 1915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Pax5Q02650 Il15-201ENSMUST00000034148 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Pax5Q02650 Zfp57-201ENSMUST00000069250 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Pax5Q02650 Cdsn-201ENSMUST00000044804 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Pax5Q02650 Clcnkb-202ENSMUST00000105788 2490 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Pax5Q02650 Ankrd6-202ENSMUST00000084748 4354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Pax5Q02650 Sde2-201ENSMUST00000038091 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Pax5Q02650 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Pax5Q02650 Spock3-201ENSMUST00000093480 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Pax5Q02650 1600002D24Rik-202ENSMUST00000136744 1854 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Pax5Q02650 Gtf2i-206ENSMUST00000172715 4114 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Pax5Q02650 Slfn2-201ENSMUST00000038038 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Pax5Q02650 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Pax5Q02650 Armc8-201ENSMUST00000035043 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Pax5Q02650 F2r-201ENSMUST00000059193 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Pax5Q02650 Amdhd2-201ENSMUST00000040735 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Pax5Q02650 Unc5b-203ENSMUST00000218637 3653 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Pax5Q02650 Iqsec3-203ENSMUST00000151397 8067 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Pax5Q02650 Klhl32-204ENSMUST00000108218 7143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Pax5Q02650 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Pax5Q02650 Gm15653-201ENSMUST00000119247 907 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Pax5Q02650 Gm12428-201ENSMUST00000119844 727 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Pax5Q02650 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.9 ms