Protein–RNA interactions for Protein: Q01279

Egfr, Epidermal growth factor receptor, mousemouse

Predictions only

Length 1,210 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EgfrQ01279 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
EgfrQ01279 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
EgfrQ01279 R3hcc1-202ENSMUST00000121142 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
EgfrQ01279 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
EgfrQ01279 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
EgfrQ01279 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
EgfrQ01279 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
EgfrQ01279 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
EgfrQ01279 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
EgfrQ01279 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
EgfrQ01279 Cfp-201ENSMUST00000001156 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
EgfrQ01279 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
EgfrQ01279 Riox2-203ENSMUST00000120674 1753 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
EgfrQ01279 Cd63-202ENSMUST00000105229 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
EgfrQ01279 Gm27017-201ENSMUST00000183031 656 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
EgfrQ01279 Mir6979-201ENSMUST00000183927 56 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
EgfrQ01279 Cd63-204ENSMUST00000219317 1109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
EgfrQ01279 Timm9-203ENSMUST00000220482 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
EgfrQ01279 Rpl10a-201ENSMUST00000042334 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
EgfrQ01279 Rnf7-201ENSMUST00000057500 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
EgfrQ01279 Rn7sk-201ENSMUST00000083103 331 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
EgfrQ01279 Gm26315-201ENSMUST00000083890 321 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
EgfrQ01279 Aurkc-201ENSMUST00000086248 1154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
EgfrQ01279 Hdac10-202ENSMUST00000109347 1824 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
EgfrQ01279 Dlx5-202ENSMUST00000142635 1324 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
EgfrQ01279 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
EgfrQ01279 Hsd3b3-203ENSMUST00000107018 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
EgfrQ01279 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
EgfrQ01279 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
EgfrQ01279 Krt35-201ENSMUST00000103127 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
EgfrQ01279 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
EgfrQ01279 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
EgfrQ01279 AC121801.1-201ENSMUST00000225363 1899 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
EgfrQ01279 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
EgfrQ01279 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
EgfrQ01279 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
EgfrQ01279 Gm2606-201ENSMUST00000100754 1002 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
EgfrQ01279 Rasgrp2-207ENSMUST00000113475 573 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
EgfrQ01279 Rps10-203ENSMUST00000114882 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
EgfrQ01279 Gm12537-201ENSMUST00000119266 1002 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
EgfrQ01279 Gm12070-201ENSMUST00000119551 1002 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
EgfrQ01279 Gm12671-201ENSMUST00000119978 1002 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
EgfrQ01279 Gm13292-201ENSMUST00000120014 1000 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
EgfrQ01279 Gm11591-201ENSMUST00000120063 702 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
EgfrQ01279 Polr3c-202ENSMUST00000125183 923 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
EgfrQ01279 B9d1os-201ENSMUST00000137010 674 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
EgfrQ01279 Gm20482-202ENSMUST00000174729 825 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
EgfrQ01279 Gm10359-201ENSMUST00000180167 1002 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
EgfrQ01279 Gm12033-201ENSMUST00000180654 1002 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
EgfrQ01279 Gm5559-201ENSMUST00000180755 1002 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
EgfrQ01279 Pced1c-ps-201ENSMUST00000187740 751 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
EgfrQ01279 Ak6-205ENSMUST00000190729 1184 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
EgfrQ01279 Hax1-207ENSMUST00000198782 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
EgfrQ01279 Mymx-204ENSMUST00000208801 437 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
EgfrQ01279 Gm7293-201ENSMUST00000216682 1007 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
EgfrQ01279 Gm7046-201ENSMUST00000221351 977 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
EgfrQ01279 CT030182.1-201ENSMUST00000225935 533 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
EgfrQ01279 BC049730-201ENSMUST00000051714 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
EgfrQ01279 Gm648-201ENSMUST00000081133 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
EgfrQ01279 Usmg5-201ENSMUST00000096014 341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
EgfrQ01279 Foxo6os-201ENSMUST00000152384 2291 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
EgfrQ01279 Skp1a-201ENSMUST00000037324 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
EgfrQ01279 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
EgfrQ01279 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
EgfrQ01279 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
EgfrQ01279 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
EgfrQ01279 Lrp2bp-202ENSMUST00000110380 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
EgfrQ01279 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
EgfrQ01279 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
EgfrQ01279 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
EgfrQ01279 Cyb561d1-202ENSMUST00000106654 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
EgfrQ01279 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
EgfrQ01279 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
EgfrQ01279 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
EgfrQ01279 Gm25668-201ENSMUST00000157700 129 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
EgfrQ01279 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
EgfrQ01279 AC122371.3-201ENSMUST00000223402 1061 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
EgfrQ01279 Lsm7-201ENSMUST00000035775 468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
EgfrQ01279 Car5a-201ENSMUST00000057653 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
EgfrQ01279 Nmral1-201ENSMUST00000074970 1155 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
EgfrQ01279 Sh2d7-202ENSMUST00000118413 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
EgfrQ01279 Gm43579-201ENSMUST00000202387 1307 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
EgfrQ01279 Gm9755-201ENSMUST00000032981 1356 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
EgfrQ01279 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
EgfrQ01279 Pdlim3-201ENSMUST00000034053 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
EgfrQ01279 Ppt2-209ENSMUST00000171121 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
EgfrQ01279 Tex19.1-201ENSMUST00000039088 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
EgfrQ01279 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
EgfrQ01279 Hipk4-202ENSMUST00000108353 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
EgfrQ01279 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
EgfrQ01279 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
EgfrQ01279 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
EgfrQ01279 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
EgfrQ01279 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
EgfrQ01279 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
EgfrQ01279 Alkbh4-201ENSMUST00000041100 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
EgfrQ01279 Rab3a-203ENSMUST00000110092 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
EgfrQ01279 Mir698-201ENSMUST00000102164 109 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
EgfrQ01279 Wsb2-ps-201ENSMUST00000117937 1217 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
EgfrQ01279 Gm13165-201ENSMUST00000152923 383 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.5 ms