Protein–RNA interactions for Protein: Q01231

Gja5, Gap junction alpha-5 protein, mousemouse

Predictions only

Length 358 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gja5Q01231 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gja5Q01231 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gja5Q01231 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gja5Q01231 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gja5Q01231 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gja5Q01231 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gja5Q01231 Cox4i2-201ENSMUST00000010020 727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gja5Q01231 Rbm3-204ENSMUST00000115617 1152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gja5Q01231 Gm12363-201ENSMUST00000122250 668 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Gja5Q01231 Tnni1-205ENSMUST00000148201 1150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gja5Q01231 Tnni1-206ENSMUST00000152075 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gja5Q01231 Tnni1-207ENSMUST00000152208 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gja5Q01231 2010320M18Rik-201ENSMUST00000191396 1009 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Gja5Q01231 Gm43714-201ENSMUST00000198351 1204 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gja5Q01231 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gja5Q01231 1110008P14Rik-202ENSMUST00000146423 2618 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gja5Q01231 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gja5Q01231 Tlk2-209ENSMUST00000145048 2776 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gja5Q01231 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gja5Q01231 Wwox-203ENSMUST00000109108 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gja5Q01231 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gja5Q01231 Lrp1-202ENSMUST00000118455 2097 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gja5Q01231 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gja5Q01231 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gja5Q01231 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gja5Q01231 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gja5Q01231 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gja5Q01231 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gja5Q01231 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gja5Q01231 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gja5Q01231 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gja5Q01231 Aldh3b1-201ENSMUST00000051803 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gja5Q01231 Mff-201ENSMUST00000073025 1706 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gja5Q01231 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gja5Q01231 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gja5Q01231 Gm6015-201ENSMUST00000217493 1586 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Gja5Q01231 1810043G02Rik-202ENSMUST00000105398 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gja5Q01231 A430005L14Rik-202ENSMUST00000105645 977 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gja5Q01231 Upk3bl-202ENSMUST00000111137 1119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gja5Q01231 Gm16479-201ENSMUST00000121706 932 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Gja5Q01231 F630206G17Rik-201ENSMUST00000137002 685 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gja5Q01231 Gm27246-201ENSMUST00000183611 1240 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gja5Q01231 Gm29585-203ENSMUST00000188089 835 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gja5Q01231 Gm44069-201ENSMUST00000204898 506 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Gja5Q01231 Gm45186-201ENSMUST00000206874 478 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Gja5Q01231 Saa2-203ENSMUST00000210769 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gja5Q01231 AC139319.1-201ENSMUST00000223331 690 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gja5Q01231 Morn2-202ENSMUST00000227729 656 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Gja5Q01231 H2-M10.2-201ENSMUST00000023845 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gja5Q01231 Prorsd1-201ENSMUST00000039900 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gja5Q01231 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gja5Q01231 Saa3-201ENSMUST00000006956 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gja5Q01231 Saa2-201ENSMUST00000075982 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gja5Q01231 Cdc26-201ENSMUST00000084525 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gja5Q01231 Mtus2-202ENSMUST00000085554 1009 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gja5Q01231 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gja5Q01231 Gm38102-201ENSMUST00000192791 1935 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Gja5Q01231 Tle3-210ENSMUST00000161207 2592 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gja5Q01231 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gja5Q01231 4931406C07Rik-208ENSMUST00000216955 1750 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gja5Q01231 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gja5Q01231 Cpped1-203ENSMUST00000121750 2614 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gja5Q01231 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gja5Q01231 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gja5Q01231 Plekhb1-203ENSMUST00000107044 1806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gja5Q01231 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gja5Q01231 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gja5Q01231 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gja5Q01231 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gja5Q01231 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gja5Q01231 B230209E15Rik-201ENSMUST00000209115 1597 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gja5Q01231 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gja5Q01231 Ppp2r5c-204ENSMUST00000221074 1971 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gja5Q01231 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gja5Q01231 Tnfrsf18-203ENSMUST00000122001 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gja5Q01231 Gm2231-201ENSMUST00000125661 612 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Gja5Q01231 G630018N14Rik-201ENSMUST00000135656 1231 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gja5Q01231 Gm8584-201ENSMUST00000171982 758 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Gja5Q01231 Gm29019-202ENSMUST00000188623 564 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gja5Q01231 Gm43303-201ENSMUST00000200133 669 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gja5Q01231 Pcbd1-201ENSMUST00000020298 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gja5Q01231 Tmem108-206ENSMUST00000215136 724 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gja5Q01231 Nsd1-205ENSMUST00000224693 852 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Gja5Q01231 Lrrc52-201ENSMUST00000036643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gja5Q01231 Nmral1-201ENSMUST00000074970 1155 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gja5Q01231 Eef1d-203ENSMUST00000089680 973 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gja5Q01231 Rpl30-201ENSMUST00000009039 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gja5Q01231 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gja5Q01231 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gja5Q01231 Gm2237-202ENSMUST00000170694 2090 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gja5Q01231 Gm43423-201ENSMUST00000198390 2094 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Gja5Q01231 Gm5106-201ENSMUST00000181058 1334 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gja5Q01231 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gja5Q01231 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gja5Q01231 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gja5Q01231 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gja5Q01231 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gja5Q01231 Acp5-203ENSMUST00000165735 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gja5Q01231 Hck-204ENSMUST00000191431 1575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gja5Q01231 Gm18244-201ENSMUST00000219747 1566 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.2 ms