Protein–RNA interactions for Protein: P97769

Cited1, Cbp/p300-interacting transactivator 1, mousemouse

Predictions only

Length 203 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cited1P97769 Zmym1-202ENSMUST00000106099 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Cited1P97769 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Cited1P97769 Zbed4-201ENSMUST00000041297 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Cited1P97769 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Cited1P97769 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Cited1P97769 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Cited1P97769 Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Cited1P97769 Tnfaip8l3-201ENSMUST00000098760 4403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Cited1P97769 Arhgef2-207ENSMUST00000175903 3356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Cited1P97769 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Cited1P97769 Plin4-201ENSMUST00000002908 5755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Cited1P97769 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Cited1P97769 Atg2b-201ENSMUST00000041055 7546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Cited1P97769 Dnaic2-201ENSMUST00000069325 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Cited1P97769 Lgr5-201ENSMUST00000020350 4714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Cited1P97769 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Cited1P97769 Pgm3-201ENSMUST00000070064 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Cited1P97769 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Cited1P97769 Pxdn-202ENSMUST00000122328 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Cited1P97769 Dpysl5-201ENSMUST00000088081 5022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Cited1P97769 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Cited1P97769 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Cited1P97769 E430024P14Rik-203ENSMUST00000160545 2833 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Cited1P97769 Mettl27-201ENSMUST00000047196 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Cited1P97769 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Cited1P97769 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Cited1P97769 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Cited1P97769 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Cited1P97769 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Cited1P97769 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Cited1P97769 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Cited1P97769 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Cited1P97769 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Cited1P97769 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Cited1P97769 Cnih4-204ENSMUST00000134115 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Cited1P97769 Edil3-203ENSMUST00000118731 2721 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Cited1P97769 Selenbp1-201ENSMUST00000090839 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Cited1P97769 Selenbp2-201ENSMUST00000090848 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Cited1P97769 Trim26-201ENSMUST00000053434 3198 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Cited1P97769 Fam19a4-201ENSMUST00000089295 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Cited1P97769 Vps4b-202ENSMUST00000112736 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Cited1P97769 AC169511.2-201ENSMUST00000226674 2063 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Cited1P97769 Misp-201ENSMUST00000046833 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Cited1P97769 Slc30a8-201ENSMUST00000037240 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Cited1P97769 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Cited1P97769 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Cited1P97769 Phgdh-201ENSMUST00000065793 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Cited1P97769 Ltbp4-203ENSMUST00000118583 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Cited1P97769 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Cited1P97769 Gm26684-202ENSMUST00000228229 8257 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Cited1P97769 Fktn-204ENSMUST00000221657 6241 ntTSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Cited1P97769 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Cited1P97769 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Cited1P97769 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Cited1P97769 Gpr161-201ENSMUST00000111450 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Cited1P97769 Rbm39-201ENSMUST00000029149 2711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Cited1P97769 Tmem246-201ENSMUST00000042750 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Cited1P97769 Sdr9c7-201ENSMUST00000047134 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Cited1P97769 Pnkd-202ENSMUST00000087225 2859 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Cited1P97769 Epb41l5-208ENSMUST00000191046 6870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Cited1P97769 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Cited1P97769 Ehbp1l1-201ENSMUST00000049295 6404 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Cited1P97769 Gm26616-202ENSMUST00000195676 3107 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Cited1P97769 Usp44-202ENSMUST00000216224 2449 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Cited1P97769 Bmp4-201ENSMUST00000074077 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Cited1P97769 Keap1-202ENSMUST00000164812 3614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Cited1P97769 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Cited1P97769 Poldip3-201ENSMUST00000058793 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Cited1P97769 Tars2-202ENSMUST00000074339 2313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Cited1P97769 Fgfr3-211ENSMUST00000171509 4020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Cited1P97769 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Cited1P97769 Eif4g1-217ENSMUST00000143939 5114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Cited1P97769 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Cited1P97769 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Cited1P97769 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Cited1P97769 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Cited1P97769 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Cited1P97769 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Cited1P97769 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Cited1P97769 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Cited1P97769 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Cited1P97769 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Cited1P97769 Slc9a1-201ENSMUST00000030669 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Cited1P97769 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Cited1P97769 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Cited1P97769 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Cited1P97769 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Cited1P97769 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Cited1P97769 Kirrel2-201ENSMUST00000045817 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Cited1P97769 Gbf1-201ENSMUST00000026254 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Cited1P97769 Wdr36-201ENSMUST00000053663 3281 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Cited1P97769 Ankrd34b-201ENSMUST00000061594 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Cited1P97769 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Cited1P97769 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Cited1P97769 Adck1-202ENSMUST00000166940 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Cited1P97769 Mirg-208ENSMUST00000182499 3187 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Cited1P97769 Zfp583-201ENSMUST00000062765 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Cited1P97769 Gm12766-201ENSMUST00000140298 1823 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Cited1P97769 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Cited1P97769 Inhba-201ENSMUST00000042603 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.4 ms